Curso de Posgrado: Análisis Cladísticos y su Aplicación en Paleontología

ASOCIACIÓN PALEONTOLÓGICA ARGENTINA: Cladística y Paleontología
Curso de Postgrado de la APA
Análisis Cladísticos y su Aplicación en Paleontología

Docente: Dr. Diego Pol (CONICET-Museo Paleontológico Egidio Feruglio, Trelew)
Duración: 5 días (40 horas)
Fecha: del 13/7/09 al 17/7/09
Lugar: Museo Argentino de Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” Av. Angel Gallardo 470, C1405DJR Ciudad Autónoma de Buenos Aires, TE 4982-6670

Mas informacion: Aqui>

Linux para filogenética: PhyLIS

Mac OS le parece caro? Windows .... caro y muy problemático? Bueno pues ahora sera más fácil adoptar Linux como sistema operativo en su investigación filogenética. No solo Linux es gratis sino mucho mas robusto y estable (al menos comparado con Windows), por lo cual en los últimos años este sistema operativo ha estado ganando popularidad, especialmente entre la comunidad científica.

Ahora el nivel de dificultad para instalar Linux y configurar la numerosa colección de programas ya disponibles para análisis filogenéticos ha disminuido significativamente con la disponibilidad de PhyLIS o "Linux Filogenético para Informática y Sistemática" (Phylogenetic Linux for Informatics and Systematics).
PhyLIS incluye dos componentes: el sistema operativo Linux y una colección básica de programas filogenéticos (los que han sido gratis). La configuración tanto del sistema operativo como de los programas incluidos ya esta lista para solo instalar y trabajar.
" ..... [PhyLIS] comes with most commonly used
phylogenetic software pre-compiled, installed,
and configured, which allows this software to
be executed by simply typing the appropriate
command (Table 1). PhyLIS also contains popular
scripting languages (and appropriate phyloinformatic
packages) including Perl (with BioPerl), Python
(with BioPython), and R (with several packages).
It implements parallel versions of several particularly
processor-intensive programs using MPI (including
BEST,4 MrBayes,5 and raxML).6 PhyLIS aims to
present a complete phylogenetic workbench for all
steps of analysis from sequence data manipulation to
alignment and tree search, including visualization (for
alignments and trees), model selection, divergence
time estimation, macroevolutionary analyses and
tools for automation and batch analysis." (Thomson, 2009).

Si aun no ha entrado al mundo Linux, esta es una muy buena oportunidad.

Para bajar el archivo de instalacion ISO ingrese al sitio web de PhyLIS.

Referencia:
Thomson RC. 2009. PhyLIS: a simple Gnu/Linux distribution for phylogenetics and phyloinformatics. Evolutionary Bioinformatics. 5:91-95 (Link)

Curso de Introducción a la Filogenia Molecular de Microorganismos

Introducción a la Filogenia Molecular de Microorganismos
Curso a realizarse en la Facultad de Ciencias Naturales y Museo
UNLP
Argentina

Fecha: Del 19-10-2009 hasta 24-10-2009.	Horario: L. a V.9:30 a 13-14:30 a 19:30.Sab. 9 a 13
Modalidad: Presencial con evaluación final
Duración: 50 horas.
Cupo de teoría: 25 alumnos.	Cupo de práctica: 25 alumnos.
Arancel para alumnos internos: $350	Arancel para alumnos externos: $450

Mas informacion:
http://postgrado.fcnym.unlp.edu.ar/postgrado/index_pg.html

CONGRESO DE LA SOCIEDAD MESOAMERICANA PARA LA BIOLOGÍA Y LA CONSERVACIÓN (SMBC)

Se ha distribuido la II Circular del XII Congreso Regional de la Sociedad Mesoamericana para la Biología y la Conservación que este año tendrá como sede Belize del 26 al 30 de Octubre, y cuyo lema es '' Conservation Challenges in a Rapidly Shrinking Planet''

Contenido de la Segunda Circular:
¿Qué es la SMBC?
¿Qué es el Congreso de la SMBC?
El XIII Congreso de la SMBC
Sede
Programa Académico
Actividades no-Académicas
Áreas Temáticas
Instrucciones para presentar propuestas para simposios y otros eventos especiales
Guía para presentaciones
Instrucciones para el envío de resúmenes de ponencias orales y carteles
Inscripción al Congreso
Fechas Importantes
Información de contacto del Comité Organizador
Membresía a la SMBC

Inscripción y envío de resúmenes en línea a partir del 22 de mayo.
www.msbcbelize2009.com

Visiten nuestro portal oficial para conocer algo de nuestra historia.

www.sociedadmesoamericana.org

Lic. Carlos Armando Mondragòn

Presidente del Capìtulo de Honduras

Sociedad Mesoamericana para la Biologìa y la Conservaciòn

(504) 33 65 85 64

honduras@sociedadmesoamericana.org

amondragon@smbchn.com

www.msbcbelize2009.com

www.sociedadmesoamericana.org

Multiple Means Of Identifying Species Better Than DNA Barcoding Alone

Multiple Means Of Identifying Species Better Than DNA Barcoding Alone

Esta nota es respecto al articulo reciente en AJB sobre los problemas en las papas.

Muy ilustrativo de un punto de vista cada vez mas moderado y cauteloso sobre los peligros de enfatizar los códigos de barras de DNA como "la solución" a la identificación taxonómica.

Resucitará la Taxonomia en China?

China Searches for an 11th-Hour Lifesaver for a Dying Discipline -- Jiao 325 (5936): 31 -- Science
Una nota reciente en Science 3 July 2009 describe la urgente necesidad de revitalizar la investigación taxonómica en China. Como lo estan haciendo?
La receta incluye tomar una posición clave en las instituciones para el financiamiento de la ciencia. Resulta que el Presidente de NSFC, la agencia principal de financiamiento de ciencia basica en China, es Chen Yiyu, un taxonomo. La segunda parte es aventar dinero, mucho dinero $500,000 dolares a los taxónomos. Y se anuncia que para 2010 viene mas dinero!

La tercera y cuarta parte son dos argumentos cuestionables: evaluación especial para taxónomos y voltear a la taxonomía molecular. Se propone que los taxónomos deberían ser evaluados con otros estándares, en vez de contar artículos publicados en revistas de impacto y numero de citas. Le han hecho caso a Chen? Parece que si! Algunas instituciones ahora evalúan a los taxonomos por las monografias que producen, no el factor de impacto. Es la solucion?

Chen identifica el cuarto ingrediente: el futuro de la taxonomia mejorará si se incluyen métodos de la biología molecular, por ejemplo el uso de DNA barcodes para identificación de especies. Según Chen es tiempo de que la taxonomía clásica en China avance: "El periodo de los taxónomos simplemente identificando especies ya ha pasado".

Su visión contempla taxónomos trabajando junto a biólogos moleculares rejuveneciendo la taxonomía en China.

Treevolution: análisis visual de árboles filogenéticos

Treevolution es una herramienta para visualizar árboles filogenéticos dotada de una gran interacción. Los árboles son representados mediante dendrogramas circulares, pudiendo modificar el tamaño de los sectores o anillos.

Además, podemos seleccionar familias y representarlas mediante dendrogramas lineales o generar estadísticas del árbol.

La idea subyacente es facilitar la navegación e inspección del árbol, incluso aunque este sea bastante grande.

Treevolution puede descargarse de manera gratuita aquí
Puedes citar Treevolution referenciando su artículo en Bioinformatics

Treevolution es una creación del grupo VisUsal en la Universidad de Salamanca (España)


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Treevolution is a highly interactive tool to visualize philogenetic trees. The trees are represented by means of radial dendrograms, allowing to modify the size of sectors and rings.

In addition, you can select clades and represent them as linear dendrograms, or generate tree statistics.

The main goal of this tool is to facilitate the navigation and inspection of phylogenetic trees, even if they are large.

Treevolution is available to download here
You can cite Treevolution with this paper on Bioinformatics

Treevolution is credited by the VisUsal group from the University of Salamanca (Spain)

Curso de Dibujo Científico Botánico. Chiapas

Curso
Dibujo Científico Botánico

Impartido por:

Elvia Esparza

21 al 26 de septiembre de 2009

CUPO LIMITADO

Costo de recuperación $ 2, 500.00

Incluye material

El lenguaje de las imágenes
Las imágenes tienen un papel muy importante para una completa comunicación. En el trabajo taxonómico y biológico en donde se estudian los caracteres de un organismo, en un contexto evolutivo; este texto descriptivo tiene un lenguaje llano con un vocabulario especializado, es donde, las imágenes complementan y dan soporte para una mejor comprensión.
Una buena ilustración puede derribar las barreras lingüísticas.

Programa del curso:
Este curso se desarrollará de manera presencial, con exposiciones y una activa participación de los estudiantes elaborando ejercicios.
La temática consiste desde el conocimiento de materiales, trazos básicos, griseados y degradados, la comprensión y manejo de la perspectiva, así como de las escalas, para abordar la técnica de entintado y la realización de ilustraciones.

Instructores:

• Elvia Esparza Alvarado, Dibujo Científico, Instituto de Biología, UNAM
• M.C. Silvia Erika Pérez Parra, Asistente
• Dr. Mario Ishiki Ishihara, Coordinador

Informes e inscripciones

Isabel R. Vázquez Lara
Herbario
Tel. 9676749000 Ext. 1307

Dr. Mario Ishiki Ishihara
Herbario
Tel. 9676749000 Ext. 1319

M. C. Gerardo González Figueroa
Coordinación de Educación Continua
Tel. 9676749000 Ext. 1741, 42 y 43