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27 de octubre de 2011

No hay crisis, no estamos en extincion, ni somos ermitaños.

Ellos dicen que los taxónomos no estamos en peligro de extinción, ni somos ermitaños antisociales. Segun ellos, no hay crisis en la taxonomia! Esa es la conclusión de un estudio recientemente publicado en TREE:

Lucas N. Joppa, David L. Roberts, Stuart L. Pimm, The population ecology and social behaviour of taxonomists, Trends in Ecology & Evolution, Volume 26, Issue 11, November 2011, Pages 551-553, ISSN 0169-5347, 10.1016/j.tree.2011.07.010.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169534711002084

Entre varios análisis que presentan, uno me llama la atención: el numero de especies describibles e investigables por taxónomos esta decreciendo! ..... Yo ya aparte mi grupo ..... grrrrrr .... :))

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Esta es parte de la gráfica 1:

Trends over time in species discovery rates and taxonomic effort. (a) The number of species described per 5 years, (b) the cumulative number of species, (c) the number of taxonomists involved in species descriptions and the (d) species per taxonomists.

Segun esto, el número de especies descritas ha aumentado (A) y el de taxónomos se ha incrementado ..... exponencialmente! (C).

Siendo la referencia de partida los años 1800s, no me resulta sorprendente, ni creo que sea significativo este tipo de incrementos: todo se ha incrementado! No se cuales son los datos, ni de donde vienen, pues los datos no se presentan en el articulo. Pero se esperaría que los datos fueran de algún modo estandarizados, por ejemplo, numero de taxónomos proporcional a la población? Visto asi probablemente el numero de taxónomos no se ha incrementado tanto como otras cosas desde los 1800s!

PD:
Solo como un ejemplo reciente, lean esta nota sobre el estado de la taxonomia en Canada.
Taxonomy in trouble in Canada - November 18, 2010
.... y esta otra nota sobre la Taxonomia en Latinoamerica:
Análisis cienciométrico del estado de la Sistemática en Latinoamerica

Como ven?

21 de octubre de 2011

Encuesta: reunión de morfometría en México?

Existe la posibilidad de organizar una reunión de morfometría en México para el 2012. Queremos por este medio explorar el nivel de interes. Esperariamos que la ocasion fuera un foro para reunirnos biologos, antropologos , etc interesados en la morfometria tradicional y geometrica. Una reunion muy inclusiva. Ademas, por supuesto: quienes estarian interesados en ayudar en la organizacion?

La reunión seria en el formato de congreso con participaciones libres orales y posters. Incluiriamos una serie de cursos y talleres cortos sobre temas variados muy especificos a tareas de la investigacion morfometrica, los programas de computo mas comunes y las aplicaciones en varias areas (sistematica, filogenia, ecologia comparada, antropologia fisica, medicina, etc).

Para tener una estimacion del nivel de interes ponemos a su disposicion una encuesta en el blog Morfometria Geometrica. Ademas si esta interesado deje su comentario.

Fecha muy .... muy tentativa: verano del 2012, tres dias en Junio, Julio, o Agosto.

Cualquier pregunta, comentario, sugerencia, por favor usen el formulario de COMENTARIOS
Muchas gracias por su participación en la encuesta.

19 de octubre de 2011

Premio nacional de Ciencias 2010 a Gabriela Parra, IB, UNAM. Mexico


Un año tarde pero lo comparto. Es un gusto pasarles la excelente noticia sobre los Premios de Investigación de la AMC (México). Hoy me entero que el premio nacional en el área de Ciencias naturales 2010 fué para la Dra. Gabriela Parra Olea, del Instituto de Biologia. UNAM. Es un gusto por que la especialidad de ella es la sistemática. En la historia de los premios, pocos taxónomos han recibido esta distinción, por ejemplo en 2002 el Dr. Gerardo Perez Ponce de Leon.
Transcribo aquí la informacion presentada por la Academia Mexicana de Ciencias, en ocasion del premio hace un año:

La doctora Parra Olea nació en la Ciudad de México en 1967. Realizó sus estudios de licenciatura en la Universidad Autónoma Metropolitana, plantel Iztapalapa, donde obtuvo el título de Hidrobióloga en 1989. Los estudios de doctorado en Ciencias los realizó en la Universidad de California, Berkeley, USA, entre 1994 y1999 habiendo realizado la tesis: Molecular Evolution and Systematics of Neotropical Salamanders (Caudata: Plethodontidae: Bolitoglossini) bajo la asesoría del doctor David B. Wake. Entre 2000 y 2001 realizó una estancia posdoctoral en la Universidad de Harvard, Cambridge, USA, donde continuó sus estudios en sistemática molecular de salamandras neotropicales bajo la asesoría del doctor James Hanken, director del Museo de Zoología
Comparada de dicha Universidad.
En agosto de 2001, la doctora Parra ingresó a la planta académica
del Instituto de Biología de la UNAM como Investigadora Asociada C, para incorporarse a la planta académica de la Colección Nacional de Anfibios y Reptiles. En 2006 fue promovida a Investigador Titular A y al nivel D del programa de becas al desempeño de la UNAM (PRIDE) y en 2008 a la categoría de Investigador Titular B. Pertenece al Sistema Nacional de Investigadores desde 2002 y, en el año 2009, fue promovida al nivel II.
Las áreas de especialidad de la Dra. Parra son la Sistemática, Biología Evolutiva y Conservación de anfibios, con especial énfasis en las salamandras. Su programa de investigación incluye dos aspectos, el primero es sobre sistemática filogenética y taxonomía de salamandras neotropicales en el cual ha propuesto hipótesis
de relaciones filogenéticas y biogeográficas para diferentes grupos de salamandras, y además, ha contribuido a la descripción de la biodiversidad de este grupo de organismos en México, al haber descrito, hasta el momento, 14 especies nuevas. Las hipótesis
filogenéticas que la Dra. Parra ha propuesto han utilizado los métodos más modernos de análisis en sistemática, lo que incluye no sólo el uso de caracteres morfológicos, sino también, de manera importante, de marcadores moleculares. La combinación de ambos tipos de caracteres, la han llevado incluso a reconocer la existencia de al menos otras 30 especies de salamandras que están en proceso de ser descritas. El segundo aspecto de su programa de investigación se relaciona con el estado de conservación de los anfibios de México, mismo que ha cultivado en dos áreas distintas;
la primera se ha centrado en desarrollar estudios de genética de poblaciones para generar información de utilidad para establecer
políticas de conservación, mientras que la segunda área se ha dirigido hacia la detección de enfermedades infecciosas emergentes, mismas que están determinando en la actualidad un importante declive en las poblaciones de anfibios a nivel mundial,
donde México por supuesto no está exento. En particular, está estudiando el efecto de hongos patógenos causantes de la quitridiomicosis en especies de salamandras, incluyendo algunas de gran importancia para la conservación tales como el ajolote (Ambystoma mexicanum).
Su labor académica ha sido reconocida por diferentes organismos
nacionales e internacionales, al haber sido invitada, junto con otros expertos, a participar en paneles donde aspectos de sistemática,
y principalmente de conservación de anfibios, fueron discutidos. Como resultado de estas reuniones se publicaron dos artículos en la revista Science (2006, 2010). Sus proyectos de investigación
han recibido financiamiento a través de programas de diferentes instituciones nacionales y extranjeras, tales como PAPIIT-UNAM, SEP-CONACYT, CSIC-CONACYT (España-México) UC-MEXUS (USA-México) Grupo Rana (USA) y NSF (USA).
En cuanto a su productividad, la Dra. Parra cuenta hasta la fecha
con un total de 64 publicaciones, de las cuales 42 se encuentran
en revistas indizadas y de alto impacto en su área, incluyendo
tres en los Proceedings of the National Academy of sciences (PNAS). Además, cuanta con cinco capítulos de libros, todos internacionales.
Sus contribuciones han recibido hasta al momento un total de 420 citas. Ha presentado 40 trabajos en congresos nacionales e internacionales. En el año 2000 recibió el American Society of Ichthyologists and Herpetologists Stoye Award for best student presentation in Systematics, dentro de la American Society
of Ichthyologist and Herpetologist’s 80th Annual Meeting que fue realizado en La Paz, Baja California, México
En el rubro de formación de recursos humanos, ha dirigido tres tesis de licenciatura y seis de maestría. Actualmente, la Dra. Parra dirige una tesis de maestría, dos de doctorado y cuenta con dos posdoctorados que obtuvieron sus respectivos grados académicos de la Universidad de California, Berkeley. Con respecto a la docencia, es profesora de la UNAM desde 2002, habiendo impartido hasta la fecha un total de siete cursos completos a nivel licenciatura, y cinco de posgrado. Adicionalmente ha impartido cinco cursos cortos, en diferentes instituciones de educación superior
del país. Ha participado en el Comité Tutoral de 13 alumnos
de maestría y siete de doctorado, seis sínodos para tesis de licenciatura, así como en el sínodo de tres exámenes de doctorado y en siete comités de examen de candidatura al grado de doctor.
Como complemento a su labor académica y su participación en la formación de recursos humanos, ha realizado labores de apoyo institucional, entre las cuales se destaca su participación como miembro del subcomité de admisión al posgrado en Ciencias Biológicas
en 2003, la organización de los seminarios del Instituto de Biología de 2007 a 2008 y, desde septiembre de 2009, y su papel como representante del personal académico del Departamento de Zoología ante el Consejo Interno del Instituto de Biología.

17 de octubre de 2011

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Querida comunidad de filogenetistas y biólogos evolutivos:
Nos es grato informarle que el Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-UNAM) y la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SOIBio), con el apoyo del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM), el Instituto de Biotecnología (IBt-UNAM), la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM) y EMBnet organizan los Talleres Internacionales de Bioinformática - 2012, que se llevarán a cabo del 16 al 27 de enero de 2012 en las instalaciones del CCG en Cuernavaca Morelos, México.
En la semana del 16 al 20 de Enero se impartirán 2 talleres de nivel básico dirigido a principiantes en el área. En la semana del 23 al 27 de Enero se ofrecerán 2 talleres especializados, uno dirigido a gente trabajando en análisis de datos generados por secuenciadores de nueva generación y otro para Administradores de Sistemas.
Para los detalles de los programas y procedimiento de registro, favor de visitar el sitio web del evento:
http://congresos.nnb.unam.mx

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International Workshop on Bioinformatics - January 2012

Dear community of phylogeneticists and evolutionary biologists:

We are pleased to announce that the National Node of Bioinformatics (NNB-UNAM) and the Iberoamerican Society of Bioinformatics (SOIBio), with support from the Center for Genomic Sciences (CCG-UNAM), the Institute of Biotechnology (IBT-UNAM), the Undergraduate Program in Genomics Sciences (LCG-UNAM) and the EMBnet, organize the “International Workshops on Bioinformatics – 2012” which will be held from January 16th to 27th, 2012 in the CCG facilities in Cuernavaca Morelos, Mexico.
Two Basic or introductory workshops will be offered during the first week (January 16th-20th), geared towards beginners in the field. Two advanced workshops will be offered during the second week (January 23rd to 27th), one designed for people working with data generated by next generation sequencers, and the other for System Administrators.

For the details on the programs and registration procedure, please visit the event website:
http://congresos.nnb.unam.mx

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