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19 de octubre de 2011

Premio nacional de Ciencias 2010 a Gabriela Parra, IB, UNAM. Mexico


Un año tarde pero lo comparto. Es un gusto pasarles la excelente noticia sobre los Premios de Investigación de la AMC (México). Hoy me entero que el premio nacional en el área de Ciencias naturales 2010 fué para la Dra. Gabriela Parra Olea, del Instituto de Biologia. UNAM. Es un gusto por que la especialidad de ella es la sistemática. En la historia de los premios, pocos taxónomos han recibido esta distinción, por ejemplo en 2002 el Dr. Gerardo Perez Ponce de Leon.
Transcribo aquí la informacion presentada por la Academia Mexicana de Ciencias, en ocasion del premio hace un año:

La doctora Parra Olea nació en la Ciudad de México en 1967. Realizó sus estudios de licenciatura en la Universidad Autónoma Metropolitana, plantel Iztapalapa, donde obtuvo el título de Hidrobióloga en 1989. Los estudios de doctorado en Ciencias los realizó en la Universidad de California, Berkeley, USA, entre 1994 y1999 habiendo realizado la tesis: Molecular Evolution and Systematics of Neotropical Salamanders (Caudata: Plethodontidae: Bolitoglossini) bajo la asesoría del doctor David B. Wake. Entre 2000 y 2001 realizó una estancia posdoctoral en la Universidad de Harvard, Cambridge, USA, donde continuó sus estudios en sistemática molecular de salamandras neotropicales bajo la asesoría del doctor James Hanken, director del Museo de Zoología
Comparada de dicha Universidad.
En agosto de 2001, la doctora Parra ingresó a la planta académica
del Instituto de Biología de la UNAM como Investigadora Asociada C, para incorporarse a la planta académica de la Colección Nacional de Anfibios y Reptiles. En 2006 fue promovida a Investigador Titular A y al nivel D del programa de becas al desempeño de la UNAM (PRIDE) y en 2008 a la categoría de Investigador Titular B. Pertenece al Sistema Nacional de Investigadores desde 2002 y, en el año 2009, fue promovida al nivel II.
Las áreas de especialidad de la Dra. Parra son la Sistemática, Biología Evolutiva y Conservación de anfibios, con especial énfasis en las salamandras. Su programa de investigación incluye dos aspectos, el primero es sobre sistemática filogenética y taxonomía de salamandras neotropicales en el cual ha propuesto hipótesis
de relaciones filogenéticas y biogeográficas para diferentes grupos de salamandras, y además, ha contribuido a la descripción de la biodiversidad de este grupo de organismos en México, al haber descrito, hasta el momento, 14 especies nuevas. Las hipótesis
filogenéticas que la Dra. Parra ha propuesto han utilizado los métodos más modernos de análisis en sistemática, lo que incluye no sólo el uso de caracteres morfológicos, sino también, de manera importante, de marcadores moleculares. La combinación de ambos tipos de caracteres, la han llevado incluso a reconocer la existencia de al menos otras 30 especies de salamandras que están en proceso de ser descritas. El segundo aspecto de su programa de investigación se relaciona con el estado de conservación de los anfibios de México, mismo que ha cultivado en dos áreas distintas;
la primera se ha centrado en desarrollar estudios de genética de poblaciones para generar información de utilidad para establecer
políticas de conservación, mientras que la segunda área se ha dirigido hacia la detección de enfermedades infecciosas emergentes, mismas que están determinando en la actualidad un importante declive en las poblaciones de anfibios a nivel mundial,
donde México por supuesto no está exento. En particular, está estudiando el efecto de hongos patógenos causantes de la quitridiomicosis en especies de salamandras, incluyendo algunas de gran importancia para la conservación tales como el ajolote (Ambystoma mexicanum).
Su labor académica ha sido reconocida por diferentes organismos
nacionales e internacionales, al haber sido invitada, junto con otros expertos, a participar en paneles donde aspectos de sistemática,
y principalmente de conservación de anfibios, fueron discutidos. Como resultado de estas reuniones se publicaron dos artículos en la revista Science (2006, 2010). Sus proyectos de investigación
han recibido financiamiento a través de programas de diferentes instituciones nacionales y extranjeras, tales como PAPIIT-UNAM, SEP-CONACYT, CSIC-CONACYT (España-México) UC-MEXUS (USA-México) Grupo Rana (USA) y NSF (USA).
En cuanto a su productividad, la Dra. Parra cuenta hasta la fecha
con un total de 64 publicaciones, de las cuales 42 se encuentran
en revistas indizadas y de alto impacto en su área, incluyendo
tres en los Proceedings of the National Academy of sciences (PNAS). Además, cuanta con cinco capítulos de libros, todos internacionales.
Sus contribuciones han recibido hasta al momento un total de 420 citas. Ha presentado 40 trabajos en congresos nacionales e internacionales. En el año 2000 recibió el American Society of Ichthyologists and Herpetologists Stoye Award for best student presentation in Systematics, dentro de la American Society
of Ichthyologist and Herpetologist’s 80th Annual Meeting que fue realizado en La Paz, Baja California, México
En el rubro de formación de recursos humanos, ha dirigido tres tesis de licenciatura y seis de maestría. Actualmente, la Dra. Parra dirige una tesis de maestría, dos de doctorado y cuenta con dos posdoctorados que obtuvieron sus respectivos grados académicos de la Universidad de California, Berkeley. Con respecto a la docencia, es profesora de la UNAM desde 2002, habiendo impartido hasta la fecha un total de siete cursos completos a nivel licenciatura, y cinco de posgrado. Adicionalmente ha impartido cinco cursos cortos, en diferentes instituciones de educación superior
del país. Ha participado en el Comité Tutoral de 13 alumnos
de maestría y siete de doctorado, seis sínodos para tesis de licenciatura, así como en el sínodo de tres exámenes de doctorado y en siete comités de examen de candidatura al grado de doctor.
Como complemento a su labor académica y su participación en la formación de recursos humanos, ha realizado labores de apoyo institucional, entre las cuales se destaca su participación como miembro del subcomité de admisión al posgrado en Ciencias Biológicas
en 2003, la organización de los seminarios del Instituto de Biología de 2007 a 2008 y, desde septiembre de 2009, y su papel como representante del personal académico del Departamento de Zoología ante el Consejo Interno del Instituto de Biología.

17 de octubre de 2011

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Querida comunidad de filogenetistas y biólogos evolutivos:
Nos es grato informarle que el Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-UNAM) y la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SOIBio), con el apoyo del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM), el Instituto de Biotecnología (IBt-UNAM), la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM) y EMBnet organizan los Talleres Internacionales de Bioinformática - 2012, que se llevarán a cabo del 16 al 27 de enero de 2012 en las instalaciones del CCG en Cuernavaca Morelos, México.
En la semana del 16 al 20 de Enero se impartirán 2 talleres de nivel básico dirigido a principiantes en el área. En la semana del 23 al 27 de Enero se ofrecerán 2 talleres especializados, uno dirigido a gente trabajando en análisis de datos generados por secuenciadores de nueva generación y otro para Administradores de Sistemas.
Para los detalles de los programas y procedimiento de registro, favor de visitar el sitio web del evento:
http://congresos.nnb.unam.mx

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International Workshop on Bioinformatics - January 2012

Dear community of phylogeneticists and evolutionary biologists:

We are pleased to announce that the National Node of Bioinformatics (NNB-UNAM) and the Iberoamerican Society of Bioinformatics (SOIBio), with support from the Center for Genomic Sciences (CCG-UNAM), the Institute of Biotechnology (IBT-UNAM), the Undergraduate Program in Genomics Sciences (LCG-UNAM) and the EMBnet, organize the “International Workshops on Bioinformatics – 2012” which will be held from January 16th to 27th, 2012 in the CCG facilities in Cuernavaca Morelos, Mexico.
Two Basic or introductory workshops will be offered during the first week (January 16th-20th), geared towards beginners in the field. Two advanced workshops will be offered during the second week (January 23rd to 27th), one designed for people working with data generated by next generation sequencers, and the other for System Administrators.

For the details on the programs and registration procedure, please visit the event website:
http://congresos.nnb.unam.mx

22 de septiembre de 2011

Curso de posgrado: BIOGEOGRAFÍA EVOLUTIVA. Salta. Argentina

UNIVERSIDAD NACIONAL DE SALTA
FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES
ESCUELA DE POSGRADO

Curso de posgrado: INTRODUCCIÓN TEÓRICO-PRÁCTICA A LA
BIOGEOGRAFÍA EVOLUTIVA
Director del curso: Dr. Juan José MORRONE, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM)

Fecha: 17 al 21 de octubre de 2011

Lugar: Facultad de Ciencias Naturales. Universidad Nacional de Salta, Av. Bolivia 5150 – (4400) Salta

Carga horaria: 40 hs.

Metodología: clases teórico-prácticas.

Arancel: Doctorandos y Maestrandos de la Escuela de Posgrado de la Facultad de Ciencias Naturales: $ 500,00 y alumnos externos; $ 650,00.
El pago del arancel de inscripción debe realizarse en la Dirección Administrativa Económica de la Facultad de Ciencias Naturales (U.N.Sa), de lunes a viernes de 8 a 14 hs; o por depósito bancario (e-mail)
Inscripciones: email, email
tel. 0387-4255513
Contacto: Dra. Olga Martínez, email

14 de septiembre de 2011

New taxonomic names online will be "valid publication"

Electronic revolution in plant taxonomy

Elizabeth C Moylan

BMC Evolutionary Biology 2011, 11:251doi:10.1186/1471-2148-11-251

The electronic version of this article can be found online at: http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/251

Published: 14 September 2011

The XVIII International Botanical Congress held in Melbourne, Australia this July [1], a gathering of more than 2000 plant scientists from 73 nations, witnessed exciting developments in the field of plant taxonomy. At the meeting, a resolution was passed with a large majority to enable new taxonomic names to be published electronically and their accompanying descriptions and diagnoses to be published in English or Latin rather than the obligatory Latin description [2]. These are truly ground sweeping changes to the 'International Code of Botanical Nomenclature' [3] henceforth to be known as the 'International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants', and brings 'the Code' bang up to date in the 21st Century.


READ MORE >>>http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/251#B4

8 de septiembre de 2011

CONVOCATORIA AL "PREMIO CINVESTAV" a las mejores tesis de licenciatura y maestría


En el marco de la celebración del cincuenta aniversario del Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Cinvestav, y con el fin de fortalecer sus vínculos académicos con las Instituciones de Educación Superior Públicas y Privadas, este Centro convoca a los estudiantes graduados a participar en el “Premio Cinvestav” a las mejores tesis de Licenciatura y Maestría. Esta convocatoria es una nueva iniciativa que se abrirá anualmente.

El objetivo es reconocer a aquellos estudiantes que eligieron la opción de tesis para obtener su título o grado y fomentar así el interés por la investigación científica, tecnológica o educativa. Son elegibles aquellas tesis cuya defensa se haya realizado en una institución pública o privada con sede en la República Mexicana, en el periodo comprendido entre el 1 de septiembre de 2010 y el 30 de agosto de 2011.

La fecha de cierre el 30 de septiembre. Es importante señalar que se otorgará un estímulo económico a las tesis ganadoras y una constancia de participación a los autores de las tesis inscritas.

29 de agosto de 2011

IAPT Research Grants in Plant Systematics 2012


The IAPT announces a competitive grants program in plant systematics, with emphasis on funding students and young investigators in developing countries, but open to applicants world-wide. The program is based on the submission of research projects, taking into consideration the following guidelines:
1. The grant application period is open until 31 December 2011.
2. The award should be preferably used for supporting field work, travel to institutions, or laboratory investigations.
3. General information should be always included on the front page (complete name of the applicant, country, institution, project title, academic degree, telephone, fax and e-mail).
4. The projects should include brief ideas of an introduction, materials, methods, objectives, literature citation and other relevant information, especially noting if any other financial support for the project exists.
5. The length of the proposals should not exceed three pages.
6. In the case of Ph.D. students, in addition to the proposal, two recommendation letters should be included.
7. The projects are to be submitted to:
Patricia Dávila-Aranda
preferably by e-mail (pdavilaa@servidor.unam.mx)
or by regular mail:
Facultad de Estudios Superiores, Iztacala, UNAM
Av. de los Barrios no. 1
Los Reyes Iztacala, Tlalnepantla
Edo. de México 54090
México

8. Applicants will be informed by e-mail of receipt of their proposals.
9. The total amount to be awarded is: US$10,000.
10. The maximum individual award is US$1,000.
11. The awarded projects will be announced on the IAPT web page and by e-mail to all the applicants on March 1, 2012.

Plant Systematics World. TAXON 60 (4) • August 2011: 1227–1229.
IAPT web site: http://www.iapt-taxon.org./s_grants.php

15 de agosto de 2011

Curso: Evolutionary paleontology, evo-devo, and paleobiology


Curso: Evolutionary paleontology, evo-devo, and paleobiology

Curso de Postgrado de la Asociación Paleontológica Argentina.

Evolutionary paleontology, evo-devo, and paleobiology

PhD. Michel Laurin

5 al 9 de diciembre de 2011

A dictarse en la Asociación Paleontológica Argentina,
Maipú 645 1er Piso CABA.
Buenos Aires

14 de agosto de 2011

Mini-symposium on Bayesian inference of phylogeny, UC Berkeley

SYMPOSIUM / WORKSHOP on
Bayesian inference of phylogeny


Talks: Monday & Tuesday, August 15-16
Workshop: Wednesday to Friday, August 17-19

Where: UC Berkeley campus
(talks will be held in 155 Dwinelle Hall and the workshop will be held in 4110 VLSB)

There will be a mini-symposium on Bayesian inference of phylogeny to be held on the UC Berkeley campus from August 15th to 19th. There will be two days of talks (August 15th and 16th) on various aspects of Bayesian inference as it applies to the phylogeny problem. The following three days will be a workshop for people interested in developing for the RevBayes program. RevBayes implements an R-like language for specifying complex evolutionary models and (attempts) to perform solid statistical estimation of a model's parameters.

web site: http://cteg.berkeley.edu/events/201108Symposium.html

4 de agosto de 2011

Job opening - curator of Diptera

The Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig (ZFMK), Bonn, Germany (
http://www.zfmk.de) seeks to fill a research position
(curator of Diptera) in the Department of Arthropods. The position is
available from October 2011. Potential candidates will hold a PhD in zoology
or related areas, have their research focus on taxonomy and systematics of
Diptera, and present a substantial publication record in taxonomy,
phylogenetics and/or other aspects of biodiversity research. The candidate
is expected to work in these fields from a sound theoretical basis and be
able to apply an array of appropriate modern methods. He/she should be able
to combine collection-based work with modern phylogenetic and/or ecological
approaches. The candidate is also expected to integrate into ongoing
research projects at the ZFMK and teaching programs at the University of
Bonn, and to obtain competitive grant funds.



As a curator, the successful candidate will be responsible for caring,
managing and further increasing and developing the Diptera collections at
the ZFMK. He/she will also be involved in the self-administration of the
institute and is expected to demonstrate commitment to community engagement
in his/her field of research. Non-German candidates are expected to acquire
basic knowledge of German.



The successful candidate will be employed for an initial probation period of
up to five years - determined on his/ her experience - according to the
German legislation, after which he/she will obtain tenure depending on
his/her performance. Salary is according provisionally to grade TV-L/13 in
the German Public Service scheme).



The ZFMK is a fellow institute of the "Wissenschaftsgemeinschaft Gottfried
Wilhelm Leibniz" (WGL Science Community) and works in close cooperation with
the University of Bonn. It comprises internationally important scientific
collections, libraries, electron microscopy unit, and bioacoustics,
histological and molecular laboratories.



The ZFMK is an equal opportunity employer. Women are therefore strongly
encouraged to apply. Equally qualified handicapped applicants will be given
preference.



Interested applicants should submit a CV, complete publication record, a
statement of teaching experience and research funding, certificates of
university degrees, and selected publications in hard copies to the
following address:



Heike Lenz, Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, Adenauerallee
160, D-53113 Bonn, Germany, by August 31 2011. E-mail inquiries:
h.lenz.zfmk@uni-bonn.de.

Please note that application documents will not be returned.



_______________________________________________

Taxacom Mailing List
Taxacom@mailman.nhm.ku.edu
http://mailman.nhm.ku.edu/mailman/listinfo/taxacom

26 de julio de 2011

I Congreso Ibérico de Sistemática Animal. Madrid



La Universidad Autónoma de Madrid (UAM) y la Universidad de Barcelona (UB) organizan un foro de intercambio científico de sistemática y evolución animal para la presentación y discusión de resultados científicos. El I Congreso de Sistemática Animal, tendrá lugar en el campus de la UAM, Cantoblanco, Madrid, durante los días 17 al 19 de Enero de 2012. La conferencia consta de simposios con temática
concreta y sesiones abiertas.

TEMAS
  • Relaciones Evolutivas de Animales
  • Biogeografía y Filogeografía
  • Taxonomía integratica y código de barras
  • Filogenómica
  • Evolución de planes morfológicos y desarrollo
  • Biodiversidad y Conservación
  • Aproximaciones filogenéticas a la Ecología

Más información:
cisa.sistematica@gmail.com
Sitio web
Boletín de Preinscripción (
PDF)

AIDA VERDES GORÍN

13 de julio de 2011

Profile of David M. Hillis



Nota tomada de:
PNAS July 12, 2011 vol. 108 no. 28 11320-11322
doi: 10.1073/pnas.1107823108
http://www.pnas.org/content/108/28/11320.short?rss=1
-
Hillis, elected to the National Academy of Sciences in 2008, has devoted his research career to phylogeny, the study of evolutionary relationships. His work tackles some of the greatest questions of evolutionary biology: How do species arise? How do genes diversify and acquire new functions? How do pathogens evolve, and how can that information be used to understand diseases? And ultimately, can we reconstruct the complete Tree of Life and use that information to help make predictions about biology?

Before the Padieu case, Hillis and colleagues had used phylogeny to determine the degree of relatedness among HIV carriers. However, in the Padieu case, prosecutors needed to show that the HIV traveled from Padieu to his victims, rather than the other way around. HIV was known to infect each host with billions of virions. However, when the virus travels from a source to recipient, a genetic bottleneck occurs and typically only one of those virions makes the jump into the new host. Because the virus evolves rapidly, Hillis’ team was able to show that six of the samples were derived from the seventh. In court, that seventh sample was revealed as belonging to Padieu ( 1).


12 de julio de 2011

VII Congreso Latinoamericano de Micología, Costa Rica


La Junta Directiva y el Comité Organizador del VII Congreso Latinoamericano de Micología (CLAM) de la Asociación Latinoamericana de Micología (ALM) tienen el placer de informarles que esta actividad se llevará a cabo del 18 al 21 de Julio del 2011 en San Pedro de Montes de Oca, Costa Rica.

Me resultò dificil buscar ponencias sobre sistemàtica en el PDF del Programa, pues la estructura es por grupos taxonomicos, las ponencias no estan ordenadas por disciplinas. Asi que hay conferencias sobre sistematica casi en cada bloque del programa todos los dias!

Entre muchos simposia, uno que encontre sobre filogenia es el siguiente:
Martes 19 de Julio: Taxonomía y Filogenia de Basidiomycota
(10:00 – 11:30 am, 2:30 – 3:30 pm) Coordinadores: Mario Rajchenberg y Tatiana Gibertoni
10:00 – 10:30 am *Terry W. Henkel, M. Catherine Aime Steven L. Miller, Matthew E. Smith Rytas Vilgalys. Ectomycorrhizal fungal diversity of Dicymbe-dominated forests in the Guiana Shield.
10:30 – 10:45 am Darío Javier Cruz Sarmiento J.P. Suárez, I. Kottke, M. Piepenbring F. Overwinkler. Definiendo especies de Tulasnella correlacionando morfología y secuencias de rnDNA (ITS-5.8S) desde basidiomas en un bosque Tropical Andino.
10:45 – 11:00 am Meike Piepenbring, Roland Kirschner Fabian Nold, Tanja Trampe
Revisión del género Graphiola - microhongos curiosos parásitos de palmas.
11:00 – 11:15 am Dolores González Diversidad y sistemática en el complejo de especies del hongo fitopatógeno Rhizoctonia solani (Ceratobasidiaceae: Basidiomycota)
11:15 – 11:30 am Juliano Marcon Baltazar Mario Rajchenberg Rosa Mara B. da Silveira Corticiaceae s.l. (Basidiomycetes) del Sur de Brasil: estado actual de su conocimiento y desafíos
11:30 – 12:00 pm *Mario Rajchenberg Sexo, comida y comportamiento de los Políporos su relación con la filogenia. (Cont… 2:30 – 3:30 pm

Sitio web del congreso: http://almic.org/alm/esp/congreso.html

4 de julio de 2011

Curso Internacional “Bioinformatics for Phylogenetic Reconstruction in Virology”, Buenos Aires

Curso Internacional / International Workshop

“Bioinformatics for Phylogenetic Reconstruction in Virology”

Hospital de Pediatría S.A.M.I.C.“Prof. Dr. Juan P. Garrahan” Buenos Aires, Argentina

3 – 7 de Octubre , 2011

ORGANIZADORES CIENTÍFICOS / SCIENTIFIC ORGANIZERS:

Dra. Luisa Sen, Dra. Paula Aulicino, Dra. Andrea Mangano,

Dr. Carlos Rocco ( Laboratorio de Biología Celular y Retrovirus)

.COORDINADORA / COORDINATOR:

Dra. Paula Aulicino

.DIRIGIDO A / DIRECTED TO:

Bioquímicos , Licenciados en Biología, Biotecnología, Genética y profesionales de áreas afines de países latinoamericanos / Young investigators with a degree in Biology, Biotechnology, Biochemistry and related areas who are currently doing their Master, Ph.D. thesis, or similar in a laboratory from Latin America.

MAS INFORMACIÓN EN EL SITIO WEB DEL CURSO




15 de junio de 2011

Inicia el Lab de Epigenética y Biología del Desarrollo (INBIOTECA) de la Universidad Veracruzana

A principios de este año, inició actividades el Laboratorio de Epigenética y Biología del Desarrollo en el Instituto de Biotecnología y Ecología Aplicada (INBIOTECA) de la Universidad Veracruzana.

Informes: Dr. Mario Alberto Arteaga-Vázquez

El blog del Lab esta aqui:
http://paramutation.blogspot.com/

13 de junio de 2011

"Fungal phylogenomics: Getting lost in the moldy forest." on Phyloseminar.org



Jason Stajich speaks Wednesday, June 29th at noon PST on "Fungal phylogenomics: Getting lost in the moldy forest."

Fungi occupy diverse ecological niches in roles from nutrient cycling in rainforest floors to aggressive plant and animal pathogens. Molecular phylogenetics has helped resolve many of branches on the Fungal tree of life and enabling studies of evolution across this diverse kingdom. The genome sequences from hundreds of fungi now permit the study of change in genes and gene content in this phylogenetic context and to connect molecular evolution with adaptation to ecological niches or changes in lifestyles. I will describe our work in studies contrasting pathogenic and non-pathogenic fungi and efforts to unravel the evolution of multicellularity in fungi comparing unicellular basal fungi with multicellular mushrooms and molds.

The development of tools for data mining and use of fungal genomics is also driving the pace of molecular biology and genetics of fungi. I will highlight new approaches to make this easier and the ways data integration can inform and transform studies of functional biology of fungi.

http://phyloseminar.org./

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