Congreso Colombiano de Botánica

NARIÑO, SAN JUAN DE PASTO
ABRIL 19-24 DE 2009

A través del convenio de Naciones Unidas sobre diversidad Biológica, la Política Nacional de Biodiversidad y los talleres regionales sobre el estado actual de la Bioprospección en nuestro país, se identificó la necesidad de profundizar en el conocimiento, uso y conservación sostenible de los recursos genéticos.

En consecuencia, con el V Congreso de Botánica, se pretende brindar espacios de discusión y actualización sobre Biodiversidad, Sistemática y Bioprospección en Colombia.

DIRIGIDO A:

Profesionales, Investigadores y estudiantes de Biología, Ecología, Ingeniería Agronómica, Ingeniería Forestal y áreas a fines con intereses en temáticas relacionadas con la Botánica, con especial énfasis en biodiversidad.

International Conference on Biodiversity Informatics

The Encyclopedia of Life and twelve other biodiversity research organizations are co-sponsoring e-Biosphere 09, an international conference that will take place in London on 1-3 June 2009.

Biodiversity Informatics is a young field that is making diverse classes of biodiversity data available online and putting these data to work for science and society. The Conference will highlight the accomplishments, capabilities and uses of Biodiversity Informatics and will gather community input for a 5-10 year research roadmap.

e-Biosphere 09 Conference Website

X Simposio Colombiano de Ictiología

Colombia: X Simposio Colombiano de Ictiología

La Asociación de Ictiólogos Colombianos ACICTIOS convoca a todos los ictiólogos nacionales e internacionales, a participar del próximo simposio de estudios en ictiología a realizarse en la ciudad de Medellín entre el 25 y 29 de mayo de 2009.

Esta será una oportunidad única para el encuentro de los investigadores, docentes y estudiantes provenientes de diferentes países americanos, que permitirá recoger y socializar los avances en el estudio de los peces tropicales, además de promocionar convenios de cooperación en investigación entre nuestros países.

La décima edición del tradicional encuentro de ictiólogos colombianos busca, desde cuatro temáticas fundamentales y dentro del contexto actual de afectación de los sistemas acuáticos, el brindar elementos importantes para el conocimiento de nuestros peces, sus prioridades de conservación y los posibles manejos. Es por esto que el Segundo Encuentro con ictiólogos venezolanos y el Primer Encuentro de Ictiólogos Suramericanos serán fundamentales para el afianzamiento de nuestras relaciones de cooperación y la participación de investigadores de países hermanos, potenciará futuros encuentros y acciones de investigación conjunta.

Esta versión del Simposio, ACICTIOS hace su homenaje al Dr. MIGUEL PETRERE Jr., uno de los ictiólogos más productivos, carismáticos y prolíficos en Suramérica, cuya semilla se encuentra dispersa en buena parte del continente americano.

La programación del simposio está dirigida a biólogos, ecólogos, ingenieros pesqueros y acuícolas, antropólogos, sociólogos, economistas e instituciones responsables por el manejo del recurso ictiológico, cuyo interés y quehacer diario se encamina al conocimiento, conservación y manejo de la ictiofauna. El evento contará con la participación de reconocidos investigadores en el área de los peces, quienes no solo ofrecerán conferencias magistrales sino también, dictarán cursos previos al simposio. Además se realizará la reunión bi-anual de los miembros de ACICTIOS y el encuentro de curadores de diferentes colecciones ictiológicas en Suramérica. Estamos seguros que este encuentro será una gran oportunidad para aprender un poco más sobre nuestros peces.

Mayores informes:

• Luz Fernanda Jiménez-Segura, Universidad de Antioquia
• Alexandra Arango, Universidad Católica de Oriente
• Néstor Mancera, Universidad Nacional de Colombia-sede Medellín

Estancia postdoctoral en epigenetica vegetal, Mexico

Postdoctoral Position (epigenetics, Arabidopsis) : Irapuato, Guanajuato, México

Cinvestav-Guanajuato (http://www.ira.cinvestav.mx)

Irapuato, Guanajuato, México

The Chromatin and Epigenetics Lab of Dr. Raúl Alvarez (Department of Genetic Engineering at Cinvestav-Guanajuato) is seeking applications from highly motivated scientists for a postdoctoral position.
The successful applicant will conduct research on plant epigenetics, in the context of furthering understanding plant-pathogen interactions.

Applicants should have some experience in one or more of the following systems: miRNAs, epigenetics, microarrays, Y2HS, ChIP. Experience on plant molecular biology (Arabidopsis) would be an advantage.

Salary Details:

Postdoctoral salary (at standard rates) will be paid in mexican pesos (no relocation expenses).

Application Details:

Prospective applicants should send an e-mail (via the contact link below) outlining your research interest and motivations, including your C.V. (please list publications and experimental skills) contact details and e-mail addresses for 3 referees to:

Dr. Raul Alvarez Venegas
Profesor Investigador
Cinvestav Campus-Guanajuato
Departamento de Ingenieria Genetica
Km. 9.6 Libramiento Norte, Carretera Irapuato-Leon
C.P. 36821, Irapuato, Guanajuato, México
Tel. 52(462)6239678
ralvarez@ira.cinvestav.mx
http://raul.alvarez0.googlepages.com/
http://www.ira.cinvestav.mx/?id=53

Systematics meeting of BioSyst EU 2009

10-14 August 2009
Leiden, The Netherlands

Currently, several symposia are being considered, dedicated a.o. to Microbial systematics, Flower morphology, Species circumscription and concepts. Workshops will be dedicated a.o. to Annonaceae, Web-based taxonomy, Bryophyte evolution. During or adjacent to the symposium, training sessions will be given for the EDIT Scratchpads (limited attendance)

We invite you to submit an abstract. Registration is open as well and please note that the early fee is applicable until June 30, 2009

See you in Leiden, Peter Hovenkamp

primers4clades: un servidor web para el diseño automatizado de primers de PCR taxon-específicos guiado por áboles filogenéticos

Estimados colegas filogenetistas y evolucionistas, les escribo para informarles que hemos liberado al dominio público el servidor web primers4clades.


Es un servidor de fácil manejo, totalmente automatizado, útil en el diseño de primers de PCR para estudios metagenómicos y/o de diversidad.

Se trata de una herramienta para ayudar en el diseño de primers de PCR taxon-específicos, o clado-específicos para genes condificantes de proteínas (con o sin intrones, es decir de bacterias o eucariontes) a partir de alineamientos múltiples y árboles filogenéticos. Las parejas de oligos encontradas para un conjunto de secuencias enviadas por el usuario son ordenadas en función de un parámetro compuesto de calidad", basado en criterios termodinámicos de los oligos y en el contenido de información filogenética del conjunto de amplicones.

Hemos preparado una documentación muy detallada sobre los requisitos de los datos de entrada, opciones de cómputo, interpretación de resultados, un análisis estadístico a escala genómica del comportamiento del servidor y dos estudios de caso. Además hay tres conjuntos de datos disponibles directamente desde el servidor, para poderlo probar rápida y cómodamente.

El servidor corre en dos espejos, uno en el CCG/UNAM-México y otro en la EEAD/CSIC - España.

Tambien encuentran ligas a estas URLs desde mi sitio web personal, donde además encontrarás muchos tutoriales en español sobre biocómputo, bioinformática y filogenética.

Todavía no tenemos una publicación, pero el Editor del “server issue” de la revista Nucleic Acids Research, nos respondió positivamente para enviar el manuscrito a finales de mes, por lo que esperamos sea publicado en el mes de Julio. La referencia provisional está aquí.

Esperamos que esta herramienta les sea de utilidad y agradeceríamos tus comentarios y sugerencias sobre mejoras al mismo o a la documentación, surgidas en base a tu experiencia en el manejo de primers4clades.

Me despido deseándoles un feliz y productivo 2009!!!

Pablo Vinuesa,
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM,
México

Curso de Especialización en Biología Molecular

Curs d'Especialitzacio Biologia Molecular (IL3 - Universitat de Barcelona)

Tipo modalidad On-Line
Fecha de inicio Marzo 2009
Fecha final Agosto 2009

Este curso pretende dar una visión actual de la biología molecular, tanto desde el punto de vista de los conocimientos como de la tecnología que se utiliza en el laboratorio clínico y en investigación biomédica. El progreso de nuestro conocimiento sobre los seres vivos, debido a los avances en las tecnologías del DNA y del acceso a las secuencias de los genomas de numerosas especies, han tenido una influencia notable y han revolucionado muchas áreas de investigación, especialmente en biomedicina y biotecnología. La comprensión de los adelantos en el campo de la investigación biomédica requiere el conocimiento actualizado de los mecanismos moleculares responsables de la perpetuación y expresión del genoma y de la tecnología actual que se utiliza para investigación, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de diferentes patologías.

Programa académico
1. Genoma humano y Biología Molecular básica de la célula.
1.1. Antecedentes históricos y descubrimientos más relevantes.
1.2. El genoma humano.
1.3. Mecanismos de perpetuación de la información genética.
1.4. Mecanismos de protección de la información genética.
1.5. Transcripción y procesamiento de la información genética.
1.6. Control de la expresión génica.
1.7. Síntesis y degradación de proteínas.
1.8. Tráfico intracelular de proteínas.
1.9. Control de proliferación celular.
1.10 Bases moleculares de la apoptosis.

2. Técnicas de biología molecular.

3. Patología molecular y terapia génica.
3.1. Bases moleculares de la patología.
3.2. Bases genéticas de la patología.
3.3. Aplicaciones de la biología molecular al estudio del sistema nervioso.
3.4. Biología molecular del cáncer.
3.5. Terapia génica: conceptos y metodología.
3.6. Aplicaciones de la terapia gènica.

Contacto
Link mediante el que encontrará más información sobre nuestro Curso de Especialización en Biología Molecular.
http://www.il3.ub.edu/es/detail/course/814.html

Bioinformática y análisis filogenético

La Soc. Mex de Biotecnología y Bioingeniería a traves de la Univ. Aut. Agraria Antonio Narro invitan al Primer Curso Taller "Bioinformática y análisis filogenético".

Impartido por Dr. Rafael Rojas Herrera (Univ. Aut. Yucatan)
22 al 24 de Abril, 2009
Contenido

1. Introducción. Fundamentos moleculares para la microbiología moderna
2. Diversidad microbiana. Conceptos básicos y métodos de estudio de comunidades microbianas.
3. Secuenciación y análisis de secuencias de ácidos nucleicos.
4. Construcción de cladogramas.

INFORMES:
Dr. Antonio Aguilera Carbó aguilera_carbo@uaaan.mx
Dra. Ana Veronica Charles Rdz avecharles@uaaan.mx

Numero de aniversario del Amer. J. Botany gratis

El numero de Enero del American Journal of Botany esta disponible en linea gratis hasta el 12 de febrero, aniversario del nacimiento de Darwin. Los articulos pueden ser bajados como PDFs individualmente.
free access to all of the articles in AJB Darwin Special Issue: The abominable mystery.

Sistemática de Plantas Tropicales

OET y la Universidad de Costa Rica
del 10 de junio al 13 de julio, 2009

Coordinadores:
Dr. Robbin Moran, New York Botanical Garden
Dr. Mauricio Bonifacino, Facultad de Agronomía, Uruguay

Sistemática de Plantas Tropicaleses un curso intensivo de campo a nivel de posgrado, impartido en idioma español, enfocado a la identificación, inventario, clasificación y análisis filogenético de plantas vasculares tropicales. Todas las actividades se llevan a cabo en Costa Rica durante seis semanas con actividades programadas para todos los días en estaciones biológicas y reservas naturales

El Curso ¿Qué aprenderá usted?

Este curso le dará la oportunidad de aprender lo siguiente:

• Identificar las principales familias y géneros de angiospermas y pteridófitas.
• Explicar los patrones generales de la filogenia de angiospermas y pteridófitas.
• Explicar lo básico de la teoría filogenética.
• Utilizar algunos de los programas más comunes para el análisis cladístico.
• Interpretar y describir estructuras vegetativas y reproductivas.
• Construir claves dicotómicas y electrónicas e identificar plantas con ellas.
• Escribir descripciones de plantas.
• Recolectar y herborizar varias clases de plantas tropicales.
• Aplicar los principios de la nomenclatura botánica.
• Reconocer los principales tipos de vegetación de Costa Rica y sus especies características.
• Utilizar varias técnicas de inventario florístico.

Más información aquí >>>

Curso de Análise Filogenética Prática (Lisboa)

O grupo CoBiG² apresenta o curso de Análise Filogenética Prática.

A Filogenética é uma das áreas científicas das Ciências da Vida que mais tem crescido e evoluido metodologicamente nos últimos anos. As suas aplicações vão hoje desde o estudo da evolução das espécies e populações animais até às mais inesperadas, como o averiguar da origem do vírus da Sida ou dos ciclos sazonais de Gripe.

O presente curso é destinado a estudantes ou profissionais que pretendam iniciar-se na análise filogenética e também a investigadores já com alguma experiência mas que queiram aprofundar e actualizar os seus conhecimentos. O curso consistirá em aulas teóricas alternadas com aulas práticas de utilização de software. Encorajam-se os participantes que tenham dados de sequências a trazê-los para análise.

Este curso realizar-se-á de 9 a 13 de Fevereiro das 14h às 20h na Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Programa:
Introdução à Filogenética
Alinhamentos
Máxima Parcimónia e Distâncias
Máxima Verosimilhança
Modelos de Evolução de Sequências
Bootstrap e Inferência Bayesiana

A coordenação está a cargo do professor Octávio Paulo do Centro de Biologia Ambiental da FCUL que será também o formador principal.

Informações e inscrições em http://cobig2.fc.ul.pt ou octavio.paulo@fc.ul.pt

Saiba mais sobre este curso em: http://cobig2.fc.ul.pt/Phylogenetics.htm

Crece la capacidad del servidor de Filogenetica.org

Las capacidades de almacenamiento en el servidor de Filogenetica.org crece 5x. Ahora tendremos disponibles 5 Gigas.
Con esto también crece la capacidad de ofrecer servicios de internet adicionales para la comunidad filogenetica hispanoparlante.
Ideas?
i) Puede hospedar un sitio web de su curso y los materiales asociados de apoyo.
ii) También puede hospedar el sitio web de su laboratorio.
iii) Su sitio web personal. Use el servidor de Filogenetica.org para hospedar paginas web personales (académicas). No puedo ofrecer el diseño y edición de sus paginas web, pero si el espacio. Los archivos html los deposita el interesado por ftp a su directorio de acceso controlado. Su dirección web seria:

http://www.filogenetica.org/personales/nombre-de-su-directorio-personal/su-pag-web.htm

iv) Servicio de cuentas o buzones de correo electrónico. Su direccion de correo electronico seria:

nombre de su cuenta@filogenetica.org

El texto en rojo es de su eleccion. El ingreso es controlado como es usual (mediante usuario y contraseña). No hay comerciales en sus pags web y de plano pues es mejor que depositarlas en servicios como Yahoo o GooglePages.

Si esta interesado en hacer uso de estos servicios, escribame por email o deje un comentario aquí.

Curso de Verao em Bioinformatica - USP

A Bioinformática envolve várias disciplinas da área exatas e biológicas. No curso de verão serão apresentados conceitos e aplicações práticas, os quais são fundamentais para compreensão dos problemas biológicos e soluções computacionais envolvidas.
O curso contribui para a iniciação dos participantes na bioinformática em geral, e em particular como preparação inicial de potenciais candidatos ao programa de mestrado e/ou doutorado em bioinformática, oferecido pela USP.
Realização do curso: 02/02/2009 a 06/02/2009.

Horário: Segunda a Sexta-feira 8h30 - 17h30

Local do Evento

Instituto de Matemática e Estatistica da Universidade de São Paulo (IME-USP)

Rua Matão, 1010 - Cidade Universitária

CEP 05508-090 - São Paulo - SP - Brasil

Fuente de la información: Curso de Verao em Bioinformática - USP

Encuesta: Que árboles prefiere?

La primera encuesta de este año es sobre sus preferencias en la selección de arboles óptmos para la reconstrucción filogenética.

Al igual que en la encuesta anterior, pueden elegir más de una respuesta. La lista de opciones y los resultados estarán disponibles hasta Abril en la columna de la derecha. En la lista de opciones he incluido los criterios más conocidos para tener una idea de las preferencias entre la comunidad.

Escriban aquí sus comentarios y sugerencias. Especialmente útil sería saber cuales son los criterios de selección si alguien vota por las opciones "Otro criterio?".

Gracias por participar!
E

XXth International Seaweed Symposium, Mexico

Ensenada, BC, Mexico

February 2010

You are most cordially invited to the XXth International Seaweed Symposium to be held in Mexico.

The International Seaweed Symposium (ISS) is held every three years under the auspices of the International Seaweed Association (ISA). It is the foremost international meeting on seaweed research and utilization. Scientific research plays a fundamental role in developing seaweed products and industries. The ISS provides a forum for scientists, technologists, industry and resource managers to present their latest research results and develop new synergies.

Scientific Program

The Scientific Program includes plenary sessions, mini symposia, contributed oral or poster presentations, workshops, mid-symposium excursions and pre- and post-symposium tours. Several mini symposia and workshops are planned on topics such as:

1) Genetic engineering of seaweeds;

2) Seaweed cultivation techniques;

3) Marine hydrocolloids;

4) Bioactive compounds;

5) Where are we on systematic of algae;

6) Climate change in seaweeds;

7) Seaweeds for biofuels;

8) Artificial seaweed beds;

9) Seaweed extracts and their applications to higher plants;

10) Nutraceuticals/Cosmeceuticals;

11) Environmental services;

12) Seaweeds for food;

13) Management of natural commercial beds;

14) Implications of large scale cultivation;

15) Invasive species;

16) Kappa cultivation;

17) Seaweeds in integrated aquaculture;

If you would like to participate on any of these topics or propose a new one, please contact us at: contact@xxseaweedsymposium.org

Fuente de la informacion: http://www.xxseaweedsymposium.org/#xxseaweed