North American Workshop in Cladistic Methods, 2008

The Ohio State University, with generous financial support from the Willi Hennig Society, will conduct a workshop on phylogenetic methods in Columbus, Ohio, July 21-26, 2008. The purpose is to provide further instruction and experience to students who already have some familiarity with phylogenetic analysis. The format is a series of lectures and laboratory sessions that will give students the opportunity to gain a deeper understanding of the logic of the phylogenetic method, parsimony, maximum likelihood and Bayesian approaches, tree search strategies, measures of support, DNA alignment, morphological character coding, weighting, analysis of multiple and large data sets, consensus and character hypothesis testing.

Lecturers are expected to include

• James M. Carpenter (Growth of modern systematics, Coding morphological characters),
  
• James S. Farris (Political history of phylogenetics),
  
• Pablo A. Goloboff (Optimization, Tree search, Consensus methods, Clade support, Large data sets, Weighting),
  
• Mari Källersjö (Alignment and subsequent analysis of molecular data),
  
• Laura S. Kubatko (Logic and operation of Likelihood and Bayesian approaches),
  
• John W. Wenzel (Nontraditional characters, Diagnosing problematic results), and
  
• Ward C. Wheeler (Dynamic optimization).
  

The software used for the course will include TNT, POY, RaxML, MrBayes (all distributed with the course packet) and Clustal.
Further information may be obtained at the workshop website

Algoritmos de solucion de matrices filogeneticas

¿Cuales son los algoritmos matemáticos que utilizan los software cladisticos para resolver las matrices? Mi pregunta se basa en el hecho de que mientras en la TN es perfectamente conocible que las matrices son resueltas a través de índices de similitud o de distancias y no pueden consignarse signos como ? y - para denotar que no se conoce o no es evaluable el caracter, en el caso de las matrices resueltas a traves de software filogeneticos estos signos son perfectamente admisibles y evaluables, lo cual he supuesto debe ser interpretado de alguna forma por el algoritmo empleado en la solucion. Hasta el presente no he podido encontrar los algoritmos que se utilizan en la solución de las matrices filogenéticas en los diferentes progrmas como POY,TNT, HENNIG, Mc CLADE y otos tantos.

Bibliografía Reciente sobre Filogenética

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