OSU workshop on phylogenetic methods. Columbus

The Ohio State University, as an extension of the successful workshops sponsored by the Willi Hennig Society, will conduct a workshop on phylogenetic methods.
Columbus, Ohio,
July 13-17, 2009.

The purpose is to provide further instruction and experience to students who already have some familiarity with phylogenetic analysis. The format is a series of lectures and laboratory sessions that will give students the opportunity to gain a deeper understanding of the logic of the phylogenetic method, parsimony, maximum likelihood and Bayesian approaches, tree search strategies, measures of support, DNA alignment, morphological character coding, weighting, analysis of multiple and large data sets, consensus and character hypothesis testing.

Lecturers are expected to include

• Gonzalo Giribet (Harvard University),
• Kevin Nixon (Cornell University),
• Ward Wheeler (American Museum of Natural History), and
• John Wenzel (Ohio State University).

The software used for the course will include TNT, POY, RaxML, and MrBayes, and will be distributed with a course packet and workbook.

Participation is limited to 20 students. Cost for the workshop, including one week of lodging, is $1200, but each student will receive a $600 fellowship paid directly to the workshop. Thus the student will be responsible for only a workshop cost of $600, the cost of transportation to and from the Ohio State campus, and meals. Lodging for the period of July 12 through 17 is included in the cost of the workshop, and will be provided adjacent to campus, consisting of modest apartments with a kitchenette.

Applications may be made through http://systematics.osu.edu Click on "workshop information" for details. An application consists of a completed application form (available from the web site), a current CV for the student, and a letter from the student’s advisor regarding the relevance of the course to the student’s career goals. Applications are due April 30, 2009, and notification of acceptance will begin by May 15. Further information may be obtained by emailing osuphylo@....

This workshop is sponsored by the Ohio State University Museum of Biological Diversity (http://mbd.osu.edu), Departments of Evolution Ecology and Organismal Biology (http://eeob.osu.edu) and Entomology(
http://www.oardc.ohio-state.edu/entomology/), and the Willi Hennig Society .
Organized by Marymegan Daly, John V. Freudenstein, and John W. Wenzel.

Taller Latinoamericano de Evolución Molecular

Estimados amigos y colegas filogenetistas,

me complace anunciarles la celebración del "Taller Latinoamericano de Evolución Molecular" que tendrá lugar en las instalaciones del Centro de Ciencias Genómicas y de la Licenciatura en Ciencias Genómicas del Campus Morelos (Cuernavaca, México) de la UNAM, del 22 de Junio al 3 de Julio de 2009.

Se trata de un Taller intensivo pero totalmente GRATUITO dirigido a alumnos de posgrado e investigadores de la UNAM, que cubrirá desde aspecto bioinformáticos tales como búsqueda de secuencias homólogas en bases de datos públicas, parseo de archivos de secuencias con Perl y alineamiento múltiple de las mismas, hasta métodos de inferencia filogenética (distancias, parsimonia, máxima verosimilitud, inferencia bayesiana), de evolución molecular (fechación de clados, selección a nivel molecular) y de genética de poblaciones.

Contaremos además con la participación de dos destacados investigadores extranjeros, el Dr. Scott V. Edwards (Harvard University) y la Dra. Catherine Lozupone (University of Colorado at Boulder).

Podrán inscribirse al curso alumnos de doctorado de cualquiera de los Programas de Posgrado de la UNAM o de otras instituciones nacionales o extranjeras. Este taller permitirá a los alumnos/as de programas de posgrado de la UNAM obtener los créditos equivalentes a un curso fundamental. Asímismo podrán inscribirse investigadores mexicanos o de cualquier otra nacionalidad, siempre y cuando puedan demostrar que tengan conocimientos básicos del área. Se expedirá un certificado de asistencia a todos los participantes.

El registro inicia el día 2 de Abril de 2009 y cierra el 13 de Mayo, efectuándose a través de la página de registro del sitio tlem09 (http://www.ccg.unam.mx/~vinuesa/tlem09/).

Agradecemos el apoyo finaciero por parte de Diversitas para otorgar BECAS para estudiantes e investigadores extranjeros interesados en asistir, así como al Programa de Posgrado en Ciencias Biomédicas de la UNAM por el apoyo económico para traer a los profesores invitados. Asímismo agradecemos el apoyo al proyecto recibido por los Drs. Julio Collado Vides, David René Romero Camarena y Rafael Palacios del Centro de Ciencias Genómicas y de la Licenciatura en Ciencias Genómicas de la UNAM.

Les agradezco la difusión de este mensaje entre sus colegas y estudiantes.

Reciban un cordial saludo desde Cuernavaca, México, esperando verles por aquí el próximo mes de Junio.

Para mayores informes contactar a:
Pablo Vinuesa - coordinador del
Taller Latinoamericano de Evolución Molecular

6th WDA International Congress of Odonatology. México

6th WDA International Congress of Odonatology

Xalapa, Mexico 7-12 June 2009

The congress welcomes all scientific works concerning damselflies and dragonflies (Odonata)

Morphology, Physiology, Ecology,
Systematics, Biodiversity and Conservation
Posters - Oral Presentations - Invited Plenary Talks

Key important date

Registration and abstract submission deadline: 10 April, 2009

Organizers

Rodolfo Novelo-Gutiérrez
Instituto de Ecología A.C. Xalapa. Ver.
rodolfo.novelo@inecol.edu.mx
Phone: + 52 228 842 1800 ext. 3311
Fax: + 52 228 842 1800 ext. 4222

Enrique González-Soriano
Instituto de Biología, UNAM
esoriano@ibiologia.unam.mx
Phone: + 52 555 622 9156
Fax: + 52 55 55500164

Alex Córdoba-Aguilar
Instituto de Ecología, UNAM
acordoba@ecologia.unam.mx

Meeting web site: http://www.odonatology2009.org/

Aplica UNAM Código de barras en flora y fauna para obtener información taxonómica

Fuente de la información:
Aplica UNAM Código de barras en flora y fauna para obtener información taxonómica|{Ciudadania Express}

Aplica UNAM Código de barras en flora y fauna para obtener información taxonómica.
Es un marcador molecular que utiliza ADN mitocondrial del segmento COI, explicó Tila María Pérez Ortiz, directora del Instituto de Biología de la UNAM
Para lanzar el nuevo instrumento de investigación científica, se creó la Red MEXBOL, constituida por el IB, el ECOSUR, el CIBNOR y la Conabio
Hasta ahora, dos mil 556 especies mexicanas han sido analizadas con esa herramienta, señaló el ex rector José Sarukhán Kérmez

Por Emiliano Parra

Oaxaca, México.- Para identificar, clasificar y conservar la variedad de especies de plantas, animales y hongos que habitan en México, se puso en marcha el código de barras de la vida, una herramienta biológica que utiliza un segmento corto y preciso de material genético (ADN) para profundizar en las características de determinada especie.

Para lanzar este nuevo instrumento de investigación científica, diseñado en 2003 por Paul Hebert en la Universidad de Guelp, Canadá, se creó la Red MEXBOL, constituida por el Instituto de Biología (IB) de la UNAM, el Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR), el Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR) y la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (Conabio).

Leer nota completa en el sitio web de Ciudadania Express

Congress of the European Society for Evolutionary Biology, Torino

The 12^th Congress of the European Society for Evolutionary Biology will be held in Torino, Italy, August 24 – 29, 2009.

The structure of the congress is similar to previous meetings, each day starting with a plenary keynote speaker, followed by parallel symposia. We have accepted 31 symposia. Other events will be the traditional John Maynard Smith lecture and the presidential address by the new president of ESEB, prof. Siv Andersson, Uppsala University.

The congress will cover the field of evolutionary biology in a wide sense, but with emphasis on processes and mechanisms of evolutionary phenomena.

Please visit this website continously for more information and updates.

Welcome !

International Symposium on Islands and Evolution

International Symposium on Islands and Evolution
Fechas: 14-17 de septiembre de 2009
Menorca (Islas Baleares, España)

Sesiones científicas:
- Island Biogeography
- Phylogeography and molecular evolution in islands
- Evolutionary ecology in islands
- Late insular evolution

Primera circular (.doc)
Primera circular (.pdf)

Información

Organizadores
Valentín Pérez-Mellado, Universidad de Salamanca (USAL) valentin@usal.es
M.M. Ramon, Universitat de les Illes Balears (UIB) cori.ramon@uib.es

Sitio web de la red MexBOL

La Red Temática de Investigación " El código de barras de la vida - México" ha lanzado su sitio web.
Todavía esta en construcción, pero es un sitio que tendremos en cuenta para seguir el desarrollo de este proyecto.

Convocatorias Maestría y Doctorado CIB-UAEH

Estimada comunidad filogenética, les envío los enlaces a los programas de posgrado en el Centro de Investigaciones Biológicas de la UAEH.

Debido a que aún no se actualiza la pág de posgrado con las convocatorias vigentes, pueden accesar a ellas a través de los siguientes enlaces:

Convocatoria para la MAESTRÍA
http://www.filogenetica.org/personales/Claudia%20Hornung/CONVOC_2009-1%5B1%5D.pdf

Convocatoria para el DOCTORADO
http://www.filogenetica.org/personales/Claudia%20Hornung/CONVOCATORIA%20%202009-2%20DCBC.pdf


Allí viene la información de becas y a quien dirigirse en cada caso.


La información referente a los programas pueden encontrarlas en:
http://www.uaeh.edu.mx/investigacion/biologia/posgrado.htm
http://www.uaeh.edu.mx/campus/icbi/index.html

saludos y esperamos sea de utilidad.

Centro de Investigaciones Biológicas-UAEH.

Botany 2009, Snowbird

The joint Annual Meeting of these leading scientific societies:
Mycological Society of America - American Bryological and Lichenological Society - American Fern Society -American Society of Plant Taxonomists - Botanical Society of America

This year’s meeting offers a variety of informative and fun activities in one of the most beautiful areas of the world. It offers cost-effective options for housing.

Some of the highlights include:

17 field trip options, before, during, and after the meeting, ranging from short morning wildflower forays to full-day trips, focusing on a variety of topics from flowering plants to ferns to lichens to ecology to fungi to paleobotany.

12 half-day symposia conveniently spaced over mornings and afternoons on Monday to Wednesday, discussing plants to fungi, form and function, evolutionary topics using DNA sequence data to genomic approaches, and ecological topics.

Workshops from Saturday-Monday (most on Sunday) ranging from data analysis of molecular and ecological data, to conservation issues, to herbarium techniques, to plant identification, to information on virtual libraries, to educational topics.

Hundreds of individual talks and posters on every topic you can imagine.

Society business meetings and banquets and social events allowing you to catch up on what’s going on in your group and allowing you to make new colleagues and friends.

Special talks such as this year’s plenary speaker, noted ethnobotanist Nancy Turner who will speak on “Bringing the Food Back Home: Plants, Algae, Lichens and Fungi in the Food Traditions of Indigenous Cascadia.”

MOLECULAR TECHNIQUES IN PLANT SCIENCE

MOLECULAR TECHNIQUES IN PLANT SCIENCE
Cold Spring Harbor Laboratory Meetings & Courses Program
June 26 - July 16, 2009
Application Deadline: March 15, 2009

Instructors:
Thomas Brutnell, Boyce Thompson Institute
Elizabeth Toby Kellogg, University of Missouri
Vivian Irish, Yale University
Jennifer Normanly, University of Massachusetts

This course provides an intensive overview of topics in plant physiology, biochemistry and development, focusing on molecular genetic and analytical approaches to understanding plant biology. It emphasizes recent results from Arabidopsis, maize and a variety of other plants and provides an introduction to current methods used in plant molecular biology. It is designed for scientists with some experience in molecular techniques or in plant biology who wish to work with plants using the latest technologies in genetics, molecular biology and biochemistry. The course consists of a vigorous lecture series, a hands-on laboratory, and informal discussions. Discussions of important topics in plant research will be presented by the instructors and by invited speakers. These seminars will include plant morphology and anatomy; plant development (such as development of flowers, leaves, male and female gametophytes, and roots); perception of light and photomorphogenesis; cell wall biosynthesis, function and perception of hormones and application of research results to addressing current agronomic problems. Lectures describing bioinformatics tools available to the plant community, and the resources provided by plant genome projects are also included. Speakers will provide overviews of their fields, followed by in-depth discussions of their own work. The laboratory sessions will provide an introduction to important techniques currently used in plant research. These include studies of plant development, mutant analysis, histochemical staining, transient gene expression, gene silencing, applications of fluorescent protein fusions, protein interaction and detection, proteomics approaches, several different approaches for quantifying metabolites, transient transformation and techniques commonly used in genetic and physical mapping. The course also includes several short workshops on important themes in plant research.

2009 Tentative Schedule & Speakers

Lectures and Labs:
Introduction to Plant Structure (Ian Sussex, Yale University)
Introduction to Plant Structure (Ian Sussex & Nancy Kerk, Yale University)

Phylogenetics (Elizabeth "Toby" Kellogg, University of Missouri, St. Louis)
Sequence Analysis and Phylogeny Reconstruction (Toby Kellogg)

Reproductive Development (Vivian Irish, Yale University)
Visualizing Plant Gene Expression Lab (Vivian Irish)
Microscopy training

Shoot Meristem Development (Dave Jackson, Cold Spring Harbor Laboratory)
Fluorescence, Confocal and Scanning EM Imaging (Dave Jackson)

Secondary Metabolites: Glucosinolates (John Celenza, Boston University)
HPLC Analysis of Arabidopsis Mutants with Altered Indole Glucosinolate Profiles (John Celenza)

Plastids (Thomas Brutnell, Boyce Thompson Institute)
In-planta Transient Expression (Thomas Brutnell)

Quantitative Genetics (Georg Jander, Boyce Thompson Institute)
Quantitative trait mapping using Arabidopsis thaliana as a model system (Georg Jander)

Ethylene Receptors (Eric Schaller, Dartmouth College)
Examining Gene Expression using Protoplasts (Hyo-Jung Kim, Darmouth College)

Regulatory Networks (Erich Grotewold, Ohio State University)
ChiP and ChiP-chip Approaches to Establish Plant Regulatory Motifs (Kengo Morohashi, Ohio State Universityl)

Light Regulation (Julin Maloof, University of California, Davis)
Microarray data analysis (Julin Maloof)

Proteomics (Thomas Nuhse, University of Manchester)
Proteomics (Thomas Nuhse)

Metabolomics (Jennifer Normanly, University of Massachusetts)
Quantification if IAA by GC-MS (Jennifer Normanly)

Lectures:
Root development and physiology (Uta Paszkowski, University of Lausanne)
MicroRNA Regulation (Marja Timmermans, Cold Spring Harbor Laboratory)
Phyllotaxis (Cris Kuhlemeier, University of Bern)
Plant Pathogen Interactions (Savithramma Dinesh-Kumar, Yale University)
Lipid Signaling (Xuemin "Sam" Wang, University of Missouri, St. Louis)
Circadian Rhythms (Stacey Harmer, University of California, Davis)
Strawberry Genomics (Kevin Folta, University of Florida)
Plant Cell Wall Proteomics (Jocelyn Rose, Cornell University)
Feedstock Development for Biofuels (John Vogel, Western Regional Research Center, USDA-ARS)

Workshops:
Workshop I: Double Mutants, Genetic Maps (Vivian Irish & Toby Kellogg)
Workshop II: Separation Methods (Jennifer Normanly)
Workshop III: DNA Sequencing Technologies (Tom Brutnell)
Workshop IV: iPlant (Stacey Harmer & Toby Kellogg)
Workshop V: Transient transformation and analysis using plant protoplasts (Hyo-Jung Kim)
Workshop VI: ChiP-chip data analysis (Kengo Morohashi)


This course is supported with funds provided by the National Science Foundation

Cost (including board and lodging): $4,120
Currency converter

Xth International Congress of Mammalogy (IMC-10), Mendoza, Argentina

Dear colleagues,mammalogists, friends:

On behalf of the Organizing Committee it is a great pleasure to invite you attend the Xth International Congress of Mammalogy (IMC-10) to be held in Mendoza, Argentina,9-14 August, 2009.

The Congress is hosted by the Center for Science & Technology (CONICET), the Institute for Aridlands Research, the Biodiversity Research Group ((IADIZA, GiB), and the Sociedad Argentina para el Estudio de los Mamíferos (SAREM).

This is the first time that the International Congress of Mammalogy will take place in South America. It is our deep and sincere desire to bring together the broadest diversity of studies and investigators. professionals and students in the field of mammalian biology. We wish to provide a forum for an stimulating exchange of ideas and promotion of integrative and collaborative research among the members of our scientific community. Morever, the IMC-10 constitute an extraordinary opportunity to promote and consolidate the growing number of South American mammal societies.

In the name of the Organizing Committee we look forward to seeing you in August 2009, and wish all of you an enjoyable stay in Mendoza and other places you might visit in Argentina and neighbour countries!

Ricardo A. Ojeda
Chair IMC-10
Organizing Committee
meeting website: http://www.cricyt.edu.ar/imc10/index.html

Serie de Seminarios: “Frontiers in Genomics”

El Centro de Ciencias Genómicas y el Instituto de Biotecnología, en conjunto con la Licenciatura en Ciencias Genómicas y la Sociedad Mexicana de Ciencias Genómicas se complacen en invitar a la comunidad académica a la Serie de Seminarios: “Frontiers in Genomics” mismos que se impartirán los lunes a las 4:30 pm de Febrero a Mayo de 2009, por colegas invitados del extranjero expertos en distintas áreas de la genómica, tales como bioinformática, genómica funcional, genómica evolutiva, genómica humana, genómica bacteriana, análisis computacional y experimental, genómica comparativa, estadística y tecnología.

Estos seminarios permitirán a los interesados adentrarse en la investigación de frontera que se realiza en el mundo en ciencias genómicas.

Las pláticas se llevarán a cabo de manera presencial en Cuernavaca, en el Auditorio "Dr. Guillermo Soberón" del Centro de Ciencias Genómicas, o en el Auditorio del Instituto de Biotecnología, UNAM Campus Morelos.

Por videoconferencia en Ciudad Universitaria en México, D.F., en el Aula de Adiestramiento Quirúrgico, 4o Piso, Torre de Investigación (Edificio nuevo, pegado al Circuito Escolar), de la Facultad de Medicina, UNAM.

Si en su institución cuenta con un equipo de VC y desea recibir las pláticas, puede escribir y hacer esta solicitud al M. C. Romualdo Zayas Lagunas


El seminario del lunes 9 de Marzo es:

The dark matter of biological regulation?


Inicio: 03/09/2009 - 16:30
Lugar: Auditorio del IBt
Expositor: Dr. Patrick O. Brown
HHMI. Department of Biochemistry.
Stanford University School of Medicine.
Stanford, CA. USA.

Enlaces:
http://brownlab.stanford.edu

Yvonne Rosenstein
Instituto de Biotecnologia, UNAM
Campus Morelos

SSB Evolution 2009, Idaho

June 12-16, 2009
University of Idaho
Moscow, Idaho, USA

The Department of Biological Sciences at the University of Idaho is delighted to host “Evolution 2009," the joint annual meeting of the Society for the Study of Evolution (SSE), the Society of Systematic Biologists (SSB), and the American Society of Naturalists (ASN). The meeting will be held June 12-16, 2009, on the campus of the University of Idaho.

Contact information

For general inquiries, please contact Lead Coordinator Darrell Keim by e-mail, or phone 1 (208) 885-6488.

For registration inquiries, please contact Registration Coordinator Sharnay Brown by e-mail, or phone 1 (208) 885-6487.

Proyectos para la generación de códigos de barras del ADN de especies mexicanas

From: Virginia Lora Jaimes
Sent: Tue, 03 Mar 2009 16:28:09 -0600
Subject: CONABIO Invitación a concurso

Estimado Investigador y Colaborador:

Lo invitamos a que envíe sus propuestas dentro del concurso para la presentación de proyectos para la generación de códigos de barras del ADN de especies mexicanas, de la cual encontrará toda la información necesaria en la página web de la CONABIO, cuya dirección es la siguiente:

http://www.conabio.gob.mx/institucion/proyectos/doctos/pdf/Codigo%20de%20barras_2009.pdf

Esperamos recibir su(s) propuesta(s) dentro de las fechas establecidas en la invitación y le agradeceremos nos ayude a difundir esta información por todos los medios a su alcance.

Si por alguna razón no puede ingresar a la liga que le estamos enviando, intente lo siguiente: en su navegador escriba o copie la siguiente dirección:

http://www.conabio.gob.mx

en el cintillo superior (color vino o guinda) verá varias opciones, debe poner su cursor sobre la palabra proyectos, se desplegará un subdirectorio, del cual debe escoger la opción de convocatorias y políticas de apoyo (posicionarse con el cursor del ratón y darle click) y listo puede ingresar a la que le interese.

Sin otro particular, aprovecho la ocasión para enviarle un cordial saludo.

Vicky Lora


Biól.Virginia Lora Jaimes
Analista
Subdirección de Evaluación
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903
Col. Parques del Pedregal. CP14010
Tel. (55) 5004 5006
5004 5023
5004 5022
Fax 5004 4931

El Codigo de Barras de la Vida en Mexico

2-3 de Marzo, 2009

Presentación, Auditorio UNIVERSUM, UNAM
(Transmisión por webcast: http://canal.dgsca.unam.mx/)

Taller del Nodo IBUNAM de la Red MEXBOL
El Código de Barras de la Vida
Auditorio del Jardín Botánico del Instituto de Biología de la UNAM
Horario	Ponente	Adscripción	Título de la plática
09:00	Rob DeSalle	American Museum of Natural History	What DNA Barcoding is, is not clear
09:45	Paul Hebert	University of Guelph	BOLD: An Informatics Support System for Barcoding
10:30	Patricia Escalante	Instituto de Biología UNAM	El nodo IBUNAM de la Red MEXBOL y avances del proyecto BOM (Birds of Mexico)
10:45	David Gernandt	Instituto de Biología UNAM	The partitioning of chloroplast variation among species of Pinus
11:00	Fernando Nicolalde-Morejón y F Vergara Silva	Instituto de Ecología AC e Instituto de Biologia UNAM	Códigos de barras moleculares basados en caracteres para las cycadas mexicanas
11:15	Break
11:30	Mehrdad Hajibabaei	University of Guelph	Assembling DNA Barcodes
12:15	Virginia León	Instituto de Biología UNAM	El Código de Barras de la Reserva de la Biósfera Chamela-Cuixmala
12:30	Robert Bye	Instituto de Biología UNAM	El potencial de barcoding en etnobotanica: un ejemplo con las plantas medicinales in Mexico
12:45	Ronald Petersen	University of Tennessee	Biological species in fleshy fungi: a complication for bar-coding
13:30	Intermedio para comer
15:30	Karen Hughes	University of Tennessee	Fungal Barcoding: Lessons from the agaric ATBI in the Great Smoky Mountains National Park
16:15	Joaquín Cifuentes	Instituto de Biología UNAM	Biodiversidad y concepto de especie en hongos
16:30	Damon Little	The New York Botanical Garden	TREEBOL: a collaborative effort for plant DNA barcoding
17:15	Gerardo Salazar	Instituto de Biología UNAM	Codigos de barras de monocotiledoneas: ejemplos de Agavaceae y Orchidaceae
17:30	Break
17:45	Karl Kjer	Rutgers University	Linking barcodes with Phylogenetics: a fruitful collaboration in Trichoptera
18:30	Atilano Contreras	Instituto de Biología UNAM	DNA Barcoding potential for selected groups of Neuropterida in Mexico
18:45	Ricardo Ayala	Instituto de Biología UNAM	Las Abejas Nativas de México y la iniciativa BeeBOL
19:00	Alejandro Zaldívar	Instituto de Biología UNAM	Characterizing diversity in a megadiverse, cosmopolitan parasitoid wasp genus using DNA barcoding