The state of teaching in taxonomy and systematic biology: A survey

We are writing to invite you to participate in a survey on the state of teaching in taxonomy and systematic biology.  If your area of expertise  and interest lies outside of this discipline, you may simply ignore this invitation or perhaps forward it to an appropriate colleague.

We are conducting the survey as independent scholars and are not representing any institution or organization.    An article by Costello et al. earlier this year ("Can we name earth's species before they go extinct?", Science 339: 413) painted an optimistic picture that seems at odds with many papers over the past decade claiming a decline in taxonomy and systematic biology.   We were unable to find recent data supporting either claim and decided that it would be of value to the community to gather some basic data.  Our intent is to summarize and make the data available to the community in a brief publication.

Our examination of the state of teaching is obviously only one facet of a complex issue, but having the results of this survey will, we hope, help.  We have asked you to identify your institution so that we can detect multiple responses from any single source.  We will not identify you or your institution in our published results.

The survey instrument may be found at:  https://www.surveymonkey.com/s/systematicbiologyteaching

Thank you in advance for your participation in the survey,

Andrew Brower
Quentin Wheeler
Elizabeth Yockey

Phylogenetics: Heed the father of cladistics

• Quentin Wheeler,
• Leandro Assis
• & Olivier Rieppel

FROM: Nature 496, 295–296 (18 April 2013)
doi:10.1038/496295a
Published online 17 April 2013
 

IN On the Origin of Species, Charles Darwin proclaimed that “our classifications will come to be, as far as they can be so made, genealogies”. That turned out to be easier said than done. Even as late as the 1970s, biologists were still grouping animals and plants largely on the basis of overall physical similarity and whether they possessed or lacked certain traits, such as a backbone or the ability to produce flowers.
The German entomologist and palaeontologist Willi Hennig transformed the classification of organisms into the rigorous science of cladistics^{1, 2, 3, 4, 5}. His book Phylogenetic Systematics⁶, published in 1966, laid out how to construct phylogenetic trees and how to use their branching patterns as the basis for classifications.
Paired with DNA sequencing, Hennig's theories revolutionized our understanding of the relationships among the nearly two million species known today. In the history of biological classification, the little-known Hennig arguably deserves a place alongside Aristotle, Carl Linnaeus and Darwin.

GERD HENNIG

Willi Hennig in 1960.

But two key messages from his book have been lost in the nearly half-century since it was published: the importance of detailed studies of the development and evolution of complex characters, such as the horn of a rhinoceros or the pincer of a fiddler crab; and the use of all relevant evidence — molecular, anatomical, fossil and developmental — in mapping evolutionary relationships. Too often these days, DNA information is favoured over everything else, and when conflicts arise between DNA-based analyses and those reliant on morphology, the former is frequently assumed to be correct, even though many uncertainties surround the molecular basis of evolution.
Hennig was born 100 years ago this week, on 20 April 1913. In celebration of his impact on phylogenetics and classification, we urge biologists to heed his call to embrace all the relevant data.

LEER MAS >

Próxima reunión de Biología Filogenética en México?

El 14 sería un buen año para celebrar la segunda reunión! Bueno ... cualquier año seria bueno, con tal de volver a reunirnos.
La 1ª. Reunión Mexicana de Biología Filogenética se celebró en Xalapa, Ver. durante Junio19-24, 2004.  La reunión fue financiada por el Instituto de Ecología AC, el Instituto de Biología, el Instituto de Ecología, el Instituto de Geología y la Fac de Ciencias de la UNAM, la UAM-Iztapalapa, la Universidad Veracruzana, Society of Systematic Biologists. Fue una reunión muy exitosa en la cual participaron al menos 150 asistentes provenientes de 17 instituciones y 39 dependencias nacionales y 25 instituciones de 10 países. La información, el programa, los conferencistas y una galería todavia podemos verla en unas páginas web guardadas en: http://www.filogenetica.org/reunion1.htm
Incluso todavia esta activo un blog exprofeso para la primera reunión en:
http://biologiafilogenetica.blogspot.com

La comunidad de investigadores y estudiantes aplicando métodos filogenéticos sin duda ha crecido. Ya es tiempo que despertemos y nos organicemos nuevamente para una segunda reunión. Ojala este llamado genere la iniciativa necesaria para poner en movimiento la organización de la siguiente reunión.
Agradeceré sus comentarios y sus propuestas aquí.
Saludos,
Efrain

Taxonomy: no decline, but inertia

1. Elise Tancoigne^*,
2. Alain Dubois

Article first published online: 8 FEB 2013

DOI: 10.1111/cla.12019

CLADISTICS

Abstract

The recent literature is rich in papers sounding the alarm about taxonomy. We analyzed data from the Zoological Record (1864–2010 and 1978–2010) to show that we cannot speak of a decline. The number of authors describing new species is growing, along with the number of articles describing new species and the number of new species. We also observed a growing interdisciplinarity and a change in the number of species described per author, suggesting that taxonomy is experiencing new ways of doing research. The modalities of these changes remain to be explored. It is therefore more pertinent to speak not of a decline, i.e. of a degradation relative to a previous situation, but of inadequacy relative to its objective, namely the scientific inventory and classification of the planet's living taxa.

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cla.12019/abstract

USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA Y GENÉTICA DE POBLACIONES

-->

UNIVERSIDAD NACIONAL DE CÓRDOBA

CURSO DE POST-GRADO

USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA  Y GENÉTICA DE POBLACIONES

Unidad Académica Organizadora: Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución y Doctorado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba (Res. 951-T-2012).

Modalidad: Teórico-práctico

Duración: 45 hs. (40 presenciales, 5 no-presenciales).

Fecha de realización: 11 al 15 de marzo de 2013.

Lugar: Facultad de Ciencias Exactas, Av. Vélez Sarsfield 299. Córdoba.

Destinatarios: alumnos del doctorado en Ciencias Biológicas, egresados de la carrera de Biología y carreras afines (Cs. Agropecuarias, Lic. en Genética, etc.)

Responsable académico y administrador de los fondos: C. N. Gardenal

 

Cupo: 12 alumnos. En lo posible, traer notebook para llevar a cabo la parte de uso de programas de análisis de datos.

Arancel: $ 700. Alumnos inscriptos en el Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional de Córdoba,  $ 560.

Docentes participantes: Dres. C. Noemí Gardenal, Marina Chiappero, Beatriz García, Raúl González Ittig, Paula Rivera y Alicia R. Pérez.

OBJETIVOS

1. Conocer los principios, aplicaciones y limitaciones de las técnicas moleculares en Sistemática y en Genética de Poblaciones.

2. Conocer criterios que permitan seleccionar los marcadores más adecuados para resolver problemas taxonómicos a diferentes niveles (intra e inter-específico, a nivel de género y taxones superiores).

3. Recibir entrenamiento en la utilización de nuevas herramientas para el análisis de la biodiversidad, teniendo en cuenta la historia evolutiva de poblaciones y de especies.

4. Comprender el uso de diferentes programas de computación corrientemente utilizados para el análisis de datos.

PROGRAMA

1. Toma y conservación de muestras para la aplicación de diferentes técnicas. Manejo del laboratorio de Biología Molecular. Preparación y esterilizado de material. Práctica de pipeteo con micropipetas automáticas.

2. Fundamento de los métodos de extracción de ADN. Aislamiento de ADN de tejidos animales y vegetales.

3. Conceptos teóricos sobre la amplificación de segmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).

4. Amplificación por PCR utilizando cebadores específicos: a) amplificación del gen citocromo b del ADN mitocondrial de especies del género Oligoryzomys (Rodentia: Sigmodontinae); b) amplificación de loci microsatélites (genoma nuclear) de especies de Calomys (Rodentia: Sigmodontinae).

5. Conceptos teóricos sobre la amplificación por PCR utilizando cebadores arbitrarios: ISSR  y AFLP. Amplificación de fragmentos ISSR en Myrcianthes cisplatensis (mato).

6. Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP): conceptos teóricos y análisis de geles. Digestión del gen cit b de varias especies de roedores sigmodontinos con enzimas de restricción.

7. Secuenciamiento. Alineación de secuencias.

8. Métodos de análisis. Tratamiento de los distintos tipos de datos. Construcción de matrices. Uso de programas como PAUP, Mr Bayes, jModeltest, Arlequin, Genalex y Structure.

BIBLIOGRAFIA BASICA

1.     Avise J C. 2004. Molecular markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York.

2.     De Salle, R., Giribert, G. y Wheeler, W. 2002. Techniques in Molecular Systematics and Evolution. Birkhäuser, Basilea.

3.     Hillis D M, C. Moritz, B K Mable. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Ass., Inc. Sunderland, Massachusetts.

4.     Freeland, J R. 2011, S D Petersen y H Kirk. 2011. Molecular Ecology. Wiley-Blackwell.

5.     Wiley E. O. y B S Lieberman. 2011. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. Wiley-Blackwell.

6.     Yang Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution, Oxford.

7.     Hoelzel, A R. 1992. Molecular Genetic Analysis of Populations. A practical approach. IRL Press. Oxford.

Trabajos en publicaciones periódicas empleados para Seminarios durante el curso: se actualizan anualmente.

Evaluación final: escrita, a cargo de C.N. Gardenal, R. González Ittig y M. Chiappero.

Informes y pre-inscripciones:

vía e-mail entre el 1º de febrero hasta el 1º de marzo de  2013

 marina.chiappero@gmail.com

Requisitos para la pre-inscripción:

- Curriculum Vitae de no más de 5 páginas,

- Carta de presentación explicando las motivaciones que lo llevan a realizar el curso.

Los alumnos que queden finalmente inscriptos recibirán la comunicación a más tardar el lunes 4 de marzo de 2012.

Workshop: QUANTITATIVE CLADISTICS AND USE OF TNT. 2013

QUANTITATIVE CLADISTICS AND USE OF TNT 

June 3-7, 2013

Instructors:

Dr. Pablo Goloboff

Dr. Claudia Szumik

Els Hostalets de Pierola, Barcelona

Workshop director:

Soledad de Esteban Trivigno

The workshop will cover the basics of parsimony analysis and character optimization, tree-searches, diagnosing and summarizing results efficiently, and measuring group supports.

More information: website.

CURSO INTERNACIONAL: CLADISTICA Y BIOGEOGRAFIA, Enero 2013 Lima – Perú

CURSO INTERNACIONAL: CLADISTICA Y BIOGEOGRAFIA

14 – 23 de Enero de 2013
Lima – Perú

.

.

.

Fecha Limite de Inscripción: 1 de octubre de 2012
Resultados: 5 de Octubre de 2012 

.

.

.

Cladística: Métodos Cuantitativos de Clasificación

• Responsable: Dr. Pablo Goloboff (Inv. Ppal CONICET)
• Colaboradora: Dra. Claudia Szumik (Inv. Indep. CONICET)

NDM/VNDM/VIP: Programas de Computación para Biogeografía: Fundamentos y Aplicaciones

• Responsable: Dra. Claudia A. Szumik (Inv. Indep. CONICET)
• Colaborador: Dr. Pablo A. Goloboff (Inv. Ppal. CONICET)

MAS INFORMACIÓN: http://cebioperu.org/courses/cladistic_biogeography.php

Curso Analisis Filogeneticos

Amigos y Colegas,

Me gustaria utilizar este espacio para invitarlos a un curso que vamos a ofrecer en la Facultad de Medicina Veterinaria de la Universidad Autonoma de Nuevo Leon en Febrero del 2013. Pueden visitar el sitio https://sites.google.com/site/filogeneticauanl/ para obtener mas informacion. Espero contar con su participacion.

Atte. Jose F Garcia Mazcorro.

Epibio2012. 1er. Curso/Simposio Internacional en Epigenética y Biología del Desarrollo

Epibio2012.

1er Curso/Simposio Internacional en Epigenética y Biología del Desarrollo.

Instituto de Biotecnología y Ecología Aplicada de la Universidad Veracruzana (INBIOTECA-UV).

Museo de Antropología de Xalapa.

Noviembre 5 y 6, 2012.

Ponentes confirmados:
Rich Jorgensen (LANGEBIO-México),
Jean Philippe Vielle-Calzada (LANGEBIO-México),
Stewart Gillmor (LANGEBIO-México),
Daniel Grimanelli (IRD-Francia),
Marie Mirouze (IRD-Francia),
Olivier Leblanc (IRD-Francia),
Alejandra Covarrubias (IBT-México),
Patricia León (IBT-México),
Mario Zurita (IBT-México),
Félix Recillas (IFC-México),
Alfredo Cruz (Universidad De La Salle-Mexico),
Jeremy Haag (Indiana University Bloomington-Estados Unidos),
Rebecca Mosher (University of Arizona-Estados Unidos),
Ana Dorantes-Acosta (INBIOTECA-México) y
Mario Arteaga-Vazquez (INBIOTECA-México).

INSCRIPCIÓN SIN COSTO
gracias al valioso apoyo del Institut de Recherche pour le Développement (IRD-Francia) y a la Universidad Veracruzana (Área Biológica-Agropecuaria y Dirección General de Vinculación).

SITIO WEB: EPIBIO2012

Recepción de resúmenes hasta el 15 de Octubre del 2012 al correo electrónico: epibio2012@gmail.com.

Para mayores informes comunicarse con el comité organizador
(Mario A. Arteaga-Vázquez, Daniel Grimanelli y Ana Dorantes Acosta) vía:
email: epibio2012@gmail.com
twitter: @epibio2012
facebook:

Se busca taxonomo(a) vegetal: Mexico

El INECOL ha publicado la convocatoria para ocupar UNA plaza de investigacion en la Red de Biodiversidad y Sistemática, en el Centro Regional del Bajío en Pátzcuaro, Michoacán.

Se espera que la persona elegida para ocupar la plaza disponible, en la medida de lo
posible, retome el liderazgo académico del Dr. Rzedowski y contribuya decididamente a
la continua publicación de la Flora del Bajío y de Regiones Adyacentes. El candidato
elegido se incorporará a un grupo de trabajo conformado por cinco investigadores y cinco
técnicos académicos involucrados en dicho proyecto. El aspirante deberá contar con
amplios conocimientos sobre la taxonomía vegetal, diversidad y morfología de plantas
vasculares, además de tener experiencia en su colecta y determinación. Es deseable tener
experiencia en las técnicas de laboratorio necesarias para la recopilación de datos
moleculares, así como su análisis y el uso de metodologías filogenéticas, aunque no
contar con la misma no cancela la candidatura. Para garantizar la continua publicación de
la Flora del Bajío y de Regiones Adyacentes y de la Revista Acta Botanica Mexicana, se
dará preferencia a los candidatos con experiencia comprobada en el trabajo editorial.

La convocatoria esta anunciada en el sitio web del INECOL
Los detalles de la convocatoria estan en:
http://www1.inecol.edu.mx/inecol/documentos/convocatorias/PlazasCRB(abril2012)FINAL.pdf

Curso de Analisis Filogenetico

Estimados colegas,

Estoy pensando en ofrecer un curso teorico-practico para docentes, investigadores y estudiantes acerca de Analisis Filogeneticos basado en el Libro "The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing" de Lemey, Salemi, Vandamme, y me gustaria primero darme una idea de cuanta gente podria estar interesada, esto con el fin de determinar si es factible llevarlo a cabo.

Por sus comentarios y sugerencias, muchas gracias!

Jose F. Garcia-Mazcorro

Will DNA Barcoding wreck the NCBI Genbank?

This recent paper (An update on DNA barcoding: low species coverage and numerous unidentified sequences; published in Cladistics) on an update of the Global DNA barcoding effort should be a real eye-opener to all people who love the NCBI Genbank and the process and openness of science, and especially to taxonomists.
....

So the paper published in cladistics, looks at the claims of these “barcoders” and find some problems. They check whether:

1. This project lived up to its initial speech act? (species coverage problem)
2. Is it progressing scientifically? (“taxonomy” wise is it 100% percent right?)

Well, the answers are in the negative.

They find ~60,000 “metazoa” species’ barcodes in the NCBI database, which is well below the number of 10-20 million total species on earth (some claims are less but see the link). This is despite having substantial funding from the governments for the barcoding initiative. This paper says that they (Barcoding consortium) received $80 million from the Canadian government, we know about many other sources where every small barcoder gets tens of millions.

....

In short, DNA barcoding has performed below par, and their quest to barcode all species has failed at least until now. The main problems could be that they did not have trained taxonomists in their ranks. They are against taxonomy using morphological identification, thus these taxonomists distance themselves from barcoding, and barcoders know little taxonomy to correctly identify a species to its specific level. If barcoders say that they found cryptic diversity that was deposited as “sp.” in databases, then why 1000 specimens (with <1% identity), and I would also ask those people to read better about species delimitation methods.

....

LEER MAS AQUI>

DNA barcoding: mucho ruido ... pocas nueces .... muy ... muy caras!

Cladistics Early on line: An update on DNA barcoding: low species coverage and numerous unidentified sequences

de Shiyang Kwong, Amrita Srivathsan, Rudolf Meier

Abstract

DNA barcoding was proposed in 2003, the Consortium for the Barcode of Life was established in 2004, and the movement has since attracted more than $80 million funding. Here we investigate how many species of multicellular animals have been barcoded. We compare the numbers in a public database (GenBank as of January 2012) with those in the Barcode of Life Database (BOLD) and find that GenBank contains COI (cytochrome c oxidase subunit 1) sequences for ca. 60 000 species while BOLD reports barcodes for ca. 150 000 species. The discrepancy is likely due to a large amount of unpublished data in BOLD. Overall, the species coverage remains sparse, growth rates are low, and the barcode accumulation curve for Metazoa is linear with only 4788 species having been added in 2011. In addition, the vast majority of species in the public database (73%) were barcoded by projects that are unlikely to be related to the DNA barcoding movement. Particularly surprising was the large number of DNA barcodes in GenBank that were not identified to species (Jan 2012: 74%), with insect barcodes often being identified only to order. Of these several hundred thousand have since been suppressed by NCBI because they did not satisfy the iBOL/GenBank early release agreement. Species coverage is considerably better for target taxa of DNA barcoding campaigns (e.g. birds, fishes, Lepidoptera), although it also falls short of published campaign targets.

© The Willi Hennig Society 2012

Tema de la semana‎ > ‎ Homoplasia: De bestia negra a caso valioso.

Tema de la semana‎ > ‎

Homoplasia: De bestia negra a caso valioso

publicado a la‎(s)‎ 12/10/2011 06:36 por Martín Ramírez 

Tradicionalmente concebida como un problema para la sistemática, la homoplasia nos ofrece una oportunidad única de estudiar fenómenos históricos que de otra manera sería únicos.  Wake et al. (2011) presentan una revisión didáctica de la utilidad del estudio de convergencias y reversiones para comprender los mecanismos subyacentes a la evolución de la morfología.

Wake, D.B., Wake, M.H., Specht, C.D., 2011. Homoplasy: from detecting pattern to determining process and mechanism of evolution. Science 331, 1032-1035. [PDF]

Inicia la reunión de la Willi Hennig Soc en Riverside, CA

Como si estuviera en casa. Español por todos lados. El sábado por la tarde fue el registro y la recepción, con un buen representativo latinoamericano, bueno sobre todo argentinos. Hoy Domingo inicia el programa de presentaciones y se extenderá hasta el Miércoles.

Stevenson, Farris y Carpenter durante la recepción de bienvenida. (foto de GY Zhang)


Quentin Wheeler, en la conferencia plenaria inaugural. (foto de GY Zhang)

 

Wheeler, Meier y Mishler durante el simposio sobre el concepto de especie. (foto de GY Zhang)

Los premios a estudiantes:
John Denton fue distinguido con el premio Willi Hennig para la mejor presentacion por estudiantes.
Guayang Zhang ganó el premio Don Rosen para el mejor cartel.
Cecilia Waichert recibió el premio Lars Brundin para la mejor segunda presentación oral.

Quieren ver más fotos?  GY Zhang, del equipo organizador local estarár subiendo fotos a Picasa:‎ https://picasaweb.google.com/112984361567457674060/Hennnig2012Riverside
Saludos desde Riverside!

Salvador Arias ha ganado el premio GBIF

Salvador Arias ha ganado el premio GBIF - jóvenes investigadores- por el desarrollo del programa para estudios biogeográficos  VIP (Vicariance Inference Program).

Salvador  esta actualmente trabajando en el INSUE-Tucumán, haciendo su Doctorado bajo la dirección de Pablo Goloboff y Claudia Szumik.

Acá mando el Link  de la noticia:


http://www.gbif.org/communications/news-and-events/showsingle/article/awards-tar\
get-novel-research-on-species-distributions


y aquí el del programa:

www.zmuc.dk/public/phylogeny/VIP/intro.htm


Un groso! Felicitaciones Salva!

Santiago Catalano

Hennig XXXI Workshop: Scripting with TNT, Riverside, CA

Participantes del taller de scripts con TNT

 

Durante las sesiones del taller

Pablo Goloboff y participantes

There has been enough interest expressed for a post-meeting workshop: Scripting in TNT.
The exact location of that, and where you might book accommodations has not been determined yet.
The workshop will run on the 28th, 29th and 30th, June, 2012

Pablo Goloboff (one of the co-authors of the program) and Mark Siddall (who has experience writing scripts) are offering to give a short, 3-day course on scripting for TNT, in connection with the next meeting of the Willi Hennig Society in Riverside, California (June 23-27, 2012).

TNT is a program for phylogenetic analysis under parsimony. Even David Swofford praises it as a good phylogeny program, and it is widely recognized as one of the most powerful programs for phylogenetic analysis. Casual users find it very difficult, because it presents so many options that it is difficult to begin using it. Thus, the program left Matthew Vavrek totally confused, and The Manual caused irreparable damage to the eyes of poor Paulo Nuin (see the Blind Scientist blog).

The powerful scripting language of TNT makes it possible to use the program for an enormous variety of calculations and tests, with a flexibility far beyond any other single program for phylogenetic analysis. See the script for consistency and retention indices as an example of a very simple script, Siddall's script for partition bootstrapping as something easily accomplished with slightly more knowledge and then as well Pol and Escapa's script for iterative PCR or Goloboff's script for testing delayed character correlation as examples of more complex scripts.

This course (see the syllabus below) would be directed to those people who already have some experience with TNT, those who are capable at least of running an entire standard analysis by means of commands (and, ideally, those with some specific problems which need scripts for resolution). The course will start from the simplest ideas and build up from there; no previous scripting or programming knowledge is required (although it doesn't hurt). It will cover the main aspects of the scripting possibilities, with Goloboff and Siddall tutoring exercises directed at solving gradually more complex problems. The last day will be dedicated to people's projects, helping them design (the initial stage, at least) of their own specific projects. People should bring their own laptops (any operating system is OK).

Course syllabus and more information here >>>

Superstars of botany: Rare specimens

Tomado de: Nature | News Feature

A handful of plant collectors has shaped the field of botany. Now they are disappearing, and there are no clear successors.

• John Whitfield

25 April 2012

John Wood has had malaria twice, and Dengue fever once. He has shaved leeches off his legs with a machete in southeast Asia — “you're supposed to use a lit cigarette, but I don't smoke” — had his car stolen in Bolivia and lain face down in the Yemeni desert while local tribes exchanged gunfire over his head.

He encountered such inconveniences in the process of collecting more than 30,000 plant specimens over 40 years of travelling the globe, mostly as a hobbyist.

More than 100 of his finds have become type specimens, from which new species are described. Those numbers elevate him to the ranks of a star collector — the top 2% of botanical gatherers, who have accumulated more than half of the type specimens in some of the world's most important collections1. These elite field workers have probably numbered fewer than 500 people throughout history. But they have contributed much of what scientists know about plant diversity, ecology and evolution, and have been crucial in the race to document the world's plants before they are lost to deforestation, development, invasive species and climate change. 

Lea la nota completa aqui: http://www.nature.com/news/superstars-of-botany-rare-specimens-1.10498

1er Congreso de Morfometría, 2012. Pto. Angel, Oaxaca. México

Se han iniciado los planes para realizar la primera reunión de Morfometría en México. El financiamiento principal para el evento ha sido autorizado por el PIFI a la Universidad del Mar. El proyecto es encabezado por la Cand. Dra. Ana Torres, de la Universidad del Mar, Pto. Ángel. Oaxaca.

Sede: instalaciones de la UMAR en Pto. Angel, Oaxaca. México.
Fecha: del 24 al 26 de Septiembre de 2012.
Sitio web: http://www.filogenetica.org/reunion/Morfometria/index.htm

La ocasión será un foro muy incluyente para reunirnos biólogos, antropólogos, etc interesados en la morfometría tradicional y geométrica.

En las próximas semanas se estará conformando distintos Comités para delegar las distintas tareas y así ayudar en la organización del evento. Si está interesado (a) en participar en la organización por favor escribanos.

La reunión seria en el formato de congreso con dos o tres conferencias magistrales y participaciones libres orales (posiblemente posters también). Un aspecto importante de la reunión será una serie de cursos y talleres cortos sobre temas variados muy específicos de la investigación morfometríca, los programas de cómputo más comunes y las aplicaciones en varias áreas (sistemática, filogenia, ecología comparada, antropología física, medicina, etc). Se solicitan sugerencias sobre temas para estos cursos.

Estén pendientes de los avisos en el blog de Morfometría Geometrica. Cualquier pregunta, comentario, sugerencia, por favor sigan este enlace para dejarnos sus COMENTARIOS
http://morfometriageometrica.blogspot.mx/2011/10/encuesta-reunion-de-morfometria-en.html#comment-form

Informes:
Ana Torres.
correo electrónico

ACTUALIZACIONES
20 de ABRIL, 2012: Sitio web para el Congreso ya esta en linea.
28 de ABRIL, 2012: Convocatoria para el Congreso ya esta en linea.
8 de MAYO, 2012: Forma de Registro ya está en línea.
25 de MAYO, 2012. Opción de pagos para participantes internacionales.

Workshop "Triatomine Genomics and Biology III". La Plata.

"Workshop "Triatomine Genomics and Biology III"

Los días 16 al 18 de mayo de 2012 se realizará en la ciudad de La Plata el Workshop "Triatomine Genomics and Biology III", organizado por el Comité Ejecutivo para la Secuenciación del Genoma de Rhodnius prolixus. El Workshop contará con la participación de destacados investigadores de Argentina, Brasil, Canadá, EEUU, Reino Unido y Uruguay. 

En el mismo se presentará el primer borrador del genoma y se avanzará en el proceso de anotación, convocando a todos los investigadores de vectores de Chagas para dicha tarea, estén o no relacionados con la genómica. 

La inscripción es gratuita y de entre los resumenes envíados para presentarse como posters, se seleccionarán algunas exposiciones orales. Se convoca a todos los investigadores y becarios doctorales y postdoctorales a enviar sus contribuciones en el área de la biología de los triatominos hasta el 30 de abril de 2012 a través de la página de web

http://www.eventos.bioqmed.ufrj.br/triatomine-genomics-and-biology/2012

La inscripción podrá realizarse hasta el día anterior al evento.

Molecular Phylogenetics International Conference. Moscow

Dear colleagues!

You are welcome to participate in the III Moscow International Conference «Molecular Phylogenetics MolPhy-3», which will take place at the New School Building of Moscow State University during 31 July – 4 August 2012.

The previous Moscow conference on phylogenetics and molecular evolution, «Molecular Phylogenetics MolPhy-2» was organized at Moscow State University during 18-21 May 2010.

The conference mission is to provide a stimulating platform for the exchange of ideas and experiences in contemporary phylogenetics, molecular evolution and bioinformatics, and for developing methodology, algorithms, and applications for state-of-the-art analyses of molecular genetic data. The primary scope is in molecular phylogenetics and systematics, phyloinformatics, evolutionary genomics, reconstructing the Tree of Life, and applied phylogenetics.

MORE INFO HERE 

X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía. Mendoza

TERCERA CIRCULAR

X REUNIÓN ARGENTINA DE CLADÍSTICA Y

BIOGEOGRAFÍA

Mendoza

29 al 31 de mayo 2012

Organiza:

Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas

CCT CONICET Mendoza

Nos dirigimos a ustedes para hacerles llegar la Tercera Circular de la X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía, que se realizará en la ciudad de Mendoza, los días 29 al 31 de mayo de 2012.
Comisión Organizadora
Sergio A. Roig Juñent
Adriana E. Marvaldi
Federico C. Ocampo
Gustavo E. Flores
Martha Cecilia Domínguez
Florencia Fernández Campón
Mariana Chani Pose
Agustina Ojeda
Claver, Silvia
Scollo, Ana María
Susana J. Lagos
Federico A. Agrain
Diego Germán San Blás
Vanina A. Pereyra
María Silvia Ferrer
Agustina Novillo
Jhon César Neita Moreno

La Comisión Organizadora los invita a visitar la página web que se pondrá en funcionamiento proximamente: http://www.racb2012.org.ar
El comité Científico será conformado por la Comisión organizadora y consultores externos.
En la misma encontrarán la información actualizada sobre la Reunión.
Sede
La misma se realizará en el salón auditorio del Instituto de Ciencias Básicas de la Universidad Nacional de Cuyo, en el Parque General San Martín.
Actividades: Siguiendo el esquema de las reuniones anteriores, la X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía constará de tres simposios, conferencias plenarias y comunicaciones libres.

Los Simposios agruparán una serie de ponencias sobre las siguientes temáticas:
Problemas Teóricos y metodológicos. Coordinado por Dr. Camilo Mattoni. Fac. Cs. Exactas y Naturales, Univ. Nac. Córdoba, Córdoba.
Problemas empíricos. Coordinado por Dra. Lone Aagesen. Instituto de Botánica Darwinion. IBODA. CONICET. Buenos Aires.
Biogeografía. Coordinado por el Dr. Juan José Morrone. Museo de Zoología. Departamento de Biología Evolutiva. Facultad de Ciencias UNAM. México
Las Comunicaciones Libres podrán ser presentadas en forma oral o poster.
El envío de resúmenes se realizará a través de esta página web (modalidad on-line), hasta 20 de abril del corriente año. Al menos uno de los autores deberá estar inscripto. Los resúmenes serán sometidos a evaluación por un Comité Científico.

Futura Información
Próximamente en la página web y en la segunda circular se ampliará la información sobre:
-Listas de hoteles y promociones de alojamiento
-Lista de Conferencistas.

Reunion Hennig XXXI, Junio 23-27, 2012

Hennig XXXI

June 23-27, 2012

University of California Riverside
Co-organizers: John Heraty and Christiane Weirauch
If you will be attending our annual meeting and are not yet a member, please join our society. If you will be attending our annual meeting, are a member, and have yet to renew your membership please renew first.

Symposia:

1.	"Dating Paradigms" - Organizer: Seán Brady (Smithsonian)
2.	"Phylogenomics" - Organizer: Gonzalo Giribet (Harvard)
3.	"Species Revisited" - Organizers: Brent Mishler (UC Berkeley) and Rudolf Meier (University of Singapore)
4.	"Trait Evolution" - Organizer: Dimitar Dimitrov (University of Copenhagen) & Lara Lopardo (Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald)
5.	"Linguistics" - Organizer: Ward Wheeler (AMNH)
	NOTE!!! With enough interest, a possible post-meeting workshop: Scripting in TNT

 MORE INFO HERE

Phyloseminar: Huelsenbeck and Höhna demonstrate RevBayes. Feb 29.

"RevBayes: An R like Environment for Bayesian phylogenetic inference"
John P. Huelsenbeck and Sebastian Höhna (UC Berkeley and Stockholm University)
connect to Phyloseminar.org
Feb 29
http://phyloseminar.org/

RevBayes is a computer program that uses directed acyclic graphs
(DAG's) to specify any type of model, to hold the model and data in
memory, and to compute the likelihood of the parameters of the model.
DAG's provide a framework for the construction of modular models.
Models can easily be extended and/or parts of the model exchanged
(e.g., the substitution process and clock model) and several models
can be combined. The design of RevBayes should allow the
implementation of any extension to existing models. RevBayes is mainly
developed for Bayesian phylogenetic analyses, but it can be extended
to any inference on probabilistic models.

In this talk, I will give a brief introduction to the concept of DAG's
and how they are used to construct a model. Once the model is
specified, I will show how to simulate new observations under the
model and how to estimate its parameters. I will demonstrate this in
the RevLanguage, which is an R-like language for building DAG's for
phylogenetic problems. The RevLanguage is used interactively to
specify the model, as done with R. I will show how a full phylogenetic
model is specified, step-by-step. I will mainly focus on various
standard substitution models, relaxed clock models, and divergence
times priors. Specifically, I will show a new birth-death model with
speciation and extinction rates varying over time and use this in a
integrative analysis. In the integrative analysis I condition only on
the alignment (only the alignment is considered to be known) and
estimate the tree and divergence times simultaneously as well as the
speciation and extinction rates.

CURSO DE POST-GRADO USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA Y GENÉTICA DE POBLACIONES. ARGENTINA

UNIVERSIDAD NACIONAL DE CÓRDOBA

CURSO DE POST-GRADO

USO DE TECNICAS MOLECULARES EN SISTEMATICA Y GENÉTICA DE POBLACIONES

Unidad Académica Organizadora: Cátedra de Genética de Poblaciones y Evolución y Doctorado en Ciencias Biológicas. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba (Res. 734/10, HCD).

Modalidad: Teórico-práctico
Duración: 45 hs. (40 presenciales, 5 no-presenciales).
Fecha de realización: 12 al 16 de marzo de 2012.
Lugar: Facultad de Ciencias Exactas, Av. Vélez Sarsfield 299. Córdoba.
Destinatarios: alumnos del doctorado en Ciencias Biológicas, egresados de la carrera de Biología y carreras afines (Cs. Agropecuarias, Lic. en Genética, etc.)
Responsable académico y administrador de los fondos: C. N. Gardenal
Cupo: 12 alumnos
Arancel: $ 600. Alumnos inscriptos en el Doctorado en Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional de Córdoba, $ 480.

Docentes participantes: Dres. C. Noemí Gardenal, Marina Chiappero, Beatriz García, Raúl González Ittig, Paula Rivera y Alicia R. Pérez.

OBJETIVOS

1. Conocer los principios, aplicaciones y limitaciones de las técnicas moleculares en Sistemática y en Genética de Poblaciones.
2. Conocer criterios que permitan seleccionar los marcadores más adecuados para resolver problemas taxonómicos a diferentes niveles (intra e inter-específico, a nivel de género y taxones superiores).
3. Recibir entrenamiento en la utilización de nuevas herramientas para el análisis de la biodiversidad, teniendo en cuenta la historia evolutiva de poblaciones y de especies.
4. Comprender el uso de diferentes programas de computación corrientemente utilizados para el análisis de datos.

PROGRAMA
1. Toma y conservación de muestras para la aplicación de diferentes técnicas. Manejo del laboratorio de Biología Molecular. Preparación y esterilizado de material. Práctica de pipeteo con micropipetas automáticas.
2. Fundamento de los métodos de extracción de ADN. Aislamiento de ADN de tejidos animales y vegetales.
3. Conceptos teóricos sobre la amplificación de segmentos de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
4. Amplificación por PCR utilizando cebadores específicos: a) amplificación del gen citocromo b del ADN mitocondrial de especies del género Oligoryzomys (Rodentia: Sigmodontinae); b) amplificación de loci microsatélites (genoma nuclear) de especies de Calomys (Rodentia: Sigmodontinae).
5. Conceptos teóricos sobre la amplificación por PCR utilizando cebadores arbitrarios: RAPDs, ISSR, AFLP. Amplificación de fragmentos ISSR en Myrcianthes cisplatensis (mato).
6. Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP): conceptos teóricos y análisis de geles. Digestión del gen cit b de varias especies de roedores sigmodontinos con enzimas de restricción.
7. Secuenciamiento. Alineación de secuencias.
8. Métodos de análisis. Tratamiento de los distintos tipos de datos. Construcción de matrices. Uso de programas como PAUP, Mr Bayes, jModeltest, Arlequin, Genalex y Structure.

BIBLIOGRAFIA BASICA

1. Avise J C. 2004. Molecular markers, Natural History and Evolution. Chapman & Hall, New York.
2. De Salle, R., Giribert, G. y Wheeler, W. 2002. Techniques in Molecular Systematics and Evolution. Birkhäuser, Basilea.
3. Hillis D M, C. Moritz, B K Mable. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Ass., Inc. Sunderland, Massachusetts.
4. Freeland, J R. 2011, S D Petersen y H Kirk. 2011. Molecular Ecology. Wiley-Blackwell.
5. Wiley E. O. y B S Lieberman. 2011. Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. Wiley-Blackwell.
6. Yang Z. 2006. Computational Molecular Evolution. Oxford Series in Ecology and Evolution, Oxford.
7. Hoelzel, A R. 1992. Molecular Genetic Analysis of Populations. A practical approach. IRL Press. Oxford.

Trabajos en publicaciones periódicas empleados para Seminarios durante el curso: se actualizan anualmente.

Evaluación final: escrita, a cargo de C.N. Gardenal, Beatriz A. García y M. Chiappero.


Informes y pre-inscripciones: vía e-mail hasta el 2 de marzo de 2012 >>>M. Chiappero

Requisitos para la pre-inscripción:
- Curriculum Vitae de no más de 5 páginas
- Carta de presentación explicando las motivaciones que lo llevan a realizar el curso.

Los alumnos que queden finalmente inscriptos recibirán la comunicación a más tardar el viernes 3 de marzo de 2012.

Research Grants for Graduate Students

American Society of Plant Taxonomists

2012 Research Grants for Graduate Students

The American Society of Plant Taxonomists is pleased to announce the Society’s annual competition for research grants for graduate student investigators.  Support is available for both masters and doctoral students to conduct fieldwork, herbarium studies, and/or laboratory research in any area of plant systematics.  No award will exceed $1000, and it is unlikely that proposals from previous recipients will be funded.  Proposals will be funded on the basis of merit, regardless of the research area within systematics.

Proposals will be reviewed by the Society’s Awards and Honors Committee and must include the following:

1. Curriculum vitae;
2. Proposal (the text, including figures but excluding literature cited, should not exceed two single-spaced pages) that describes the research to be conducted, emphasizing the role the grant funds will play;
3. Itemized budget.

Eligibility:  Applicants must be members of ASPT at the time of the application deadline.  Details regarding ASPT membership can be found at the ASPT homepage (http://www.aspt.net/index.php).
Proposal submission:  Proposal materials must be submitted electronically as pdf files. Items 1-3 above should be submitted as a single document.  Use the following format for the filename for the proposal materials: 
student name_proposalASPT.pdf.

All application materials should be submitted to Javier Francisco-Ortega via e-mail

Additional details can be found at:
http://www.aspt.net/society/funding/gradstudentgrants.php
http://www.aspt.net/society/funding/gradstudentguidelines.php

Submission deadline for all materials:  9 March 2012.

6th Biennial Conference of the International Biogeography Society. 2013

First announcement

Registration, abstract submission for symposia and contributed papers will open in July 2012.

The core of the meeting will be four successive symposia on broad foundational and cutting-edge topics and approaches in biogeography and macroecology, each with a suite of leading international scientists as well as openings for contributed papers.
- Beyond Bergmann: New perspectives on the biogeography of traits
- Island Biogeography: new syntheses
- Predicting species and biodiversity in a warmer world: are we doing a good job?
- Conservation paleobiology: using knowledge of past ecosystems to inform conservation priorities

The meeting also has 12 sessions of contributed papers on key topics including and not limited to: (i) Neotropical biogeography, (ii) Climate change biogeography, (iii) Paleo-biogeography, (iv) Phylogeography, (v) Marine biogeography (vi) Disturbance regimes and biogeography, and (vii) Global biogeography

MORE INFO >>>

Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía, 2012

X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía

Primera Circular

Nos dirigimos a Uds. para hacerles llegar la primera circular de la X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía que se realizará en la ciudad de Mendoza los días 29 a 31 de mayo de 2012.

Sede y Comisión Organizadora: La misma se realizará en el auditorio del Instituto de Ciencias Básicas de la Universidad Nacional de Cuyo, en el Parque General San Martín. La comisión Organizadora está constituida por personal del CCT CONICET Mendoza.

Actividades: Siguiendo el esquema de las reuniones anteriores la X Reunión Argentina de Cladística y Biogeografía constará de tres simposios (Problemas Metodológicos, Problemas Empíricos y Biogeografía), conferencias plenarias, comunicaciones libres y posters.

Las comunicaciones libres podrán ser presentadas en forma oral o poster.

La forma del envio del resumen y el formato del mismo se brindarán en la próxima circular.

Inscripción: En la próxima circular se informará los montos de inscripción y la forma de pago.


Sergio Roig Juñent

Instituto Argentino de Investigaciones de Zonas Aridas
IADIZA CCT CONICET Mendoza
CC 507 5500 Mendoza
Argentina

VII Encontro Nacional de Biologia Evolutiva, Portugal

O VII Encontro Nacional de Biologia Evolutiva terá lugar no dia 21 de Dezembro de 2011, no Museu da Ciência da Universidade de Coimbra, e com o apoio do Museu da Ciência e do CIBIO.

No decorrer do VII Encontro será formalmente constituída a Sociedade Portuguesa de Biologia Evolutiva.

Leer más >>> http://www.biologia-evolutiva.net/

The rise of the black box and the fall of the foundations of systematics.

The Autonomous Algorithm

The S&B Blog will be running a series of posts dealing with the rise of the black box and the fall of the foundations of systematics.

The Timetree of Life: A product
of the Autonomous Algorithm?

Presently, the majority of systematic analyses are constructed in the same way - a matrix is assembled and fed into a computer that then produces a branching diagram. Students of systematics are taught how to produce this branching diagram, using the algorithm, without context to the foundations of systematics. The result is a whole new generation of computer users ignorant of the basic fundamentals of systematics, such as theory (i.e., homology, monophyly), history (i.e., why we do what we do) and methodology (i.e., how to find homologs and construct a cladogram by hand). This also results in an increased dependency on algorithms, which in turn creates a new systematic history and theory that revolves around algorithms rather than concepts. The former black box, which implemented basic algorithms to find approximations of cladograms, is now totally autonomous to the theory, method and history that had gone into its creation. We call this the Autonomous Algorithm.

LEER MÁS >>> http://urhomology.blogspot.com/2011/08/autonomous-algorithm.html

No hay crisis, no estamos en extincion, ni somos ermitaños.

Ellos dicen que los taxónomos no estamos en peligro de extinción, ni somos ermitaños antisociales. Segun ellos, no hay crisis en la taxonomia! Esa es la conclusión de un estudio recientemente publicado en TREE:

Lucas N. Joppa, David L. Roberts, Stuart L. Pimm, The population ecology and social behaviour of taxonomists, Trends in Ecology & Evolution, Volume 26, Issue 11, November 2011, Pages 551-553, ISSN 0169-5347, 10.1016/j.tree.2011.07.010.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169534711002084

Entre varios análisis que presentan, uno me llama la atención: el numero de especies describibles e investigables por taxónomos esta decreciendo! ..... Yo ya aparte mi grupo ..... grrrrrr .... :))

-
Esta es parte de la gráfica 1:

Trends over time in species discovery rates and taxonomic effort. (a) The number of species described per 5 years, (b) the cumulative number of species, (c) the number of taxonomists involved in species descriptions and the (d) species per taxonomists.

Segun esto, el número de especies descritas ha aumentado (A) y el de taxónomos se ha incrementado ..... exponencialmente! (C).

Siendo la referencia de partida los años 1800s, no me resulta sorprendente, ni creo que sea significativo este tipo de incrementos: todo se ha incrementado! No se cuales son los datos, ni de donde vienen, pues los datos no se presentan en el articulo. Pero se esperaría que los datos fueran de algún modo estandarizados, por ejemplo, numero de taxónomos proporcional a la población? Visto asi probablemente el numero de taxónomos no se ha incrementado tanto como otras cosas desde los 1800s!

PD:
Solo como un ejemplo reciente, lean esta nota sobre el estado de la taxonomia en Canada.
Taxonomy in trouble in Canada - November 18, 2010

.... y esta otra nota sobre la Taxonomia en Latinoamerica:
Análisis cienciométrico del estado de la Sistemática en Latinoamerica

Como ven?

Encuesta: reunión de morfometría en México?

Existe la posibilidad de organizar una reunión de morfometría en México para el 2012. Queremos por este medio explorar el nivel de interes. Esperariamos que la ocasion fuera un foro para reunirnos biologos, antropologos , etc interesados en la morfometria tradicional y geometrica. Una reunion muy inclusiva. Ademas, por supuesto: quienes estarian interesados en ayudar en la organizacion?

La reunión seria en el formato de congreso con participaciones libres orales y posters. Incluiriamos una serie de cursos y talleres cortos sobre temas variados muy especificos a tareas de la investigacion morfometrica, los programas de computo mas comunes y las aplicaciones en varias areas (sistematica, filogenia, ecologia comparada, antropologia fisica, medicina, etc).

Para tener una estimacion del nivel de interes ponemos a su disposicion una encuesta en el blog Morfometria Geometrica. Ademas si esta interesado deje su comentario.

Fecha muy .... muy tentativa: verano del 2012, tres dias en Junio, Julio, o Agosto.

Cualquier pregunta, comentario, sugerencia, por favor usen el formulario de COMENTARIOS
Muchas gracias por su participación en la encuesta.

Premio nacional de Ciencias 2010 a Gabriela Parra, IB, UNAM. Mexico

Un año tarde pero lo comparto. Es un gusto pasarles la excelente noticia sobre los Premios de Investigación de la AMC (México). Hoy me entero que el premio nacional en el área de Ciencias naturales 2010 fué para la Dra. Gabriela Parra Olea, del Instituto de Biologia. UNAM. Es un gusto por que la especialidad de ella es la sistemática. En la historia de los premios, pocos taxónomos han recibido esta distinción, por ejemplo en 2002 el Dr. Gerardo Perez Ponce de Leon.
Transcribo aquí la informacion presentada por la Academia Mexicana de Ciencias, en ocasion del premio hace un año:

La doctora Parra Olea nació en la Ciudad de México en 1967. Realizó sus estudios de licenciatura en la Universidad Autónoma Metropolitana, plantel Iztapalapa, donde obtuvo el título de Hidrobióloga en 1989. Los estudios de doctorado en Ciencias los realizó en la Universidad de California, Berkeley, USA, entre 1994 y1999 habiendo realizado la tesis: Molecular Evolution and Systematics of Neotropical Salamanders (Caudata: Plethodontidae: Bolitoglossini) bajo la asesoría del doctor David B. Wake. Entre 2000 y 2001 realizó una estancia posdoctoral en la Universidad de Harvard, Cambridge, USA, donde continuó sus estudios en sistemática molecular de salamandras neotropicales bajo la asesoría del doctor James Hanken, director del Museo de Zoología
Comparada de dicha Universidad.
En agosto de 2001, la doctora Parra ingresó a la planta académica
del Instituto de Biología de la UNAM como Investigadora Asociada C, para incorporarse a la planta académica de la Colección Nacional de Anfibios y Reptiles. En 2006 fue promovida a Investigador Titular A y al nivel D del programa de becas al desempeño de la UNAM (PRIDE) y en 2008 a la categoría de Investigador Titular B. Pertenece al Sistema Nacional de Investigadores desde 2002 y, en el año 2009, fue promovida al nivel II.
Las áreas de especialidad de la Dra. Parra son la Sistemática, Biología Evolutiva y Conservación de anfibios, con especial énfasis en las salamandras. Su programa de investigación incluye dos aspectos, el primero es sobre sistemática filogenética y taxonomía de salamandras neotropicales en el cual ha propuesto hipótesis
de relaciones filogenéticas y biogeográficas para diferentes grupos de salamandras, y además, ha contribuido a la descripción de la biodiversidad de este grupo de organismos en México, al haber descrito, hasta el momento, 14 especies nuevas. Las hipótesis
filogenéticas que la Dra. Parra ha propuesto han utilizado los métodos más modernos de análisis en sistemática, lo que incluye no sólo el uso de caracteres morfológicos, sino también, de manera importante, de marcadores moleculares. La combinación de ambos tipos de caracteres, la han llevado incluso a reconocer la existencia de al menos otras 30 especies de salamandras que están en proceso de ser descritas. El segundo aspecto de su programa de investigación se relaciona con el estado de conservación de los anfibios de México, mismo que ha cultivado en dos áreas distintas;
la primera se ha centrado en desarrollar estudios de genética de poblaciones para generar información de utilidad para establecer
políticas de conservación, mientras que la segunda área se ha dirigido hacia la detección de enfermedades infecciosas emergentes, mismas que están determinando en la actualidad un importante declive en las poblaciones de anfibios a nivel mundial,
donde México por supuesto no está exento. En particular, está estudiando el efecto de hongos patógenos causantes de la quitridiomicosis en especies de salamandras, incluyendo algunas de gran importancia para la conservación tales como el ajolote (Ambystoma mexicanum).
Su labor académica ha sido reconocida por diferentes organismos
nacionales e internacionales, al haber sido invitada, junto con otros expertos, a participar en paneles donde aspectos de sistemática,
y principalmente de conservación de anfibios, fueron discutidos. Como resultado de estas reuniones se publicaron dos artículos en la revista Science (2006, 2010). Sus proyectos de investigación
han recibido financiamiento a través de programas de diferentes instituciones nacionales y extranjeras, tales como PAPIIT-UNAM, SEP-CONACYT, CSIC-CONACYT (España-México) UC-MEXUS (USA-México) Grupo Rana (USA) y NSF (USA).
En cuanto a su productividad, la Dra. Parra cuenta hasta la fecha
con un total de 64 publicaciones, de las cuales 42 se encuentran
en revistas indizadas y de alto impacto en su área, incluyendo
tres en los Proceedings of the National Academy of sciences (PNAS). Además, cuanta con cinco capítulos de libros, todos internacionales.
Sus contribuciones han recibido hasta al momento un total de 420 citas. Ha presentado 40 trabajos en congresos nacionales e internacionales. En el año 2000 recibió el American Society of Ichthyologists and Herpetologists Stoye Award for best student presentation in Systematics, dentro de la American Society
of Ichthyologist and Herpetologist’s 80th Annual Meeting que fue realizado en La Paz, Baja California, México
En el rubro de formación de recursos humanos, ha dirigido tres tesis de licenciatura y seis de maestría. Actualmente, la Dra. Parra dirige una tesis de maestría, dos de doctorado y cuenta con dos posdoctorados que obtuvieron sus respectivos grados académicos de la Universidad de California, Berkeley. Con respecto a la docencia, es profesora de la UNAM desde 2002, habiendo impartido hasta la fecha un total de siete cursos completos a nivel licenciatura, y cinco de posgrado. Adicionalmente ha impartido cinco cursos cortos, en diferentes instituciones de educación superior
del país. Ha participado en el Comité Tutoral de 13 alumnos
de maestría y siete de doctorado, seis sínodos para tesis de licenciatura, así como en el sínodo de tres exámenes de doctorado y en siete comités de examen de candidatura al grado de doctor.
Como complemento a su labor académica y su participación en la formación de recursos humanos, ha realizado labores de apoyo institucional, entre las cuales se destaca su participación como miembro del subcomité de admisión al posgrado en Ciencias Biológicas
en 2003, la organización de los seminarios del Instituto de Biología de 2007 a 2008 y, desde septiembre de 2009, y su papel como representante del personal académico del Departamento de Zoología ante el Consejo Interno del Instituto de Biología.

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Talleres Internacionales de Bioinformática - Enero 2012

Querida comunidad de filogenetistas y biólogos evolutivos:
Nos es grato informarle que el Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-UNAM) y la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SOIBio), con el apoyo del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM), el Instituto de Biotecnología (IBt-UNAM), la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM) y EMBnet organizan los Talleres Internacionales de Bioinformática - 2012, que se llevarán a cabo del 16 al 27 de enero de 2012 en las instalaciones del CCG en Cuernavaca Morelos, México.
En la semana del 16 al 20 de Enero se impartirán 2 talleres de nivel básico dirigido a principiantes en el área. En la semana del 23 al 27 de Enero se ofrecerán 2 talleres especializados, uno dirigido a gente trabajando en análisis de datos generados por secuenciadores de nueva generación y otro para Administradores de Sistemas.
Para los detalles de los programas y procedimiento de registro, favor de visitar el sitio web del evento:
http://congresos.nnb.unam.mx

---------------------------------------
International Workshop on Bioinformatics - January 2012

Dear community of phylogeneticists and evolutionary biologists:

We are pleased to announce that the National Node of Bioinformatics (NNB-UNAM) and the Iberoamerican Society of Bioinformatics (SOIBio), with support from the Center for Genomic Sciences (CCG-UNAM), the Institute of Biotechnology (IBT-UNAM), the Undergraduate Program in Genomics Sciences (LCG-UNAM) and the EMBnet, organize the “International Workshops on Bioinformatics – 2012” which will be held from January 16th to 27th, 2012 in the CCG facilities in Cuernavaca Morelos, Mexico.
Two Basic or introductory workshops will be offered during the first week (January 16th-20th), geared towards beginners in the field. Two advanced workshops will be offered during the second week (January 23rd to 27th), one designed for people working with data generated by next generation sequencers, and the other for System Administrators.

For the details on the programs and registration procedure, please visit the event website:
http://congresos.nnb.unam.mx

Curso de posgrado: BIOGEOGRAFÍA EVOLUTIVA. Salta. Argentina

UNIVERSIDAD NACIONAL DE SALTA
FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES
ESCUELA DE POSGRADO

Curso de posgrado: INTRODUCCIÓN TEÓRICO-PRÁCTICA A LA
BIOGEOGRAFÍA EVOLUTIVA

Director del curso: Dr. Juan José MORRONE, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM)

Fecha: 17 al 21 de octubre de 2011

Lugar: Facultad de Ciencias Naturales. Universidad Nacional de Salta, Av. Bolivia 5150 – (4400) Salta

Carga horaria: 40 hs.

Metodología: clases teórico-prácticas.

Arancel: Doctorandos y Maestrandos de la Escuela de Posgrado de la Facultad de Ciencias Naturales: $ 500,00 y alumnos externos; $ 650,00.
El pago del arancel de inscripción debe realizarse en la Dirección Administrativa Económica de la Facultad de Ciencias Naturales (U.N.Sa), de lunes a viernes de 8 a 14 hs; o por depósito bancario (e-mail)
Inscripciones: email, email
tel. 0387-4255513
Contacto: Dra. Olga Martínez, email

New taxonomic names online will be "valid publication"

Electronic revolution in plant taxonomy

Elizabeth C Moylan

BMC Evolutionary Biology 2011, 11:251doi:10.1186/1471-2148-11-251

The electronic version of this article can be found online at: http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/251

Published: 14 September 2011

The XVIII International Botanical Congress held in Melbourne, Australia this July [1], a gathering of more than 2000 plant scientists from 73 nations, witnessed exciting developments in the field of plant taxonomy. At the meeting, a resolution was passed with a large majority to enable new taxonomic names to be published electronically and their accompanying descriptions and diagnoses to be published in English or Latin rather than the obligatory Latin description [2]. These are truly ground sweeping changes to the 'International Code of Botanical Nomenclature' [3] henceforth to be known as the 'International Code of Nomenclature for algae, fungi and plants', and brings 'the Code' bang up to date in the 21st Century.

READ MORE >>>http://www.biomedcentral.com/1471-2148/11/251#B4

CONVOCATORIA AL "PREMIO CINVESTAV" a las mejores tesis de licenciatura y maestría

En el marco de la celebración del cincuenta aniversario del Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN, Cinvestav, y con el fin de fortalecer sus vínculos académicos con las Instituciones de Educación Superior Públicas y Privadas, este Centro convoca a los estudiantes graduados a participar en el “Premio Cinvestav” a las mejores tesis de Licenciatura y Maestría. Esta convocatoria es una nueva iniciativa que se abrirá anualmente.

El objetivo es reconocer a aquellos estudiantes que eligieron la opción de tesis para obtener su título o grado y fomentar así el interés por la investigación científica, tecnológica o educativa. Son elegibles aquellas tesis cuya defensa se haya realizado en una institución pública o privada con sede en la República Mexicana, en el periodo comprendido entre el 1 de septiembre de 2010 y el 30 de agosto de 2011.

La fecha de cierre el 30 de septiembre. Es importante señalar que se otorgará un estímulo económico a las tesis ganadoras y una constancia de participación a los autores de las tesis inscritas.