¿Desaparece siempre el ancestro?

De acuerdo al principio de dicotomía utilizado para elaboración de los cladogramas, el ancestro solo puede dar lugar a dos descendientes en cada nodo de manera que la lectura de la topologia representada nos induce a pensar que este ancestro nunca sobrevive. ¿Refleja esto siempre la realidad? ¿El ancestro siempre desaparece? ¿No niega esto tanto la especiacion alopatrida como la simpatrida?

Software y algoritmos. Realidad, Cuasi-Realidad o Subjetividad

Actualmente muchos investigadores se dedican a buscar "mejores" metodos y disenan software con el proposito de "optimizar" los resultados de las relaciones filogeneticas que se derivan de una matriz de estados de caracteres.

Mi duda es: Cual es la referencia corroborativa que se tienen en cuenta para afirmar que un algoritmo o un software determinado representa mejor que otro las verdaderas relaciones filogeneticas (relaciones naturales producto de su evolucion) existentes entre los miembro del grupo objeto de estudio (grupo interno). Dicho de otro modo, estamos tratando de explicar relaciones naturales (reales pero desconocidas por supuesto pues es lo que estamos tratando de explicar) a traves de algoritmos matematicos que han sido creados. Como tener un referente a partir de estos elementos para decir que una topologia A (hipotesis A) a la cual hemos llegado a traves de el software 1 con el grupo externo C, representa mejor la evolucion del grupo interno X que otra topologia B (hipotesis B) a la cual se llega a traves del software 2 con el grupo externo D. Siendo por supuesto la topologia A y B diferentes incluso si el grupo externo es igual para ambos procesos y solo cambian el software utilizado.

No existe en esto una dosis mas o menos alta de subjetividad?

Invitación: Tesis en Filogenética

Se invita a todos, profesores, investigadores y estudiantes a anunciar aquí su trabajo de tesis a todos los niveles con temas afines a la filogenética (sistemática, biogeografía, ecología evolutiva, etc). Podrán incluirse en este registro las Tesis de cualquier nivel (Licenciatura o pre-grado. Maestría y Doctorado) que se relacionen con cualquier aspecto de la filogenética (en su sentido más amplio).
Dos opciones para publicar los resumenes.
Una es usar el formulario aqui. Su resumen es enviado y el Editor en unos dias lo pone en linea en este blog.

Otra opción si Ud ya esta registrado como colaborador en este blog es publicar directamente una "nueva entrada". Para ello, sugiero que en el campo del titulo de la "entrada" escriban
El titulo completo de la tesis (en el idioma original).

y en el campo de contenido, las primeras lineas de texto pueden escribir la referencia bibliográfica completa de la tesis.
En un párrafo nuevo inserten el resumen.
Cualquier otro dato, palabras clave, comentarios, gráficas, esquemas o fotografías pueden agregarse al final.
La etiqueta sugerida es: Tesis en Filogenética. Desde luego que pueden usar adicionalmente otras etiquetas.

Anteriormente, se había iniciado la compilación de Tesis en Filogenética y se publicaron unas cuantos resúmenes en la pag web: http://www.filogenetica.org/TesisEnFilogenetica.htm.
Esas tesis las he transferido aqui al blog y pueden considerarse como ejemplos para los formatos deseables. El sistema anterior de publicación dependía de enviar el texto por correo electrónico y después lo ponía en linea. Ahora con el blog, el colaborador podrá publicar y editar directamente su texto y gráficos en linea!

Que les parece? Ojala en el transcurso de las siguientes semanas veamos sus colaboraciones. Profesores, pidan a sus estudiantes que den a conocer sus tesis!
Saludos!