Phylogeny.fr es un servicio en linea para la reconstrucción filogenética con datos moleculares.
Phylogeny.fr procesa y conecta varios programas para reconstruir un árbol filogenético a partir de una matriz de secuencias.
No solo hay la opción "One click", tambien uno puede decidir como hacer cada paso en el alineamiento y la reconstrucción ("Advanced"). Incluso hay una opción para generar una cadena de análisis especial sin los parametros automatizados: "A la Carte" Mode. Por ejemplo, uno puede seleccionar un alineamiento con Muscle, T-Coffee, ProbCons, o ClustalW y seleccionar una de las cuatro opciones disponibles para construccion del arbol: Maximum likelihood con PhyML, Parsimonia con TNT, Distancias con ProtDist/FastDist+BioNJ (o Neighbor) y probabilidades Bayesianas con MrBayes.
No pude resistir la tentación de correr un análisis. Entre directamente a TNT y use la matriz de ejemplo con 16 secuencias Angiospermas y grupos externos. Click, click, click... listo un arbol de consenso, ahí en la ventana de dialogo, en menos de lo que canta un gallo!. Muy sencillo!
Este servicio esta disponible en http://www.phylogeny.fr/
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