Responsable del Laboratorio de Códigos de Barras, Mexico

CONVOCATORIA
Para ocupar una plaza como Técnico Académico
Responsable del Laboratorio de Códigos de Barras
Unidad Chetumal de El Colegio de la Frontera Sur.
En la Unidad Chetumal, se establecerá el Laboratorio para análisis de los códigos de barras, bajo los auspicios del CONACYT. Este laboratorio tendrá como funciones incorporarse en el proyecto internacional de los códigos de barras de la vida (iBOL, International Barcode of Life), el cual tiene como propósito realizar una base de datos de toda la biodiversidad mundial mediante un gen estandarizado, que puede ser utilizado para la identificación de los organismos. México se ha incorporado en este esfuerzo como un nodo regional, con capacidades para depósito de especimenes y tejidos en colecciones científicas, extracción del ADN genómico de alta calidad, y amplificación del gen mitocondrial para la Citocromo Oxidasa I (COI o CO1), a través del proyecto denominado MEXBOL (Mexican Barcode of Life).
Perfil requerido
Se requiere de un(a) colaborador(a) técnico(a) quien se haga responsable del laboratorio de alto volumen (20 a 30, 000 reacciones/año aproximadamente) para trabajar con el gen COI en todos los grupos animales. En el caso de vegetales está por definirse el gen a trabajar, pero en principio se realizará la extracción del ADN. La persona contratada deberá tener habilidades técnicas para el manejo de equipos tales como termocicladores con gradiente, robots de microfluídos, diseño de primers, cámaras de electroforesis, técnicas y métodos para extracción y purificación del ADN y de bioinformática, así como el manejo de bases de datos complejas. Además deberá demostrar tener aptitudes para la administración de un laboratorio, así como vocación de servicio.

Fecha límite para la recepción de documentos:

25 de febrero del 2009

El contrato es para iniciar a partir del 1 de abril del 2009.

Información completa aquí >>>

PhD position at National Herbarium of The Netherlands

The National Herbarium of The Netherlands, Leiden University branch, has

announced a vacant position for a PhD-candidate in Plant Systematics

(see here)

It is current policy now that the candidate himself/herself works out a research proposal for his/her PhD project and applies with this proposal together with the other necessary documents

(see announcement).

The candidate will finally receive the PhD degree from Leiden University. In the Netherlands PhD students have four years to complete their PhD; the appointment is for one year first and can be extended for another threeyears after evaluation.

Deadline is February 16th, 2009.

If you have questions, please mail to my current Leiden address:

Dr. Michael Stech

Nationaal Herbarium Nederland

Universiteit Leiden branch

P.O. Box 9514

2300 RA Leiden

The Netherlands

Cursos de Sistemática en el INECOL, 2009

Se informa que el periodo de inscripción a cursos del Posgrado del INECOL del semestre 2009-02 (marzo-agosto) se ha abierto y estará vigente hasta el 13 de febrero del 2009.

Los cursos relevantes a Sistemática y Biodiversidad son:

• Métodos moleculares para detectar variación en plantas y animales (teórico-práctico) web
• Curso de campo sobre ecología de helechos
• Introducción a la Estadística
• Teoría y métodos cladísticos web
• Biología, comportamiento y evolución de quirópteros
• Microscopía óptica y electrónica de barrido en plantas
• Diplomado técnico en entomología médica (Con especial referencia al dengue, malaria, enfermedad de Chagas y leishmaniosis)
• Ecología de Vertebrados: Carnívoros
• Curso de campo: Biodiversidad e interacciones ecológicas en insectos.
• Bioinformática I – Bases de datos como herramientas en Sistemática y Ecología
• Técnicas y herramientas para la colecta, preservación y muestreo de insectos y arácnidos para estudios de sistemática, de biodiversidad y de ecología

Los estudiantes externos pueden revisar los procedimientos de inscripción y la cartera completa de cursos en la siguiente liga: http://www.inecol.edu.mx/posgrado/13Cursos.htm#2009-02

Informes de inscripción en la oficina de Servicios Escolares.

De donde vienen los articulos?

Si quiere perder el tiempo siga leyendo.



Por accidente, buscando en linea un articulo en PL. Syst. Evol, encontré esta herramienta AuthorMapper de Springer la cual ubica la localización de los autores en un mapa.
El enlace aquí lleva a la colección de artículos en esa base de datos con la combinación de palabras taxonomia+filogenia.
Simplemente interesante, pero no se si sirva de algo. Diviértanse.

Bioinformática básica para el estudio de ADN: Uso de programas libres en la red

Bioinformática básica para el estudio de ADN: Uso de programas libres en la red
Madrid
12 y 13 de Noviembre de 2009.
De 10:00 (1er día) o 9:00 (2º) a 18:00 h.

PROFESORADO
Isabel Rey Fraile. Museo Nacional de Ciencias Naturales.
Elena Prat Pérez y Lourdes Prieto Solla. Laboratorio de ADN. Comisaría General de la Policía Científica

Inscripción abierta, precio: 825 EUR.

Mas informacion: http://www.aulacientifica.com/Programas09/Genomica09/BioinfbasicaADNMAD.htm

Oak Conference, México

International Oak Society Conference,
October 20-22, 2009,
Puebla, Mexico

Dear members and oak lovers, we are delighted to announce that the Herbarium and Botanical Garden at Puebla University will be hosting the 6th triennial Conference.

The Conference will last 3 days during which there will be a wide variety of presentations and posters as well as cultural and outdoor activities. If you are thinking to present a paper or poster, please let me know.

Maricela Rodriguez-Coombes
Conference Chair

Hennig meeting 2009

Hennig XXVIII
Singapore Botanic Gardens
Singapore
June 22-26, 2009

The meeting will be hosted by the National University of Singapore and the Singapore Botanic Gardens (National Parks Board).

Final deadline for pre-registration is April 22, 2009.
Walk-on Registration will be $250 (regular or student) or $300 for non-members.

Currently four symposia have been scheduled:

• (1) Use of EST libraries for phylogeny reconstruction;
  
• (2) Phylogenetic approaches to public and environmental health;
  
• (3) Taxonomy in the 21st century: new tools and dissemination media;
  
• (4) Southeast Asian biogeography and speciation.
  

Contact:

Please contact Rudolf Meier (dbsmr@nus.edu.sg), Benito Tan (Benito_TAN@nparks.gov.sg), or Ngan Kee Ng(dbsngnk@nus.edu.sg) for further information and/or if you are interested in proposing additional symposia.

Hennig meeting 2009 web site

Congreso Venezolano de Botánica

Universidad Centroccidental "Lisandro Alvarado"
Decanato de Agronomía.
Barquisimeto - Venezuela.
Del 17 al 22 de mayo de 2009

Contacto:
email: cvbotanica2009@ucla.edu.ve

Congreso Colombiano de Botánica

NARIÑO, SAN JUAN DE PASTO
ABRIL 19-24 DE 2009

A través del convenio de Naciones Unidas sobre diversidad Biológica, la Política Nacional de Biodiversidad y los talleres regionales sobre el estado actual de la Bioprospección en nuestro país, se identificó la necesidad de profundizar en el conocimiento, uso y conservación sostenible de los recursos genéticos.

En consecuencia, con el V Congreso de Botánica, se pretende brindar espacios de discusión y actualización sobre Biodiversidad, Sistemática y Bioprospección en Colombia.

DIRIGIDO A:

Profesionales, Investigadores y estudiantes de Biología, Ecología, Ingeniería Agronómica, Ingeniería Forestal y áreas a fines con intereses en temáticas relacionadas con la Botánica, con especial énfasis en biodiversidad.

International Conference on Biodiversity Informatics

The Encyclopedia of Life and twelve other biodiversity research organizations are co-sponsoring e-Biosphere 09, an international conference that will take place in London on 1-3 June 2009.

Biodiversity Informatics is a young field that is making diverse classes of biodiversity data available online and putting these data to work for science and society. The Conference will highlight the accomplishments, capabilities and uses of Biodiversity Informatics and will gather community input for a 5-10 year research roadmap.

e-Biosphere 09 Conference Website

X Simposio Colombiano de Ictiología

Colombia: X Simposio Colombiano de Ictiología

La Asociación de Ictiólogos Colombianos ACICTIOS convoca a todos los ictiólogos nacionales e internacionales, a participar del próximo simposio de estudios en ictiología a realizarse en la ciudad de Medellín entre el 25 y 29 de mayo de 2009.

Esta será una oportunidad única para el encuentro de los investigadores, docentes y estudiantes provenientes de diferentes países americanos, que permitirá recoger y socializar los avances en el estudio de los peces tropicales, además de promocionar convenios de cooperación en investigación entre nuestros países.

La décima edición del tradicional encuentro de ictiólogos colombianos busca, desde cuatro temáticas fundamentales y dentro del contexto actual de afectación de los sistemas acuáticos, el brindar elementos importantes para el conocimiento de nuestros peces, sus prioridades de conservación y los posibles manejos. Es por esto que el Segundo Encuentro con ictiólogos venezolanos y el Primer Encuentro de Ictiólogos Suramericanos serán fundamentales para el afianzamiento de nuestras relaciones de cooperación y la participación de investigadores de países hermanos, potenciará futuros encuentros y acciones de investigación conjunta.

Esta versión del Simposio, ACICTIOS hace su homenaje al Dr. MIGUEL PETRERE Jr., uno de los ictiólogos más productivos, carismáticos y prolíficos en Suramérica, cuya semilla se encuentra dispersa en buena parte del continente americano.

La programación del simposio está dirigida a biólogos, ecólogos, ingenieros pesqueros y acuícolas, antropólogos, sociólogos, economistas e instituciones responsables por el manejo del recurso ictiológico, cuyo interés y quehacer diario se encamina al conocimiento, conservación y manejo de la ictiofauna. El evento contará con la participación de reconocidos investigadores en el área de los peces, quienes no solo ofrecerán conferencias magistrales sino también, dictarán cursos previos al simposio. Además se realizará la reunión bi-anual de los miembros de ACICTIOS y el encuentro de curadores de diferentes colecciones ictiológicas en Suramérica. Estamos seguros que este encuentro será una gran oportunidad para aprender un poco más sobre nuestros peces.

Mayores informes:

• Luz Fernanda Jiménez-Segura, Universidad de Antioquia
• Alexandra Arango, Universidad Católica de Oriente
• Néstor Mancera, Universidad Nacional de Colombia-sede Medellín

Estancia postdoctoral en epigenetica vegetal, Mexico

Postdoctoral Position (epigenetics, Arabidopsis) : Irapuato, Guanajuato, México

Cinvestav-Guanajuato (http://www.ira.cinvestav.mx)

Irapuato, Guanajuato, México

The Chromatin and Epigenetics Lab of Dr. Raúl Alvarez (Department of Genetic Engineering at Cinvestav-Guanajuato) is seeking applications from highly motivated scientists for a postdoctoral position.
The successful applicant will conduct research on plant epigenetics, in the context of furthering understanding plant-pathogen interactions.

Applicants should have some experience in one or more of the following systems: miRNAs, epigenetics, microarrays, Y2HS, ChIP. Experience on plant molecular biology (Arabidopsis) would be an advantage.

Salary Details:

Postdoctoral salary (at standard rates) will be paid in mexican pesos (no relocation expenses).

Application Details:

Prospective applicants should send an e-mail (via the contact link below) outlining your research interest and motivations, including your C.V. (please list publications and experimental skills) contact details and e-mail addresses for 3 referees to:

Dr. Raul Alvarez Venegas
Profesor Investigador
Cinvestav Campus-Guanajuato
Departamento de Ingenieria Genetica
Km. 9.6 Libramiento Norte, Carretera Irapuato-Leon
C.P. 36821, Irapuato, Guanajuato, México
Tel. 52(462)6239678
ralvarez@ira.cinvestav.mx
http://raul.alvarez0.googlepages.com/
http://www.ira.cinvestav.mx/?id=53

Systematics meeting of BioSyst EU 2009

10-14 August 2009
Leiden, The Netherlands

Currently, several symposia are being considered, dedicated a.o. to Microbial systematics, Flower morphology, Species circumscription and concepts. Workshops will be dedicated a.o. to Annonaceae, Web-based taxonomy, Bryophyte evolution. During or adjacent to the symposium, training sessions will be given for the EDIT Scratchpads (limited attendance)

We invite you to submit an abstract. Registration is open as well and please note that the early fee is applicable until June 30, 2009

See you in Leiden, Peter Hovenkamp

primers4clades: un servidor web para el diseño automatizado de primers de PCR taxon-específicos guiado por áboles filogenéticos

Estimados colegas filogenetistas y evolucionistas, les escribo para informarles que hemos liberado al dominio público el servidor web primers4clades.


Es un servidor de fácil manejo, totalmente automatizado, útil en el diseño de primers de PCR para estudios metagenómicos y/o de diversidad.

Se trata de una herramienta para ayudar en el diseño de primers de PCR taxon-específicos, o clado-específicos para genes condificantes de proteínas (con o sin intrones, es decir de bacterias o eucariontes) a partir de alineamientos múltiples y árboles filogenéticos. Las parejas de oligos encontradas para un conjunto de secuencias enviadas por el usuario son ordenadas en función de un parámetro compuesto de calidad", basado en criterios termodinámicos de los oligos y en el contenido de información filogenética del conjunto de amplicones.

Hemos preparado una documentación muy detallada sobre los requisitos de los datos de entrada, opciones de cómputo, interpretación de resultados, un análisis estadístico a escala genómica del comportamiento del servidor y dos estudios de caso. Además hay tres conjuntos de datos disponibles directamente desde el servidor, para poderlo probar rápida y cómodamente.

El servidor corre en dos espejos, uno en el CCG/UNAM-México y otro en la EEAD/CSIC - España.

Tambien encuentran ligas a estas URLs desde mi sitio web personal, donde además encontrarás muchos tutoriales en español sobre biocómputo, bioinformática y filogenética.

Todavía no tenemos una publicación, pero el Editor del “server issue” de la revista Nucleic Acids Research, nos respondió positivamente para enviar el manuscrito a finales de mes, por lo que esperamos sea publicado en el mes de Julio. La referencia provisional está aquí.

Esperamos que esta herramienta les sea de utilidad y agradeceríamos tus comentarios y sugerencias sobre mejoras al mismo o a la documentación, surgidas en base a tu experiencia en el manejo de primers4clades.

Me despido deseándoles un feliz y productivo 2009!!!

Pablo Vinuesa,
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM,
México

Curso de Especialización en Biología Molecular

Curs d'Especialitzacio Biologia Molecular (IL3 - Universitat de Barcelona)

Tipo modalidad On-Line
Fecha de inicio Marzo 2009
Fecha final Agosto 2009

Este curso pretende dar una visión actual de la biología molecular, tanto desde el punto de vista de los conocimientos como de la tecnología que se utiliza en el laboratorio clínico y en investigación biomédica. El progreso de nuestro conocimiento sobre los seres vivos, debido a los avances en las tecnologías del DNA y del acceso a las secuencias de los genomas de numerosas especies, han tenido una influencia notable y han revolucionado muchas áreas de investigación, especialmente en biomedicina y biotecnología. La comprensión de los adelantos en el campo de la investigación biomédica requiere el conocimiento actualizado de los mecanismos moleculares responsables de la perpetuación y expresión del genoma y de la tecnología actual que se utiliza para investigación, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de diferentes patologías.

Programa académico
1. Genoma humano y Biología Molecular básica de la célula.
1.1. Antecedentes históricos y descubrimientos más relevantes.
1.2. El genoma humano.
1.3. Mecanismos de perpetuación de la información genética.
1.4. Mecanismos de protección de la información genética.
1.5. Transcripción y procesamiento de la información genética.
1.6. Control de la expresión génica.
1.7. Síntesis y degradación de proteínas.
1.8. Tráfico intracelular de proteínas.
1.9. Control de proliferación celular.
1.10 Bases moleculares de la apoptosis.

2. Técnicas de biología molecular.

3. Patología molecular y terapia génica.
3.1. Bases moleculares de la patología.
3.2. Bases genéticas de la patología.
3.3. Aplicaciones de la biología molecular al estudio del sistema nervioso.
3.4. Biología molecular del cáncer.
3.5. Terapia génica: conceptos y metodología.
3.6. Aplicaciones de la terapia gènica.

Contacto
Link mediante el que encontrará más información sobre nuestro Curso de Especialización en Biología Molecular.
http://www.il3.ub.edu/es/detail/course/814.html