Primer curso taller regional de Bioinformática, Yucatan

La Red Nacional de Bioinformática tiene el agrado de invitar al

“Primer curso taller regional de Bioinformática”,

fecha:

• 22 al 26 de Junio, 2009

lugar:

• Universidad Anáhuac del Mayab,
• Carretera Mérida-Progreso Km. 15.5 AP. 96 Cordemex, CP. 97310
• Mérida, Yucatán, México.

El curso será impartido por el Dr. Ernesto Perez-Rueda, Profesor de Instituto de Biotecnología de la UNAM.

Este evento esta dirigido a:
Profesionistas interesados en el área de la Bioinformatica, estudiantes de posgrado y/o Licenciaturas de carreras químico-biológicas, matemáticas y/o ciencias computacionales. El curso es teórico-practico.
El curso NO tiene costo alguno. Las inscripciones se cerraran el 18 de Junio. El cupo máximo es de 30 personas.
INSCRIPCIONES:
Enviar un mensaje antes del 15 de Junio a la dirección: bioinf.curso2009@gmail.com con el asunto ó “subject” Curso_2009, en donde se haga una solicitud expresa para asistir al curso. Se les pide enviar una breve descripción de su área de trabajo para organizar los grupos de trabajo.

Programa
Sesión 1 - lunes 22

• Introducción a las bases de datos
• Secuencias de nucleótidos: EMBL y Gene Bank
• Secuencias de aminoácidos: SWISSPROT
• Estructuras de proteínas y su clasificación: PDB, CATH, SCOP

Sesión 2 - martes 23

• Alineamientos de Secuencias
• Alineamientos en Pares: Smith-waterman, Needleman-Wunsch
• Búsqueda por similitud usando BLAST.
• Alineamiento múltiples: CLUSTAL, Tcoffee, muscle
• Las matrices de calificación: BLOSUM, PAM, y matrices basadas en clasificaciones de
• aminoácidos.

Sesión 3 - miércoles 24

• Filogenia Molecular
• Métodos basados en distancia
• Métodos basados en parsimonia
• Máximo Likelihood, Protpars, Protdist.

Sesión 4 - jueves 25

• Estructura de Proteínas y Función
• Identificación de dominios en proteínas: Superfamily, PFAM.
• Predicción de estructura secundaria: nnPredict, Predator, PHD, Psipred..
• Predicción de estructuras transmembranales.

Sesión 5 - viernes 26

• Predicción de Motivos funcionales
• Identificación de señales en el DNA y Proteínas
• Promotores, Operadores, activadores, Shine Dalgarno
• Motivos, Prosite, MEME, Wconsensus

Conferencias

1. Jueves 24 de junio, 17:00 hrs. Introducción a la computación cuántica. Dr. Salvador Venegas Andraca. Auditorio del CITI, Mérida, Yucatán.
2. Viernes 25 de junio, 17:00 hrs. Algoritmos cuánticos adiabáticos aplicados en el plegado de proteínas. Dr. Salvador Venegas Andraca. Auditorio del CITI, Mérida, Yucatán

Informes en bioinf.curso2009@gmail.com

Comité organizador

Dr. Ernesto Pérez Rueda. IBT@UNAM - eprueda@gmail.com - Instructor
Dr. Alberto Muñoz Ubando. Universidad del Mayab - luis.munoz@unimayab.edu.mx
Dra. Leticia Arena. UMDI@UNAM - arena.leticia@gmail.com
Biól. Javier Apodaca. UMDI@UNAM - javier.apodaca@gmail.com