Bases metodológicas del uso de Grupo Externo en los análisis cladísticos

Keller Pérez, Roberto Andrés. 1998. Bases metodológicas del uso de Grupo Externo en los análisis cladísticos. Tesis de Licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. México DF. México. 81 pp.

El objetivo de este trabajo es muy concreto: entender las bases metodológicas del MGE bajo los estándares de la teoría cladista actual. Los capítulos primero y segundo tratan principalmente la parte teórica y operacional del método. En el primer capítulo se describe la manera en que opera el MGE y se discute las suposiciones de trabajo, las condiciones que el método requiere y sus resultados. En el segundo capítulo se explora la relación que el MGE tiene con el criterio de parsimonia, como concepto fundamental en la reconstrucción filogenética. Cada capítulo presenta una discusión alrededor de una idea particular y, por lo tanto, existe como una pieza independiente con su introducción, desarrollo, conclusiones y bibliografía. No obstante, todos los capítulos están unidos bajo los temas de la polaridad y el MGE. El orden que guardan estos dos capítulos es irrelevante para su lectura, aunque ambos se apoyan mutuamente uno en el otro. Sin embargo, el tercer capítulo no puede leerse de la misma forma que los dos anteriores. En este capítulo, a diferencia de los otros, no se realiza un análisis profundo de una idea, sino que se hace una revisión general de los métodos para polarizar caracteres.

Postdoctoral position in Plant Molecular Phylogenetics

Systematics of Sedges

A postdoctoral research position is available through an NSF-funded Systematics project on the systematics and evolution of chromosome number and genome size in Carex subgenus Vignea (Cyperaceae).
This study provides an excellent opportunity to explore the evolution of genome structure in a genus with holocentric chromosomes, one that displays a remarkable range of karyotypic diversity. The postdoctoral researcher will work primarily on molecular phylogenetic and cytogenetic aspects of the project, as well as phylogenetic comparative analysis. Responsibilities include field work in North America and China, molecular systematic lab work, chromosome counting, data organization and specimen handling for the project, analysis of molecular and cytogenetic / genome size data, meeting presentations, and manuscript preparation. Candidates are required to have a PhD in plant systematics or related field, with experience in conducting field work and in cytogenetic methods or methods of molecular systematics. Experience or interest in phylogenetic comparative analysis is strongly desired. The researcher will work at The Morton Arboretum with Dr. Andrew L. Hipp (The Morton Arboretum) and Dr. Eric H. Roalson (Washington State University). Information about The Morton Arboretum is available through the Arboretum's Web site <http://www.mortonarb.org/> and our lab web site <http://redwood.mortonarb.org/lab_pages/hipp>. The position is a two-year appointment, beginning 1 January 2009 (start date negotiable). Application review begins immediately and continues until the position is filled. To apply, submit via email a curriculum vitae, statement of research interests, and contact information for three references to: Andrew Hipp, The Morton Arboretum, 4100 Illinois Route 53, Lisle IL 60532-1293; Phone: 630-725-2094; fax: 630-719-2433; e-mail <ahipp@mortonarb.org>.

Polarizacion de caracteres y Papel del Grupo Externo

Como se realiza la polarización de los estados de los caracteres para definir cual de estos es el ancestral y cual el derivado? En ocasiones al leer literatura basica acerca de Cladistica me parece que una de las funciones del grupo externo es esta y que el proceso se realiza automáticamente a través del software seleccionado para el procesamiento de la matriz. Sin embargo, hay otros textos que explican procesos que me parecen basados en la experiencia del investigador y su criterio acerca de cual estado es ancestral y cual derivado.
¿Cual es el verdadero papel del grupo externo? He encontrado estudios de un mismo grupo en que los grupos externos son diferentes y por lo tanto los cladogramas presentan diferente topología. Pienso que a veces los investigadores manipulan la topología del cladograma cambiando el grupo externo.

La nueva Taxonomia Nueva

"Initiatives reinventing taxonomy for the Internet generation are leading to a dramatic resurgence in this once declining discipline.

Looking at the efforts of several groups to catalog the worlds biodiversity and make it accessible, this work discusses the future of descriptive taxonomy.

It covers such technology as DNA evidence and its applications, computer-assisted species identification, digital morphology, and E-typification. It also provides insight into effective ways of organizing taxonomic information, and discusses what benefits can be leveraged from a rapid growth of taxonomic knowledge."

Biogeografía Histórica

"Though biogeography may be simply defined--the study of the geographic distributions of organisms--the subject itself is extraordinarily complex, involving a range of scientific disciplines and a bewildering diversity of approaches. For convenience, biogeographers have recognized two research traditions: ecological biogeography and historical biogeography.

This book makes sense of the profound revolution that historical biogeography has undergone in the last two decades, and of the resulting confusion over its foundations, basic concepts, methods, and relationships to other disciplines of comparative biology. Using case studies, the authors explain and illustrate the fundamentals and the most frequently used methods of this discipline. They show the reader how to tell when a historical biogeographic approach is called for, how to decide what kind of data to collect, how to choose the best method for the problem at hand, how to perform the necessary calculations, how to choose and apply a computer program, and how to interpret results.

Text provides an overview of the revolution that historical biogeography has undergone in the last two decades, and of the resulting confusion over its foundations, basic concepts, methods, and relationships to other disciplines of comparative biology. Overviews fundamentals of frequently used methods of historical biogeography. For researchers and students of biology."

Se solicita Sistemático

El Área Académica de Biología de la Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, convoca a interesados en ocupar una plaza de Profesor-Investigador Titular de Tiempo Completo en el Laboratorio de Sistemática Animal del Centro de Investigaciones Biológicas.

Perfil.
El candidato deberá tener experiencia comprobable en artrópodos terrestres (hexápodos, diplópodos, quilópodos y/o arácnidos). Es importante que demuestre experiencia en identificación de los organismos de su grupo de estudio a distintos niveles taxonómicos, cuente con estudios en sistemática basados tanto en caracteres morfológicos como moleculares, así como experiencia en la formación y desarrollo de colecciones de artrópodos. Asimismo, es importante que tenga la capacidad de desarrollar investigación original en su línea de trabajo, además de producir publicaciones de calidad competitiva internacional, por medio del trabajo individual y en equipo.

Requisitos.
1. Contar con el grado académico de Doctor.
2. Tener publicaciones en revistas indexadas relacionadas con el área de su especialidad.
3. Contar con experiencia en docencia, así como en formación de recursos humanos a nivel de
licenciatura y/o posgrado.

Procedimiento.
Los interesados deberán entregar durante el período del 02 al 30 de Junio del 2008, la siguiente documentación:
1. Curriculum vitae actualizado con foto.
2. Carta de exposición de motivos en la cual exprese la razón de su interés por ocupar la plaza correspondiente y algunas ideas sobre posibles proyectos dentro de su línea de investigación.
3. Dos cartas de recomendación.

Las personas que a juicio del Consejo Académico de Investigación (CAI) del Centro de Investigaciones Biológicas (CIB-UAEH) reúnan satisfactoriamente las condiciones que se contemplan en la presente convocatoria, se citarán a una entrevista personal con el CAI, a la que deberán asistir. A la entrevista los citados deberán llevar sus documentos probatorios (dos juegos de copias) de grados académicos, publicaciones y otros considerados pertinentes para apoyar su caso. Los candidatos seleccionados deberán presentar una plática sobre alguno de los temas que ellos mismos desarrollen, a la comunidad académica del CIB-UAEH. Esta plática se desarrollará previa a la entrevista y tendrá una duración máxima de 45 min. Las decisiones tomadas por el CAI durante el proceso de selección serán inapelables.

La documentación requerida se hará llegar vía correo electrónico en formato MS Word y/o PDF, al siguiente contacto:

Dr. Víctor Manuel Bravo Cuevas
Secretario Académico
Centro de Investigaciones Biológicas
Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo
Teléfono (01) 771 71 72000 Ext. 6715
Fax (01) 771 71 72000 Ext. 2112
e-mail: vbravo@uaeh.edu.mx

Estancias de investigación en México

La agencia encargada de promover la ciencia en México, CONACYT, ha publicado una convocatoria para adjudicar financiamiento para estancias de investigación en dos modalidades: posdoctorales y periodos sabáticos.
La Convocatoria puede ser consultada en la pag web del CONACYT >aqui>>
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Otra convocatoria es la de la Secretaria de Relaciones Exteriores para ofrecer becas del gobierno de Mexico para extranjeros en diversas áreas inclusive Biologia Marina, Genetica y Biologia Molecular, Ecología, Recursos Naturales, Conservacion, Biodiversidad y Sistemática, Metodología de la Ciencia, Antropologia, etc. El PDF con la información completa esta >>AQUI>>

Postgrado: Master en Biodiversidad Tropical

Os anunciamos el lanzamiento del programa de Máster “Biodiversidad en Áreas Tropicales y su Conservación”. Se trata de un master oficial de un año de duración, con titulación de la Universidad Internacional Menéndez Pelayo (UIMP-Ministerio de Ciencia e Innovación de España), financiación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y qu se imparte en la Universidad Central del Ecuador (UCE). Participan profesores de 16 universidades e instituciones científicas de cinco países, y los alumnos pueden optar a becas y ayudas, cualesquiera sea su país de nacionalidad.

Las clases teóricas, seminarios, enseñanzas prácticas de laboratorio, debates y conferencias invitadas se desarrollarán en las instalaciones de la Universidad Central del Ecuador, del CLIRSEN y de las estaciones biológicas administradas por la propia UCE y por la Fundación Jatún Sacha, todo ello en uno de los países con mayor biodiversidad de todo el planeta: Ecuador.

La matrícula del programa cuesta 1300 euros ($2000 aprox.), que incluye todos los gastos del curso, incluidos los viajes internos a las reservas.

El programa permite continuar la carrera investigadora en los programas de doctorado, ya que, al ser oficial, el título está homologado a nivel europeo.

Toda la información, programa, preinscripción, precios, profesorado, becas... pueden encontrarse en la página del Máster.

Encuesta: que programa(s) usa?

Se les invita a participar en la encuesta sobre sus preferencias en el uso de programas para la reconstrucción filogenética.

Pueden elegir más de una respuesta. La lista de opciones y los resultados estarán disponibles hasta Agosto en la columna de la derecha. En la lista de opciones he incluido los programas más conocidos para tener una idea de las preferencias entre la comunidad.

Por favor, déjenme aquí sus comentarios y sugerencias. Especialmente útil sería saber cuales son los programas si alguien vota por las opciones "Otro parsimonia" u "Otro verosimilitud".

De antemano gracias por participar!
E

PD. También desde luego, puede sugerir otras encuestas!