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25 de enero de 2011

Phylogeny.fr Robust Phylogenetic Analysis For The Non-Specialist


Phylogeny.fr es un servicio en linea para la reconstrucción filogenética con datos moleculares.

Phylogeny.fr procesa y conecta varios programas para reconstruir un árbol filogenético a partir de una matriz de secuencias.

No solo hay la opción "One click", tambien uno puede decidir como hacer cada paso en el alineamiento y la reconstrucción ("Advanced"). Incluso hay una opción para generar una cadena de análisis especial sin los parametros automatizados: "A la Carte" Mode. Por ejemplo, uno puede seleccionar un alineamiento con Muscle, T-Coffee, ProbCons, o ClustalW y seleccionar una de las cuatro opciones disponibles para construccion del arbol: Maximum likelihood con PhyML, Parsimonia con TNT, Distancias con ProtDist/FastDist+BioNJ (o Neighbor) y probabilidades Bayesianas con MrBayes.

No pude resistir la tentación de correr un análisis. Entre directamente a TNT y use la matriz de ejemplo con 16 secuencias Angiospermas y grupos externos. Click, click, click... listo un arbol de consenso, ahí en la ventana de dialogo, en menos de lo que canta un gallo!. Muy sencillo!


Este servicio esta disponible en http://www.phylogeny.fr/

17 de enero de 2011

XX Congreso Nacional de Zoología, México


La Sociedad Mexicana de Zoología, A. C., en coordinación con la Universidad Autónoma del Estado de Morelos y la Secretaria de Turismo del Estado de Morelos convocan a la comunidad científica a participar en el

XX Congreso Nacional de Zoología,
Cuernavaca, Morelos,
del 14 al 18 de noviembre de 2011.

Objetivos:
Reunir a investigadores, profesores y estudiantes interesados en el estudio, manejo y conservación de la fauna con la finalidad de intercambiar, analizar, evaluar y difundir los avances realizados en el conocimiento sobre zoología en México.

Entre los varios temas se incluye: Sistemática y Biogeografía.

MAS INFORMACION >>>

3 de diciembre de 2010

Applications open for the WHS phylogenetics workshop in Xalapa, 2011

INECOL, XalapaWilli Hennig Society
Announcement # 2:

Applications are now open for the WHS Twelfth International workshop in Phylogenetic Methods to be held in Xalapa (México) on May 23-27, 2011. This one week course is sponsored by the Graduate Program, INECOL and The Willi Hennig Society.

Students, researchers, and professors interested or working with or about phylogeny and systematics are invited to submit applications for admission. The workshop is open to any student/professional based in México or Internationally.

The workshop will be limited to 25 participants. Complete applications will be evaluated competitively by an ad hoc committee.

Registration will be open only for accepted participants. Registration fee for the workshop is: Students US$300, professionals US$400. Fellowships will be offered by the WHS on a competitive basis to cover registration fee.

An application consists of
  1. A completed "Application form",
  2. a current CV for the applicant, and (if the case),
  3. a letter from the student’s advisor regarding the relevance of the course to the student’s career goals.
Visit this web page for further instructions and for downloading the "Application form".

Please note that all applications for admission must be received by Friday March 4, 2011.

We look forward to receiving your application.

For more information on the course content, registration cost, fellowships, accommodations in Xalapa, travel advice, etc, please visit the web site for the workshop:

Help us to distribute this announcement by printing and posting a one page pamphlet (PDF) in your institution.

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