Linux para filogenética: PhyLIS

Mac OS le parece caro? Windows .... caro y muy problemático? Bueno pues ahora sera más fácil adoptar Linux como sistema operativo en su investigación filogenética. No solo Linux es gratis sino mucho mas robusto y estable (al menos comparado con Windows), por lo cual en los últimos años este sistema operativo ha estado ganando popularidad, especialmente entre la comunidad científica.

Ahora el nivel de dificultad para instalar Linux y configurar la numerosa colección de programas ya disponibles para análisis filogenéticos ha disminuido significativamente con la disponibilidad de PhyLIS o "Linux Filogenético para Informática y Sistemática" (Phylogenetic Linux for Informatics and Systematics).
PhyLIS incluye dos componentes: el sistema operativo Linux y una colección básica de programas filogenéticos (los que han sido gratis). La configuración tanto del sistema operativo como de los programas incluidos ya esta lista para solo instalar y trabajar.
" ..... [PhyLIS] comes with most commonly used
phylogenetic software pre-compiled, installed,
and configured, which allows this software to
be executed by simply typing the appropriate
command (Table 1). PhyLIS also contains popular
scripting languages (and appropriate phyloinformatic
packages) including Perl (with BioPerl), Python
(with BioPython), and R (with several packages).
It implements parallel versions of several particularly
processor-intensive programs using MPI (including
BEST,4 MrBayes,5 and raxML).6 PhyLIS aims to
present a complete phylogenetic workbench for all
steps of analysis from sequence data manipulation to
alignment and tree search, including visualization (for
alignments and trees), model selection, divergence
time estimation, macroevolutionary analyses and
tools for automation and batch analysis." (Thomson, 2009).

Si aun no ha entrado al mundo Linux, esta es una muy buena oportunidad.

Para bajar el archivo de instalacion ISO ingrese al sitio web de PhyLIS.

Referencia:
Thomson RC. 2009. PhyLIS: a simple Gnu/Linux distribution for phylogenetics and phyloinformatics. Evolutionary Bioinformatics. 5:91-95 (Link)