Systematics meeting of BioSyst EU 2009

10-14 August 2009
Leiden, The Netherlands

Currently, several symposia are being considered, dedicated a.o. to Microbial systematics, Flower morphology, Species circumscription and concepts. Workshops will be dedicated a.o. to Annonaceae, Web-based taxonomy, Bryophyte evolution. During or adjacent to the symposium, training sessions will be given for the EDIT Scratchpads (limited attendance)

We invite you to submit an abstract. Registration is open as well and please note that the early fee is applicable until June 30, 2009

See you in Leiden, Peter Hovenkamp

primers4clades: un servidor web para el diseño automatizado de primers de PCR taxon-específicos guiado por áboles filogenéticos

Estimados colegas filogenetistas y evolucionistas, les escribo para informarles que hemos liberado al dominio público el servidor web primers4clades.


Es un servidor de fácil manejo, totalmente automatizado, útil en el diseño de primers de PCR para estudios metagenómicos y/o de diversidad.

Se trata de una herramienta para ayudar en el diseño de primers de PCR taxon-específicos, o clado-específicos para genes condificantes de proteínas (con o sin intrones, es decir de bacterias o eucariontes) a partir de alineamientos múltiples y árboles filogenéticos. Las parejas de oligos encontradas para un conjunto de secuencias enviadas por el usuario son ordenadas en función de un parámetro compuesto de calidad", basado en criterios termodinámicos de los oligos y en el contenido de información filogenética del conjunto de amplicones.

Hemos preparado una documentación muy detallada sobre los requisitos de los datos de entrada, opciones de cómputo, interpretación de resultados, un análisis estadístico a escala genómica del comportamiento del servidor y dos estudios de caso. Además hay tres conjuntos de datos disponibles directamente desde el servidor, para poderlo probar rápida y cómodamente.

El servidor corre en dos espejos, uno en el CCG/UNAM-México y otro en la EEAD/CSIC - España.

Tambien encuentran ligas a estas URLs desde mi sitio web personal, donde además encontrarás muchos tutoriales en español sobre biocómputo, bioinformática y filogenética.

Todavía no tenemos una publicación, pero el Editor del “server issue” de la revista Nucleic Acids Research, nos respondió positivamente para enviar el manuscrito a finales de mes, por lo que esperamos sea publicado en el mes de Julio. La referencia provisional está aquí.

Esperamos que esta herramienta les sea de utilidad y agradeceríamos tus comentarios y sugerencias sobre mejoras al mismo o a la documentación, surgidas en base a tu experiencia en el manejo de primers4clades.

Me despido deseándoles un feliz y productivo 2009!!!

Pablo Vinuesa,
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM,
México

Curso de Especialización en Biología Molecular

Curs d'Especialitzacio Biologia Molecular (IL3 - Universitat de Barcelona)

Tipo modalidad On-Line
Fecha de inicio Marzo 2009
Fecha final Agosto 2009

Este curso pretende dar una visión actual de la biología molecular, tanto desde el punto de vista de los conocimientos como de la tecnología que se utiliza en el laboratorio clínico y en investigación biomédica. El progreso de nuestro conocimiento sobre los seres vivos, debido a los avances en las tecnologías del DNA y del acceso a las secuencias de los genomas de numerosas especies, han tenido una influencia notable y han revolucionado muchas áreas de investigación, especialmente en biomedicina y biotecnología. La comprensión de los adelantos en el campo de la investigación biomédica requiere el conocimiento actualizado de los mecanismos moleculares responsables de la perpetuación y expresión del genoma y de la tecnología actual que se utiliza para investigación, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de diferentes patologías.

Programa académico
1. Genoma humano y Biología Molecular básica de la célula.
1.1. Antecedentes históricos y descubrimientos más relevantes.
1.2. El genoma humano.
1.3. Mecanismos de perpetuación de la información genética.
1.4. Mecanismos de protección de la información genética.
1.5. Transcripción y procesamiento de la información genética.
1.6. Control de la expresión génica.
1.7. Síntesis y degradación de proteínas.
1.8. Tráfico intracelular de proteínas.
1.9. Control de proliferación celular.
1.10 Bases moleculares de la apoptosis.

2. Técnicas de biología molecular.

3. Patología molecular y terapia génica.
3.1. Bases moleculares de la patología.
3.2. Bases genéticas de la patología.
3.3. Aplicaciones de la biología molecular al estudio del sistema nervioso.
3.4. Biología molecular del cáncer.
3.5. Terapia génica: conceptos y metodología.
3.6. Aplicaciones de la terapia gènica.

Contacto
Link mediante el que encontrará más información sobre nuestro Curso de Especialización en Biología Molecular.
http://www.il3.ub.edu/es/detail/course/814.html