"1er Curso Básico de Cladística y Métodos en Filogenia"- realizado en Quito, Ecuador

1er curso "PRINCIPIOS BASICOS TEORICOS DE CLADISTICA Y METODOS DE FILOGENIA:

Desde la morfología hasta el ADN" 

Foto de los participantes, Prof Washington Benitez (Director del Centro Internacional de Zoonosis, Universidad Central del Ecuador, sede del curso) y Prof Juan-Carlos Navarro

Universidad Central del Ecuador (UCE)

Centro Internacional de Zoonosis (CIZ)

Proyecto Prometeo-Senescyt

CURSO:

PRINCIPIOS BASICOS TEORICOS DE CLADISTICA Y METODOS DE FILOGENIA:

Desde la morfología hasta el ADN.

26 Abril – 14 Junio 2013[1]

 

Coordinador Científico: Prof. Washington Benítez-Ortiz Ph.D.

Coordinador Académico: Prof. Juan-Carlos Navarro, Ph.D, Investigador Prometeo-Senescyt-INSPI-CIZ-UCE / (Universidad Central de Venezuela)

Lugar: Auditorio 2 / CIZ-UCE

Número de horas:  TOTAL 46 horas

21 horas teóricas

15 horas práctica

10 horas consultas e informes

Aval Académico: Instituto Universitario de Capacitación Pedagógica

 

OBJETIVO GENERAL

 

Iniciar al participante en los conceptos, filosofía y práctica de la Cladística como método de inferencia evolutiva para estudios y análisis de filogenia, así como sus aplicaciones en las diferentes áreas de la Biología general.

JUSTIFICACION

Diversas áreas de la Biología requieren estudios para inferir patrones evolutivos. Esto permite la definición de patrones taxonómicos, clasificaciones naturales en sistemática, así como inferencia en patrones evolutivos en biogeografía, ecología y comportamiento, en diferentes dominios de proteínas, organismos vivientes y en el desarrollo de enfermedades emergentes (epidemiología molecular).

El uso caracteres morfológicos y morfométricos, de comportamiento y ecológicos, así como el uso de secuencias de ADN y de Aminoácidos pueden ser incorporados en estudios evolutivos filogenéticos mediante métodos explícitos, reproducibles y comprobables como la CLADISTICA para obtener hipótesis evolutivas en grupos animales, vegetales y microorganismos.

Por estas razones, la aplicación de métodos filogenéticos (cladísticos) son útiles para estudiantes y profesionales en diferentes áreas de la Biología, Medicina, Agronomía y Veterinaria.

En la mayoría de los pensa de Biología en muchos países existe la posibilidad de que el estudiante adquiera una formación en ésta área de la sistemática con todas las aplicaciones señaladas, siendo cada vez mas importante en el ámbito científico general. Este curso proporcionará los aspectos filosóficos, técnicos teóricos básicos cladísticos de una manera holística, ofreciendo al estudiante los conocimientos básicos y sus aplicaciones, con la posibilidad de interpretación y discusión de artículos en el área, así como de propuestas o ideas de tesis y proyectos de investigación. Igualmente se introducirá al participante en otros métodos utilizados como los algoritmos inductivos (Máxima Verosimilitud y análisis Bayesianos).

PROGRAMA SINÓPTICO

I.               Introducción Semana 1

II.              Bases Teóricas de Cladística Semana 1

III.            Codificación de Caracteres Semana 2

IV.            Determinación de la Polaridad de Caracteres Semana 2

V.              Construcción de Árboles Semana 3

VI.            Estimadores y Estadísticos en Árboles Semana 3

VII.           Cladística y ADN: Teoría y métodos Semana 4

VIII.         Métodos alternativos a la Parsimonia Semana 5

IX.            Bioinformática y utilización de software (demostrativo) Semana 5

X.              Aplicaciones de la Cladística, discusión de trabajos publicados

(Morfología, ADN; aplicaciones en Zoología, Botánica, Ecología,

Comportamiento, Bioquímica, Virología, Epidemiología) y

Proyectos de Tesis e Investigación Semana 6/7

XI.            Clausura Semana 7

CONTENIDO PROGRAMATICO

I. INTRODUCCION

Taxonomía alfa, beta y gamma. Nomenclatura Zoológica. Concepto de especie, discusión. Escuelas de Sistemática, discusión. Hennig y la sistemática filogenética.

II. BASES TEORICAS DE CLADISTICA

Homología y analogía, similaridad especial. Conflicto entre similaridad y parsimonia. Homoplasia. Monofilia, parafilia y polifilia. Grupos hermanos y relaciones ancestro-descendencia. Discusión sobre el método evolucionista, fenético y filogenético.

III. CODIFICACION DE CARACTERES

Tipos de caracteres. Caracteres binarios y multiestado. Series de transformación. Caracteres ordenados y desordenados. Aditivos y no-aditivos.

IV. DETERMINACION DE LA POLARIDAD DE CARACTERES

Polaridad y mitos sobre la polaridad de caracteres. Determinación de polaridad, métodos a priori y a posteriori.

V. CONSTRUCCION DE ARBOLES

Construcción de matrices. Distancia. Parsimonia: tipos de parsimonia. Transformaciones aceleradas y retardadas. Optimización de caracteres y de “datos perdidos”. Algoritmos exactos y heuristicos. Enraizamiento.

VI. CONFLICTO DE CARACTERES. ESTIMADORES Y ESTADISTICOS EN ARBOLES

Estadisticos. Valores de confiabilidad. Arboles de consenso. Alternativas a la parsimonia. Repesado. Re-evaluación de caracteres y taxa.

VII. CLADISTICA Y ADN: Teoría y métodos

Homología, similaridad, pruebas de homología. Nucleótidos y aminoácidos como data: substituciones, gaps, alineamientos de secuencias. similaridad vs homología.

VIII. METODOS ALTERNATIVOS A LA PARSIMONIA.

Maxima verosimilitud, Análisis bayesianos. Uso de reloj molecular en estimación de tiempos de divergencia.

IX. APLICACIONES DE LA CLADISTICA

Taxonomía, sistemática, comportamiento, ecología, coevolución, epidemiología, biogeografía, filogeografía.

XI. DISCUSION. APLICACIÓN DE LOS CONOCIMIENTOS ADQUIRIDOS. EVALUACION.

BIBLIOGRAFIA BASICA

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•      Russo Matioli S. 2001.  Biologia Molecular e Evolucão. Holos Editora Ltda Riberão Preto, SP, Brasil.
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•      Wheeler, W.C. 2012. Systematics: A course of Lectures. John Wiley & Sons, Ltd, West Sussex, PO19 8SQ, UK. 452 pp.

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[1] NOTA: El curso se llevó a cabo los días viernes entre el 26 de abril y el 14 de junio.