International Conference on Biodiversity Informatics

The Encyclopedia of Life and twelve other biodiversity research organizations are co-sponsoring e-Biosphere 09, an international conference that will take place in London on 1-3 June 2009.

Biodiversity Informatics is a young field that is making diverse classes of biodiversity data available online and putting these data to work for science and society. The Conference will highlight the accomplishments, capabilities and uses of Biodiversity Informatics and will gather community input for a 5-10 year research roadmap.

e-Biosphere 09 Conference Website

X Simposio Colombiano de Ictiología

Colombia: X Simposio Colombiano de Ictiología

La Asociación de Ictiólogos Colombianos ACICTIOS convoca a todos los ictiólogos nacionales e internacionales, a participar del próximo simposio de estudios en ictiología a realizarse en la ciudad de Medellín entre el 25 y 29 de mayo de 2009.

Esta será una oportunidad única para el encuentro de los investigadores, docentes y estudiantes provenientes de diferentes países americanos, que permitirá recoger y socializar los avances en el estudio de los peces tropicales, además de promocionar convenios de cooperación en investigación entre nuestros países.

La décima edición del tradicional encuentro de ictiólogos colombianos busca, desde cuatro temáticas fundamentales y dentro del contexto actual de afectación de los sistemas acuáticos, el brindar elementos importantes para el conocimiento de nuestros peces, sus prioridades de conservación y los posibles manejos. Es por esto que el Segundo Encuentro con ictiólogos venezolanos y el Primer Encuentro de Ictiólogos Suramericanos serán fundamentales para el afianzamiento de nuestras relaciones de cooperación y la participación de investigadores de países hermanos, potenciará futuros encuentros y acciones de investigación conjunta.

Esta versión del Simposio, ACICTIOS hace su homenaje al Dr. MIGUEL PETRERE Jr., uno de los ictiólogos más productivos, carismáticos y prolíficos en Suramérica, cuya semilla se encuentra dispersa en buena parte del continente americano.

La programación del simposio está dirigida a biólogos, ecólogos, ingenieros pesqueros y acuícolas, antropólogos, sociólogos, economistas e instituciones responsables por el manejo del recurso ictiológico, cuyo interés y quehacer diario se encamina al conocimiento, conservación y manejo de la ictiofauna. El evento contará con la participación de reconocidos investigadores en el área de los peces, quienes no solo ofrecerán conferencias magistrales sino también, dictarán cursos previos al simposio. Además se realizará la reunión bi-anual de los miembros de ACICTIOS y el encuentro de curadores de diferentes colecciones ictiológicas en Suramérica. Estamos seguros que este encuentro será una gran oportunidad para aprender un poco más sobre nuestros peces.

Mayores informes:

• Luz Fernanda Jiménez-Segura, Universidad de Antioquia
• Alexandra Arango, Universidad Católica de Oriente
• Néstor Mancera, Universidad Nacional de Colombia-sede Medellín

Estancia postdoctoral en epigenetica vegetal, Mexico

Postdoctoral Position (epigenetics, Arabidopsis) : Irapuato, Guanajuato, México

Cinvestav-Guanajuato (http://www.ira.cinvestav.mx)

Irapuato, Guanajuato, México

The Chromatin and Epigenetics Lab of Dr. Raúl Alvarez (Department of Genetic Engineering at Cinvestav-Guanajuato) is seeking applications from highly motivated scientists for a postdoctoral position.
The successful applicant will conduct research on plant epigenetics, in the context of furthering understanding plant-pathogen interactions.

Applicants should have some experience in one or more of the following systems: miRNAs, epigenetics, microarrays, Y2HS, ChIP. Experience on plant molecular biology (Arabidopsis) would be an advantage.

Salary Details:

Postdoctoral salary (at standard rates) will be paid in mexican pesos (no relocation expenses).

Application Details:

Prospective applicants should send an e-mail (via the contact link below) outlining your research interest and motivations, including your C.V. (please list publications and experimental skills) contact details and e-mail addresses for 3 referees to:

Dr. Raul Alvarez Venegas
Profesor Investigador
Cinvestav Campus-Guanajuato
Departamento de Ingenieria Genetica
Km. 9.6 Libramiento Norte, Carretera Irapuato-Leon
C.P. 36821, Irapuato, Guanajuato, México
Tel. 52(462)6239678
ralvarez@ira.cinvestav.mx
http://raul.alvarez0.googlepages.com/
http://www.ira.cinvestav.mx/?id=53

Systematics meeting of BioSyst EU 2009

10-14 August 2009
Leiden, The Netherlands

Currently, several symposia are being considered, dedicated a.o. to Microbial systematics, Flower morphology, Species circumscription and concepts. Workshops will be dedicated a.o. to Annonaceae, Web-based taxonomy, Bryophyte evolution. During or adjacent to the symposium, training sessions will be given for the EDIT Scratchpads (limited attendance)

We invite you to submit an abstract. Registration is open as well and please note that the early fee is applicable until June 30, 2009

See you in Leiden, Peter Hovenkamp

primers4clades: un servidor web para el diseño automatizado de primers de PCR taxon-específicos guiado por áboles filogenéticos

Estimados colegas filogenetistas y evolucionistas, les escribo para informarles que hemos liberado al dominio público el servidor web primers4clades.


Es un servidor de fácil manejo, totalmente automatizado, útil en el diseño de primers de PCR para estudios metagenómicos y/o de diversidad.

Se trata de una herramienta para ayudar en el diseño de primers de PCR taxon-específicos, o clado-específicos para genes condificantes de proteínas (con o sin intrones, es decir de bacterias o eucariontes) a partir de alineamientos múltiples y árboles filogenéticos. Las parejas de oligos encontradas para un conjunto de secuencias enviadas por el usuario son ordenadas en función de un parámetro compuesto de calidad", basado en criterios termodinámicos de los oligos y en el contenido de información filogenética del conjunto de amplicones.

Hemos preparado una documentación muy detallada sobre los requisitos de los datos de entrada, opciones de cómputo, interpretación de resultados, un análisis estadístico a escala genómica del comportamiento del servidor y dos estudios de caso. Además hay tres conjuntos de datos disponibles directamente desde el servidor, para poderlo probar rápida y cómodamente.

El servidor corre en dos espejos, uno en el CCG/UNAM-México y otro en la EEAD/CSIC - España.

Tambien encuentran ligas a estas URLs desde mi sitio web personal, donde además encontrarás muchos tutoriales en español sobre biocómputo, bioinformática y filogenética.

Todavía no tenemos una publicación, pero el Editor del “server issue” de la revista Nucleic Acids Research, nos respondió positivamente para enviar el manuscrito a finales de mes, por lo que esperamos sea publicado en el mes de Julio. La referencia provisional está aquí.

Esperamos que esta herramienta les sea de utilidad y agradeceríamos tus comentarios y sugerencias sobre mejoras al mismo o a la documentación, surgidas en base a tu experiencia en el manejo de primers4clades.

Me despido deseándoles un feliz y productivo 2009!!!

Pablo Vinuesa,
Centro de Ciencias Genómicas, UNAM,
México

Curso de Especialización en Biología Molecular

Curs d'Especialitzacio Biologia Molecular (IL3 - Universitat de Barcelona)

Tipo modalidad On-Line
Fecha de inicio Marzo 2009
Fecha final Agosto 2009

Este curso pretende dar una visión actual de la biología molecular, tanto desde el punto de vista de los conocimientos como de la tecnología que se utiliza en el laboratorio clínico y en investigación biomédica. El progreso de nuestro conocimiento sobre los seres vivos, debido a los avances en las tecnologías del DNA y del acceso a las secuencias de los genomas de numerosas especies, han tenido una influencia notable y han revolucionado muchas áreas de investigación, especialmente en biomedicina y biotecnología. La comprensión de los adelantos en el campo de la investigación biomédica requiere el conocimiento actualizado de los mecanismos moleculares responsables de la perpetuación y expresión del genoma y de la tecnología actual que se utiliza para investigación, diagnóstico, pronóstico y tratamiento de diferentes patologías.

Programa académico
1. Genoma humano y Biología Molecular básica de la célula.
1.1. Antecedentes históricos y descubrimientos más relevantes.
1.2. El genoma humano.
1.3. Mecanismos de perpetuación de la información genética.
1.4. Mecanismos de protección de la información genética.
1.5. Transcripción y procesamiento de la información genética.
1.6. Control de la expresión génica.
1.7. Síntesis y degradación de proteínas.
1.8. Tráfico intracelular de proteínas.
1.9. Control de proliferación celular.
1.10 Bases moleculares de la apoptosis.

2. Técnicas de biología molecular.

3. Patología molecular y terapia génica.
3.1. Bases moleculares de la patología.
3.2. Bases genéticas de la patología.
3.3. Aplicaciones de la biología molecular al estudio del sistema nervioso.
3.4. Biología molecular del cáncer.
3.5. Terapia génica: conceptos y metodología.
3.6. Aplicaciones de la terapia gènica.

Contacto
Link mediante el que encontrará más información sobre nuestro Curso de Especialización en Biología Molecular.
http://www.il3.ub.edu/es/detail/course/814.html