La Red Nacional de Bioinformática tiene el agrado de invitar al
fecha:
lugar:
- Universidad Anáhuac del Mayab,
- Carretera Mérida-Progreso Km. 15.5 AP. 96 Cordemex, CP. 97310
- Mérida, Yucatán, México.
El curso será impartido por el Dr. Ernesto Perez-Rueda, Profesor de Instituto de Biotecnología de la UNAM.
Este evento esta dirigido a:
Profesionistas interesados en el área de la Bioinformatica, estudiantes de posgrado y/o Licenciaturas de carreras químico-biológicas, matemáticas y/o ciencias computacionales. El curso es teórico-practico.
El curso NO tiene costo alguno. Las inscripciones se cerraran el 18 de Junio. El cupo máximo es de 30 personas.
INSCRIPCIONES:
Enviar un mensaje antes del 15 de Junio a la dirección: bioinf.curso2009@gmail.com con el asunto ó “subject” Curso_2009, en donde se haga una solicitud expresa para asistir al curso. Se les pide enviar una breve descripción de su área de trabajo para organizar los grupos de trabajo.
ProgramaSesión 1 - lunes 22
- Introducción a las bases de datos
- Secuencias de nucleótidos: EMBL y Gene Bank
- Secuencias de aminoácidos: SWISSPROT
- Estructuras de proteínas y su clasificación: PDB, CATH, SCOP
Sesión 2 - martes 23
- Alineamientos de Secuencias
- Alineamientos en Pares: Smith-waterman, Needleman-Wunsch
- Búsqueda por similitud usando BLAST.
- Alineamiento múltiples: CLUSTAL, Tcoffee, muscle
- Las matrices de calificación: BLOSUM, PAM, y matrices basadas en clasificaciones de
- aminoácidos.
Sesión 3 - miércoles 24
- Filogenia Molecular
- Métodos basados en distancia
- Métodos basados en parsimonia
- Máximo Likelihood, Protpars, Protdist.
Sesión 4 - jueves 25
- Estructura de Proteínas y Función
- Identificación de dominios en proteínas: Superfamily, PFAM.
- Predicción de estructura secundaria: nnPredict, Predator, PHD, Psipred..
- Predicción de estructuras transmembranales.
Sesión 5 - viernes 26
- Predicción de Motivos funcionales
- Identificación de señales en el DNA y Proteínas
- Promotores, Operadores, activadores, Shine Dalgarno
- Motivos, Prosite, MEME, Wconsensus
Conferencias
1. Jueves 24 de junio, 17:00 hrs. Introducción a la computación cuántica. Dr. Salvador Venegas Andraca. Auditorio del CITI, Mérida, Yucatán.
2. Viernes 25 de junio, 17:00 hrs. Algoritmos cuánticos adiabáticos aplicados en el plegado de proteínas. Dr. Salvador Venegas Andraca. Auditorio del CITI, Mérida, Yucatán
Informes en bioinf.curso2009@gmail.com
Comité organizador
Dr. Ernesto Pérez Rueda. IBT@UNAM - eprueda@gmail.com - Instructor
Dr. Alberto Muñoz Ubando. Universidad del Mayab - luis.munoz@unimayab.edu.mx
Dra. Leticia Arena. UMDI@UNAM - arena.leticia@gmail.com
Biól. Javier Apodaca. UMDI@UNAM - javier.apodaca@gmail.com
