Curso de Filogenia y Morfometría Geométrica en Barcelona

Ya está abierta la inscripción para la 9ª edición del curso de Transmitting science "Geometric Morphometrics and Phylogeny "

Fechas: Del 9  al 13 de septiembre de 2019

Profesor:  Dr. Chris Klingenberg (University of Manchester, United Kingdom)

Lugar: Capellades, Barcelona (España)

Más información y matrícula:

https://www.transmittingscience.org/courses/geometric-morphometrics/geometric-morphometrics-phylogeny/

Programa del curso:

 

1. Phylogeny, trees and phylogenetic reasoning.

2. Brief review of geometric morphometrics (Procrustes fit, PCA, etc.).

3. Mapping traits onto phylogenies: squared-change parsimony.

4. Practice: making/editing Nexus files, mapping morphometric data onto the tree (Mesquite, MorphoJ).

5. Phylogenetic signal, morphometric traits and estimating phylogeny.

6. Comparative methods: independent contrasts.

7. Application in morphometrics: evolutionary allometry and size correction.

8. Practice: comparative methods (MorphoJ).

9. Application of comparative methods: morphological integration.

10. Multi-level analyses of integration: inferring evolutionary mechanisms.

11. Application of comparative methods: partial least squares (ecomorphology, etc.).

12. Practice: comparative methods (cont.).

13. Morphometrics, phylogenies and qualitative characters.

14. Disparity and diversification.

15. Presentations of group work.

Reunión Argentina de Cladistica en Tucumán, 2019

XII Reunión Argentina de Cladistica y Biogeografía,
8-10 de Abril, 2019,
San Miguel de Tucumán, Argentina.

Course on Metagenomics and Barcoding in Crete, March 19-23, 2018

Transmitting Science is offering a new course on its new venue: AN INTRODUCTION TO METAGENOMICS AND METABARCODING.

Dates: March 19-23, 2018.

Place: Heraklion (Crete, Greece).

Instructor: Dr. M. Lisandra Zepeda-Mendoza (Chr. Hansen – Bacterial Physiology & Improvement, Denmark).

Metagenomics is the study of the collection of genomes in an environment. Environments as diverse as Antarctic lakes, hot springs, or the human gut can be biologically characterized by extracting and sequencing DNA from samples taken from them. A characteristic of many of these samples is their complexity, posing difficulties to their analysis and characterization. However, metagenomics allows the taxonomic and functional characterization of samples. These two kinds of characterizations also enable the comparison of different habitats for biodiversity assessment.

In this course students will be introduced to the command line environment used to analyze high-throughput sequencing data (HTS). The initial cleaning steps that must be performed on every HTS dataset will be described and we will use the processed data for proper functional and taxonomical characterization of a metagenomic dataset. We will use methods such as mapping to whole genome databases, de novo assembly, gene annotation, building of non-redundant gene catalogue, and metagenomic species concept identification. Due to the wide usage of metabarcoding for the taxonomic characterization of an environment, we will also discuss amplicon sequencing strategies and data analysis. The course will be based on both theory and hands-on exercises.

More information: http://www.transmittingscience.org/courses/genetics-and-genomics/introduction-metagenomics-metabarcoding/ or writing to courses.crete@transmittingscience.org

Curso de Morfometría Geométrica y Filogenia, 11-15 de Septiembre, Barcelona (España)

Estimados colegas,

Ya está abierta la inscripción a la 8ª edición del curso GEOMETRIC MORPHOMETRICS AND PHYLOGENY

 

PROFESOR: Prof. Chris Klingenberg (University of Manchester, UK).

FECHAS: 11-15 de Septiembre, 2016.

LUGAR: Centre of Restauració i Interpretació Paleontologica, Els Hostalets de Pierola, Barcelona(España).

Testimonios de ediciones previas:http://www.transmittingscience.org/courses/gm/gm-and-phylogeny/#Testimonials 

  

Organizado por Transmitting Science, el Institut Catalá de Paleontologia Miquel Crusafont y el Centre de Restauració i Interpretació Paleontològica.

Más información: http://www.transmittingscience.org/courses/geometric-morphometrics/geometric-morphometrics-phylogeny/

Curso de Introducción a la inferencia filogenética y sus aplicaciones, 26-30 Junio, Barcelona.

Ya está abierta la inscripción al curso  "Introduction to Phylogenetic Inference and its Applications"; del 26 al 30 de Junio, 2017.

Profesores: Dr. Miquel Arnedo (Universitat de Barcelona, España) y Dr. Salvador Carranza (Instituto de Biología Evolutiva (CSIC-UPF, España).

Web e inscripciones: http://www.transmittingscience.org/courses/phylogeny/introduction-phylogenetic-inference-applications

Durante este curso se enseñarán conceptos principales sobre los métodos de inferencia filogenética (parsimonia, máxima probabilidad e inferencia Bayesiana), modelos evolutivos, estimación de tiempos de divergencia y uso de aproximaciones cuantitativas para la delimitación de especies. Durante las sesiones prácticas, se introducirán conceptos para el uso de los principales programas informáticos utilizados en este campo y que permitirán, entre otros, aprender cómo realizar la selección de los modelos evolutivos, inferir árboles bajo supuestos alternativos y la estimación de los tiempos de divergencia.

Se anima a los participantes a traer sus propios datos y problemas para encontrar soluciones a ellos empleando las metodologías usadas en el curso.