Estancias de investigación en México

La agencia encargada de promover la ciencia en México, CONACYT, ha publicado una convocatoria para adjudicar financiamiento para estancias de investigación en dos modalidades: posdoctorales y periodos sabáticos.
La Convocatoria puede ser consultada en la pag web del CONACYT >aqui>>
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Otra convocatoria es la de la Secretaria de Relaciones Exteriores para ofrecer becas del gobierno de Mexico para extranjeros en diversas áreas inclusive Biologia Marina, Genetica y Biologia Molecular, Ecología, Recursos Naturales, Conservacion, Biodiversidad y Sistemática, Metodología de la Ciencia, Antropologia, etc. El PDF con la información completa esta >>AQUI>>

Postgrado: Master en Biodiversidad Tropical

Os anunciamos el lanzamiento del programa de Máster “Biodiversidad en Áreas Tropicales y su Conservación”. Se trata de un master oficial de un año de duración, con titulación de la Universidad Internacional Menéndez Pelayo (UIMP-Ministerio de Ciencia e Innovación de España), financiación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y qu se imparte en la Universidad Central del Ecuador (UCE). Participan profesores de 16 universidades e instituciones científicas de cinco países, y los alumnos pueden optar a becas y ayudas, cualesquiera sea su país de nacionalidad.

Las clases teóricas, seminarios, enseñanzas prácticas de laboratorio, debates y conferencias invitadas se desarrollarán en las instalaciones de la Universidad Central del Ecuador, del CLIRSEN y de las estaciones biológicas administradas por la propia UCE y por la Fundación Jatún Sacha, todo ello en uno de los países con mayor biodiversidad de todo el planeta: Ecuador.

La matrícula del programa cuesta 1300 euros ($2000 aprox.), que incluye todos los gastos del curso, incluidos los viajes internos a las reservas.

El programa permite continuar la carrera investigadora en los programas de doctorado, ya que, al ser oficial, el título está homologado a nivel europeo.

Toda la información, programa, preinscripción, precios, profesorado, becas... pueden encontrarse en la página del Máster.

Encuesta: que programa(s) usa?

Se les invita a participar en la encuesta sobre sus preferencias en el uso de programas para la reconstrucción filogenética.

Pueden elegir más de una respuesta. La lista de opciones y los resultados estarán disponibles hasta Agosto en la columna de la derecha. En la lista de opciones he incluido los programas más conocidos para tener una idea de las preferencias entre la comunidad.

Por favor, déjenme aquí sus comentarios y sugerencias. Especialmente útil sería saber cuales son los programas si alguien vota por las opciones "Otro parsimonia" u "Otro verosimilitud".

De antemano gracias por participar!
E

PD. También desde luego, puede sugerir otras encuestas!

¿que hay de comer?

Algunos organismos se alimentan de las especies de un grupo monofilético en particular, mientras que otros presentan menor sesgo filogenético. Nuestra especie parece ajustarse a la segunda categoría, lo que nos ubica cerca de los generalistas. Aunque los antropólogos conocen esto desde tiempo atrás, recientemente Proches et al 2008, decidieron probar ésto utilizando filogenias de plantas. Lo que encontraron es que nuestra dependencia de algunos taxa no es muy diferente de lo esperado al azar, posiblemente la biogeografía vegetal y no sesgos filogenéticos explican mejor nuestros patrones culinarios. Les comparto este artículo >>AQUÍ>> que aborda desde un punto de vista filogenético una de las preguntas más cotidianas ¿qué hay de comer?: Pues taxa no emparentados.

North American Workshop in Cladistic Methods, 2008

The Ohio State University, with generous financial support from the Willi Hennig Society, will conduct a workshop on phylogenetic methods in Columbus, Ohio, July 21-26, 2008. The purpose is to provide further instruction and experience to students who already have some familiarity with phylogenetic analysis. The format is a series of lectures and laboratory sessions that will give students the opportunity to gain a deeper understanding of the logic of the phylogenetic method, parsimony, maximum likelihood and Bayesian approaches, tree search strategies, measures of support, DNA alignment, morphological character coding, weighting, analysis of multiple and large data sets, consensus and character hypothesis testing.

Lecturers are expected to include

• James M. Carpenter (Growth of modern systematics, Coding morphological characters),
  
• James S. Farris (Political history of phylogenetics),
  
• Pablo A. Goloboff (Optimization, Tree search, Consensus methods, Clade support, Large data sets, Weighting),
  
• Mari Källersjö (Alignment and subsequent analysis of molecular data),
  
• Laura S. Kubatko (Logic and operation of Likelihood and Bayesian approaches),
  
• John W. Wenzel (Nontraditional characters, Diagnosing problematic results), and
  
• Ward C. Wheeler (Dynamic optimization).
  

The software used for the course will include TNT, POY, RaxML, MrBayes (all distributed with the course packet) and Clustal.
Further information may be obtained at the workshop website

Algoritmos de solucion de matrices filogeneticas

¿Cuales son los algoritmos matemáticos que utilizan los software cladisticos para resolver las matrices? Mi pregunta se basa en el hecho de que mientras en la TN es perfectamente conocible que las matrices son resueltas a través de índices de similitud o de distancias y no pueden consignarse signos como ? y - para denotar que no se conoce o no es evaluable el caracter, en el caso de las matrices resueltas a traves de software filogeneticos estos signos son perfectamente admisibles y evaluables, lo cual he supuesto debe ser interpretado de alguna forma por el algoritmo empleado en la solucion. Hasta el presente no he podido encontrar los algoritmos que se utilizan en la solución de las matrices filogenéticas en los diferentes progrmas como POY,TNT, HENNIG, Mc CLADE y otos tantos.