Estancia postdoctoral en epigenetica vegetal, Mexico

Postdoctoral Position (epigenetics, Arabidopsis) : Irapuato, Guanajuato, México

Cinvestav-Guanajuato (http://www.ira.cinvestav.mx)

Irapuato, Guanajuato, México

The Chromatin and Epigenetics Lab of Dr. Raúl Alvarez (Department of Genetic Engineering at Cinvestav-Guanajuato) is seeking applications from highly motivated scientists for a postdoctoral position.
The successful applicant will conduct research on plant epigenetics, in the context of furthering understanding plant-pathogen interactions.

Applicants should have some experience in one or more of the following systems: miRNAs, epigenetics, microarrays, Y2HS, ChIP. Experience on plant molecular biology (Arabidopsis) would be an advantage.

Salary Details:

Postdoctoral salary (at standard rates) will be paid in mexican pesos (no relocation expenses).

Application Details:

Prospective applicants should send an e-mail (via the contact link below) outlining your research interest and motivations, including your C.V. (please list publications and experimental skills) contact details and e-mail addresses for 3 referees to:

Dr. Raul Alvarez Venegas
Profesor Investigador
Cinvestav Campus-Guanajuato
Departamento de Ingenieria Genetica
Km. 9.6 Libramiento Norte, Carretera Irapuato-Leon
C.P. 36821, Irapuato, Guanajuato, México
Tel. 52(462)6239678
ralvarez@ira.cinvestav.mx
http://raul.alvarez0.googlepages.com/
http://www.ira.cinvestav.mx/?id=53

Systematics meeting of BioSyst EU 2009

10-14 August 2009
Leiden, The Netherlands

Currently, several symposia are being considered, dedicated a.o. to Microbial systematics, Flower morphology, Species circumscription and concepts. Workshops will be dedicated a.o. to Annonaceae, Web-based taxonomy, Bryophyte evolution. During or adjacent to the symposium, training sessions will be given for the EDIT Scratchpads (limited attendance)

We invite you to submit an abstract. Registration is open as well and please note that the early fee is applicable until June 30, 2009

See you in Leiden, Peter Hovenkamp

primers4clades: un servidor web para el diseño automatizado de primers de PCR taxon-específicos guiado por áboles filogenéticos

Estimados colegas filogenetistas y evolucionistas, les escribo para informarles que hemos liberado al dominio público el servidor web primers4clades.


Es un servidor de fácil manejo, totalmente automatizado, útil en el diseño de primers de PCR para estudios metagenómicos y/o de diversidad.

Se trata de una herramienta para ayudar en el diseño de primers de PCR taxon-específicos, o clado-específicos para genes condificantes de proteínas (con o sin intrones, es decir de bacterias o eucariontes) a partir de alineamientos múltiples y árboles filogenéticos. Las parejas de oligos encontradas para un conjunto de secuencias enviadas por el usuario son ordenadas en función de un parámetro compuesto de calidad", basado en criterios termodinámicos de los oligos y en el contenido de información filogenética del conjunto de amplicones.

Hemos preparado una documentación muy detallada sobre los requisitos de los datos de entrada, opciones de cómputo, interpretación de resultados, un análisis estadístico a escala genómica del comportamiento del servidor y dos estudios de caso. Además hay tres conjuntos de datos disponibles directamente desde el servidor, para poderlo probar rápida y cómodamente.

El servidor corre en dos espejos, uno en el CCG/UNAM-México y otro en la EEAD/CSIC - España.

Tambien encuentran ligas a estas URLs desde mi sitio web personal, donde además encontrarás muchos tutoriales en español sobre biocómputo, bioinformática y filogenética.

Todavía no tenemos una publicación, pero el Editor del “server issue” de la revista Nucleic Acids Research, nos respondió positivamente para enviar el manuscrito a finales de mes, por lo que esperamos sea publicado en el mes de Julio. La referencia provisional está aquí.

Esperamos que esta herramienta les sea de utilidad y agradeceríamos tus comentarios y sugerencias sobre mejoras al mismo o a la documentación, surgidas en base a tu experiencia en el manejo de primers4clades.

Me despido deseándoles un feliz y productivo 2009!!!

Pablo Vinuesa,
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM,
México