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20 de marzo de 2013

Próxima reunión de Biología Filogenética en México?

El 14 sería un buen año para celebrar la segunda reunión! Bueno ... cualquier año seria bueno, con tal de volver a reunirnos.
La 1ª. Reunión Mexicana de Biología Filogenética se celebró en Xalapa, Ver. durante Junio19-24, 2004.  La reunión fue financiada por el Instituto de Ecología AC, el Instituto de Biología, el Instituto de Ecología, el Instituto de Geología y la Fac de Ciencias de la UNAM, la UAM-Iztapalapa, la Universidad Veracruzana, Society of Systematic Biologists. Fue una reunión muy exitosa en la cual participaron al menos 150 asistentes provenientes de 17 instituciones y 39 dependencias nacionales y 25 instituciones de 10 países. La información, el programa, los conferencistas y una galería todavia podemos verla en unas páginas web guardadas en: http://www.filogenetica.org/reunion1.htm
Incluso todavia esta activo un blog exprofeso para la primera reunión en:
http://biologiafilogenetica.blogspot.com

La comunidad de investigadores y estudiantes aplicando métodos filogenéticos sin duda ha crecido. Ya es tiempo que despertemos y nos organicemos nuevamente para una segunda reunión. Ojala este llamado genere la iniciativa necesaria para poner en movimiento la organización de la siguiente reunión.
Agradeceré sus comentarios y sus propuestas aquí.
Saludos,
Efrain

21 de febrero de 2013

Taxonomy: no decline, but inertia

Taxonomy: no decline, but inertia

  1. Elise Tancoigne*,
  2. Alain Dubois
Article first published online: 8 FEB 2013
DOI: 10.1111/cla.12019
CLADISTICS

Abstract

The recent literature is rich in papers sounding the alarm about taxonomy. We analyzed data from the Zoological Record (1864–2010 and 1978–2010) to show that we cannot speak of a decline. The number of authors describing new species is growing, along with the number of articles describing new species and the number of new species. We also observed a growing interdisciplinarity and a change in the number of species described per author, suggesting that taxonomy is experiencing new ways of doing research. The modalities of these changes remain to be explored. It is therefore more pertinent to speak not of a decline, i.e. of a degradation relative to a previous situation, but of inadequacy relative to its objective, namely the scientific inventory and classification of the planet's living taxa.


4 de enero de 2013

USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA Y GENÉTICA DE POBLACIONES

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UNIVERSIDAD NACIONAL DE CÓRDOBA


CURSO DE POST-GRADO

USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA  Y GENÉTICA DE POBLACIONES


Unidad Académica Organizadora: Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución y Doctorado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba (Res. 951-T-2012).

Modalidad: Teórico-práctico

Duración: 45 hs. (40 presenciales, 5 no-presenciales).

Fecha de realización: 11 al 15 de marzo de 2013.
Lugar: Facultad de Ciencias Exactas, Av. Vélez Sarsfield 299. Córdoba.
Destinatarios: alumnos del doctorado en Ciencias Biológicas, egresados de la carrera de Biología y carreras afines (Cs. Agropecuarias, Lic. en Genética, etc.)
Responsable académico y administrador de los fondos: C. N. Gardenal

 

Cupo: 12 alumnos. En lo posible, traer notebook para llevar a cabo la parte de uso de programas de análisis de datos.


Arancel: $ 700. Alumnos inscriptos en el Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional de Córdoba,  $ 560.

Docentes participantes: Dres. C. Noemí Gardenal, Marina Chiappero, Beatriz García, Raúl González Ittig, Paula Rivera y Alicia R. Pérez.


OBJETIVOS

1. Conocer los principios, aplicaciones y limitaciones de las técnicas moleculares en Sistemática y en Genética de Poblaciones.
2. Conocer criterios que permitan seleccionar los marcadores más adecuados para resolver problemas taxonómicos a diferentes niveles (intra e inter-específico, a nivel de género y taxones superiores).
3. Recibir entrenamiento en la utilización de nuevas herramientas para el análisis de la biodiversidad, teniendo en cuenta la historia evolutiva de poblaciones y de especies.
4. Comprender el uso de diferentes programas de computación corrientemente utilizados para el análisis de datos.

PROGRAMA

1. Toma y conservación de muestras para la aplicación de diferentes técnicas. Manejo del laboratorio de Biología Molecular. Preparación y esterilizado de material. Práctica de pipeteo con micropipetas automáticas.
2. Fundamento de los métodos de extracción de ADN. Aislamiento de ADN de tejidos animales y vegetales.
3. Conceptos teóricos sobre la amplificación de segmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
4. Amplificación por PCR utilizando cebadores específicos: a) amplificación del gen citocromo b del ADN mitocondrial de especies del género Oligoryzomys (Rodentia: Sigmodontinae); b) amplificación de loci microsatélites (genoma nuclear) de especies de Calomys (Rodentia: Sigmodontinae).
5. Conceptos teóricos sobre la amplificación por PCR utilizando cebadores arbitrarios: ISSR  y AFLP. Amplificación de fragmentos ISSR en Myrcianthes cisplatensis (mato).
6. Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP): conceptos teóricos y análisis de geles. Digestión del gen cit b de varias especies de roedores sigmodontinos con enzimas de restricción.
7. Secuenciamiento. Alineación de secuencias.
8. Métodos de análisis. Tratamiento de los distintos tipos de datos. Construcción de matrices. Uso de programas como PAUP, Mr Bayes, jModeltest, Arlequin, Genalex y Structure.


BIBLIOGRAFIA BASICA

1.     Avise J C. 2004. Molecular markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York.
2.     De Salle, R., Giribert, G. y Wheeler, W. 2002. Techniques in Molecular Systematics and Evolution. Birkhäuser, Basilea.
3.     Hillis D M, C. Moritz, B K Mable. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Ass., Inc. Sunderland, Massachusetts.
4.     Freeland, J R. 2011, S D Petersen y H Kirk. 2011. Molecular Ecology. Wiley-Blackwell.
5.     Wiley E. O. y B S Lieberman. 2011. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. Wiley-Blackwell.
6.     Yang Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution, Oxford.
7.     Hoelzel, A R. 1992. Molecular Genetic Analysis of Populations. A practical approach. IRL Press. Oxford.

Trabajos en publicaciones periódicas empleados para Seminarios durante el curso: se actualizan anualmente.


Evaluación final: escrita, a cargo de C.N. Gardenal, R. González Ittig y M. Chiappero.


Informes y pre-inscripciones:
vía e-mail entre el 1º de febrero hasta el 1º de marzo de  2013
 marina.chiappero@gmail.com

Requisitos para la pre-inscripción:
- Curriculum Vitae de no más de 5 páginas,
- Carta de presentación explicando las motivaciones que lo llevan a realizar el curso.

Los alumnos que queden finalmente inscriptos recibirán la comunicación a más tardar el lunes 4 de marzo de 2012.

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