Glosario Inglés-Español de Términos Técnicos Empleados en Ecología, Evolución y Sistemática, con Énfasis en Ornitología
Mantenido por C. Daniel Cadena, Lucio R. Malizia, Cintia Cornelius y Juan Martínez
"La literatura científica en inglés está llena de términos técnicos que en muchos casos no tienen términos equivalentes estándar en español. Encontrar términos apropiados ha sido con frecuencia difícil para nosotros al traducir textos para revistas ornitológicas (esto explica el sesgo hacia las aves), por lo que durante los últimos años hemos estado construyendo este glosario, que representa un intento de estandarizar la traducción al español de términos técnicos utilizados en la literatura biológica en inglés. Este glosario inicialmente era para nuestro uso personal para traducir textos de manera consistente, pero ahora esperamos que sea una herramienta más general y de mayor utilidad. Como consecuencia de la historia de esta página, hasta el momento hemos incluido términos de forma más o menos desordenada, pero esperamos añadir palabras de modo sistemático en el futuro, en la medida en que el tiempo lo permita.
Este glosario presenta traducciones de términos, pero no definiciones precisas. Si tiene cualquier comentario, crítica o sugerencia (en especial sobre palabras que le gustaría que agregáramos al glosario), por favor contáctenos. Si le interesa contribuir directamente al desarrollo de este sitio wiki, por favor lea las instrucciones para colaboradores, y escríbanos un correo. "
Visite el sitio web del Glosario aqui >>>
26 de noviembre de 2009
23 de noviembre de 2009
Resultados de la encuesta: Como usa este blog?
Muchas gracias a todos los visitantes de este sitio y quienes participaron en la encuesta. En los últimos años hemos tenido un promedio de alrededor de 250 visitas diarias. Lo que se desprende de los datos de la encuesta es que la expectativa de la mayoría es usar el sitio como portal de información.
19 de noviembre de 2009
Is 80-year-old mistake leading to first species to be fished to extinction?
Is 80-year-old mistake leading to first species to be fished to extinction?
A species of common skate is to become the first marine fish species to be driven to extinction by commercial fishing, due to an error of species classification 80 years ago, reveals research published November 17 in the journal Aquatic Conservation.
From the mid-19th century the common skate was described as two distinct species, the flapper skate, D. intermedia, and the blue skate, D. flossada. However, in an influential work in 1926 R.S Clark recognised only 'D. batis' as a valid species and this classification has largely gone unchallenged since.
This classification confusion has resulted in the depletion of the flapper skate, the more endangered species of the two, being masked in the catch record. This means the risk of extinction is far higher than previously assessed and without immediate and incisive action the species may be in an irreversible decline towards extinction.
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A species of common skate is to become the first marine fish species to be driven to extinction by commercial fishing, due to an error of species classification 80 years ago, reveals research published November 17 in the journal Aquatic Conservation.
From the mid-19th century the common skate was described as two distinct species, the flapper skate, D. intermedia, and the blue skate, D. flossada. However, in an influential work in 1926 R.S Clark recognised only 'D. batis' as a valid species and this classification has largely gone unchallenged since.
This classification confusion has resulted in the depletion of the flapper skate, the more endangered species of the two, being masked in the catch record. This means the risk of extinction is far higher than previously assessed and without immediate and incisive action the species may be in an irreversible decline towards extinction.
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14 de noviembre de 2009
Postdoc postion in beetle morphology/taxonomy
The International Institute for Species Exploration, Arizona State University (ASU), invites applications and nominations for a postdoc available January 1, 2010. Duties include dissections, descriptions, and digital illustrations of beetles for print and Web publications, participating in the Institute team working on various cybertaxonomy initiatives, and supporting the research of the director, currently including taxonomic studies of Eleodes (Coleoptera, Tenebrionidae).
ASU is an equal opportunity/affirmative action employer. Women and minorities are encouraged to apply. Submit statement of interest, CV, and names/email addresses of three references to: Quentin Wheeler, Vice President and Dean, College of Liberal Arts and Sciences, Arizona State University. Please submit electronically to tyna.chu@asu.edu
Quentin D. Wheeler, PhD, FLS
University Vice President;
Dean, College of Liberal Arts and Sciences;
Virginia M. Ullman Professor of Natural History and the Environment,
School of Life Sciences;
Arizona State University
PO Box 876505
Tempe, AZ 85287-6505
480-965-3375; Fax: 480-965-1093
College of Liberal Arts and Sciences
2008 Webby and Telly Winning Video 'Planet Bob'
ASU College of Liberal Arts and Sciences — Transforming learning, discovery and lives
13 de noviembre de 2009
Postdoctoral Fellowship, Biodiversity of Madagascar
Postdoctoral Fellowship, Biodiversity of Madagascar
November 12, 2009
Postdoctoral Fellowship
SUMMARY:
This position is a two year appointment starting approximately July 1, 2010, involving both research in our molecular genetic laboratory and in situ field work focused on the biodiversity of Madagascar, including lemurs, carnivores, geckos, chameleons, boas, turtles and tortoises populations endemic to the island.
DUTIES AND RESPONSIBILITIES:
The scientist will employ molecular genetic techniques in the laboratory to generate species-specific microsatellites, multi-locus genotypes and DNA sequence files. The incumbent will also be responsible to apply advanced statistical methods, computer science skills and bioinformatics principles to highlight the dynamics of population genetics and systematics. The candidate’s ability for independent and critical thinking and excellent English writing skills will be vital in the writing of grants and publishable manuscripts. Excellent interpersonal skills will be key, especially in relation to our cross-cultural field research teams in Madagascar.
KNOWLEDGE, SKILLS, AND ABILITIES REQUIRED:
Excellent opportunity available for a motivated and experienced Ph.D. in the genetics, molecular biology, or cell biology fields, with a strong publication record and outstanding professional references. Emphasis in conservation science or informatics experience is a plus. Qualified candidates must show proficiency in molecular genetic techniques and computer skills capable to generate necessary data and to perform genotype and sequence analysis. The position will require attention to detail, good communication skills, strong skills in experimental design and troubleshooting, an ability to work independently and as part of a team, and dedication to doing the best job possible.
Read more >>> http://scholarship-positions.com/postdoctoral-fellowship-biodiversity-of-madagascar/2009/11/12/
November 12, 2009
Postdoctoral Fellowship
SUMMARY:
This position is a two year appointment starting approximately July 1, 2010, involving both research in our molecular genetic laboratory and in situ field work focused on the biodiversity of Madagascar, including lemurs, carnivores, geckos, chameleons, boas, turtles and tortoises populations endemic to the island.
DUTIES AND RESPONSIBILITIES:
The scientist will employ molecular genetic techniques in the laboratory to generate species-specific microsatellites, multi-locus genotypes and DNA sequence files. The incumbent will also be responsible to apply advanced statistical methods, computer science skills and bioinformatics principles to highlight the dynamics of population genetics and systematics. The candidate’s ability for independent and critical thinking and excellent English writing skills will be vital in the writing of grants and publishable manuscripts. Excellent interpersonal skills will be key, especially in relation to our cross-cultural field research teams in Madagascar.
KNOWLEDGE, SKILLS, AND ABILITIES REQUIRED:
Excellent opportunity available for a motivated and experienced Ph.D. in the genetics, molecular biology, or cell biology fields, with a strong publication record and outstanding professional references. Emphasis in conservation science or informatics experience is a plus. Qualified candidates must show proficiency in molecular genetic techniques and computer skills capable to generate necessary data and to perform genotype and sequence analysis. The position will require attention to detail, good communication skills, strong skills in experimental design and troubleshooting, an ability to work independently and as part of a team, and dedication to doing the best job possible.
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11 de noviembre de 2009
Hacia una Sociedad Argentina de Taxónomos y Sistemáticos
ASOCIACIÓN PALEONTOLÓGICA ARGENTINA: Sociedad Argentina de Taxónomos y Sistemáticos
Ante esta situación y considerando necesario nuclear a los científicos que tienen una problemática común, se propone la creación de la Sociedad Argentina de Taxónomos y Sistemáticos.
.......
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Antecedentes
La Taxonomía y la Sistemática son las ciencias que se ocupan de identificar, describir, clasificar, agrupar y nominar la biodiversidad. Esto incluye el estudio tanto de las relaciones de parentesco entre los taxones como de los principios y métodos que sustentan tales clasificaciones. Para ello, la Taxonomía y la Sistemática toman como trasfondo la teoría de la evolución, lo que les permite generar hipótesis predictivas utilizando toda la evidencia disponible de diferentes campos de la biología (morfología, comportamiento, desarrollo, distribución geográfica, fisiología, genética, genómica, etc.).
Estas ciencias, la Taxonomía y la Sistemática, se remontan al comienzo de los estudios biológicos y como consecuencia de ello poseen un cuerpo teórico y metodológico robusto, desarrollado desde la antigüedad y formalizado científicamente desde la aparición de la teoría de Darwin y principalmente a partir de la década de 1950 hasta nuestros días mediante aportes teóricos y metodológicos de variadas figuras de la biología (e.g. Mayr, Hennig, Sokal, Bremer, Rohlf, Fitch, Farris, etc.).
.........Ante esta situación y considerando necesario nuclear a los científicos que tienen una problemática común, se propone la creación de la Sociedad Argentina de Taxónomos y Sistemáticos.
.......
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FOURTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON PHTHIRAPTERA (ICP 4), TURKEY
FOURTH INTERNATIONAL CONFERENCE ON PHTHIRAPTERA (ICP 4)
JUNE 13-18, 2010
CONFERENCE HALL OF MUSTAFA HOTEL, URGUP
CAPPADOCIA, TURKEY
SYMPOSIA
• Morphology and Physiology of Lice
• Systematic, Population Genetics and Evolution
• Epidemiology of Human Lice
• Ecology and Epidemiology of Animal Lice
• Medical and Veterinary Aspects of Louse Infestations
• Microorganisms Associated with Lice
• Prophylaxis and Control of Lice
• Phthirapterists and Phthirapterology
• Techniques to study lice
More information: meeting web site
JUNE 13-18, 2010
CONFERENCE HALL OF MUSTAFA HOTEL, URGUP
CAPPADOCIA, TURKEY
SYMPOSIA
• Morphology and Physiology of Lice
• Systematic, Population Genetics and Evolution
• Epidemiology of Human Lice
• Ecology and Epidemiology of Animal Lice
• Medical and Veterinary Aspects of Louse Infestations
• Microorganisms Associated with Lice
• Prophylaxis and Control of Lice
• Phthirapterists and Phthirapterology
• Techniques to study lice
More information: meeting web site
6 de noviembre de 2009
La bioinformática se consolida en la Argentina
La bioinformática se consolida en la Argentina | bioinformaticos.com.ar
La bioinformática puede contribuir al diseño de drogas más eficientes o explicar cómo nuestras células toman decisiones frente a diferentes circunstancias, entre muchas otras posibilidades. En Estados Unidos y en varios países de Europa ese campo del conocimiento está en pleno auge. Se trata de una nueva ciencia que promueve el uso de la informática en el estudio de los seres vivos.
A fin de promover su desarrollo en la Argentina acaba de nacer la Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional (AABBC / http://www.a2b2c.org.ar/.). Reúne a investigadores y profesionales de distintas ramas de la biología, de la matemática, la química y la informática.
“La biología enfrenta un momento muy complejo. Actualmente somos capaces de producir una gran marea de datos, en particular con los proyectos genómicos. Pero obtener muchos datos no significa necesariamente entender mucho”, explicó Cristina Marino Buslje, presidenta de AABBC, egresada de la Universidad Autónoma de Barcelona y actualmente investigadora de la Universidad de Buenos Aires. Y agregó: “La bioinformática y la biología computacional van a ser protagonistas porque son imprescindibles para procesar esos datos y convertirlos en conocimiento”.
“La biología computacional cruza a toda la biología en forma transversal. Es posible modelar en la computadora desde ecosistemas hasta la interacción molecular de una droga con su receptor”, señaló el vicepresidente de AABBC Fernán Agüero e investigador de la Universidad de San Martín. Agüero llamó a sumar esfuerzos para divulgar la biología computacional y formar profesionales en el campo.
Asimismo, Marcelo Marti, investigador del Conicet en la Universidad de Buenos Aires y miembro de la recién inaugurada fundación afirmó que “estudiar y modelar procesos biológicos en la computadora es esencial tanto para las ciencias básicas –generando hipótesis que deben ser puestas a prueba en el laboratorio–, como para las aplicadas, ya que constituye la base de un número creciente de desarrollos.”
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La bioinformática puede contribuir al diseño de drogas más eficientes o explicar cómo nuestras células toman decisiones frente a diferentes circunstancias, entre muchas otras posibilidades. En Estados Unidos y en varios países de Europa ese campo del conocimiento está en pleno auge. Se trata de una nueva ciencia que promueve el uso de la informática en el estudio de los seres vivos.
A fin de promover su desarrollo en la Argentina acaba de nacer la Asociación Argentina de Bioinformática y Biología Computacional (AABBC / http://www.a2b2c.org.ar/.). Reúne a investigadores y profesionales de distintas ramas de la biología, de la matemática, la química y la informática.
“La biología enfrenta un momento muy complejo. Actualmente somos capaces de producir una gran marea de datos, en particular con los proyectos genómicos. Pero obtener muchos datos no significa necesariamente entender mucho”, explicó Cristina Marino Buslje, presidenta de AABBC, egresada de la Universidad Autónoma de Barcelona y actualmente investigadora de la Universidad de Buenos Aires. Y agregó: “La bioinformática y la biología computacional van a ser protagonistas porque son imprescindibles para procesar esos datos y convertirlos en conocimiento”.
“La biología computacional cruza a toda la biología en forma transversal. Es posible modelar en la computadora desde ecosistemas hasta la interacción molecular de una droga con su receptor”, señaló el vicepresidente de AABBC Fernán Agüero e investigador de la Universidad de San Martín. Agüero llamó a sumar esfuerzos para divulgar la biología computacional y formar profesionales en el campo.
Asimismo, Marcelo Marti, investigador del Conicet en la Universidad de Buenos Aires y miembro de la recién inaugurada fundación afirmó que “estudiar y modelar procesos biológicos en la computadora es esencial tanto para las ciencias básicas –generando hipótesis que deben ser puestas a prueba en el laboratorio–, como para las aplicadas, ya que constituye la base de un número creciente de desarrollos.”
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5 de noviembre de 2009
Scientists Launch Effort To Sequence The DNA Of 10,000 Vertebrates
Scientists have an ambitious new strategy for untangling the evolutionary history of humans and their biological relatives: Create a genetic menagerie made of the DNA of more than 10,000 vertebrate species. The plan, proposed by an international consortium of scientists, is to obtain, preserve, and sequence the DNA of approximately one species for each genus of living mammals, birds, reptiles, amphibians, and fish.
"Understanding the evolution of the vertebrates is one of the greatest detective stories in science," said David Haussler, a Howard Hughes Medical Institute investigator at the University of California, Santa Cruz (UCSC). "No one has ever really known how the elephant got its trunk, or how the leopard got its spots. This project will lay the foundation for work that will answer those questions and many others."
Known as the Genome 10K Project, the approximately $50 million initiative is "tremendously exciting science that will have great benefits for human and animal health," Haussler said. "Within our lifetimes, we could get a glimpse of the genetic changes that have given rise to some of the most diverse life forms on the planet."
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2 de noviembre de 2009
Convocatoria para el Posgrado en el INECOL, Xalapa
::: INECOL ::: Maestría y Doctorado :::
Se ha publicado la Convocatoria para ingreso al Posgrado del INECOL, Xalapa (ecología, biodiversidad, sistemática, conservación y manejo de los recursos naturales)
La Secretaría de Posgrado tiene como misión la formación de recursos humanos de alto nivel (Maestria y Doctorado en Ciencias) con el objeto de:
La información sobre la convocatoria esta aquí >>>
Se ha publicado la Convocatoria para ingreso al Posgrado del INECOL, Xalapa (ecología, biodiversidad, sistemática, conservación y manejo de los recursos naturales)
La Secretaría de Posgrado tiene como misión la formación de recursos humanos de alto nivel (Maestria y Doctorado en Ciencias) con el objeto de:
- Capacitarlos para realizar investigación científica original.
- Que apliquen los conocimientos científicos y tecnológicos a la solución de los problemas concretos enfrentados por la sociedad a la cual pertenecen.
- Biodiversidad y Sistemática
- Conservación
- Ecología
- Manejo de Recursos
La información sobre la convocatoria esta aquí >>>
30 de octubre de 2009
Computational Biology in Colombia
PLoS Computational Biology: Computational Biology in Colombia
High-throughput techniques are somewhat restricted in developing countries. However, computational resources have evolved in recent years to become available to the general public, with greater ability to solve intense computational problems at low cost. Therefore, the vast amount of information that is currently being generated and the need for finding the underpinnings of several issues in biology, have been the impetus of the computational biology area in Latin America. Colombia is no exception, as its rich genetic diversity has convened the attention of several institutions, including both governmental and academic departments, to find how, where, and when these resources could be employed to its benefit. In this review, we introduce the efforts being made throughout the country to spread the word and establish a strong network from a mid- and long-term perspective.
In Colombia, computational biology is just starting to be known as a field of research in its own right. Until now, mainly chemists and biologists have used bioinformatics as a tool to try to solve their particular research problems. We start by reviewing the work of some research groups and their projects. Next, we identify the driving forces of computational research and the problems to be faced in the future. This review is not exhaustive and we apologize for any groups that were not mentioned or acknowledged.
Restrepo S, Pinzón A, Rodríguez-R LM, Sierra R, Grajales A, et al. (2009) Computational Biology in Colombia. PLoS Comput Biol 5(10): e1000535. doi:10.1371/journal.pcbi.1000535
http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1000535
High-throughput techniques are somewhat restricted in developing countries. However, computational resources have evolved in recent years to become available to the general public, with greater ability to solve intense computational problems at low cost. Therefore, the vast amount of information that is currently being generated and the need for finding the underpinnings of several issues in biology, have been the impetus of the computational biology area in Latin America. Colombia is no exception, as its rich genetic diversity has convened the attention of several institutions, including both governmental and academic departments, to find how, where, and when these resources could be employed to its benefit. In this review, we introduce the efforts being made throughout the country to spread the word and establish a strong network from a mid- and long-term perspective.
In Colombia, computational biology is just starting to be known as a field of research in its own right. Until now, mainly chemists and biologists have used bioinformatics as a tool to try to solve their particular research problems. We start by reviewing the work of some research groups and their projects. Next, we identify the driving forces of computational research and the problems to be faced in the future. This review is not exhaustive and we apologize for any groups that were not mentioned or acknowledged.
Restrepo S, Pinzón A, Rodríguez-R LM, Sierra R, Grajales A, et al. (2009) Computational Biology in Colombia. PLoS Comput Biol 5(10): e1000535. doi:10.1371/journal.pcbi.1000535
http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1000535
26 de octubre de 2009
Postdoctoral Fellowship in Vertebrate Evolution - University of Arizona
George Gaylord Simpson Postdoctoral Fellowship in Vertebrate Evolution -
University of Arizona
The Department of Ecology and Evolutionary Biology announces one
postdoctoral fellowship position for Fall 2010, named in honor of G. G.
Simpson's long tenure at the University of Arizona.
Simpson Fellows are expected to conduct an active research program in evolutionary biology,
especially projects that are facilitated and complemented by the
Department's extensive natural history collections in ichthyology,
herpetology, ornithology, and mammalogy. The positions are part of a
renewed commitment to natural history collections on the University of
Arizona campus and an initiative in biodiversity informatics
(http://loco.biosci.arizona.edu/bdii/). Postdoctoral Fellows are
encouraged to establish research collaborations with faculty in the
Department of Ecology and Evolutionary Biology and are expected to teach
or contribute to one course per year in the Fellow's research specialty.
Salary is $37,500 plus benefits (nine-month appointment). A research
stipend of $5000 will also be included. The positions are renewable for
at least a second year contingent on satisfactory performance.
Applicants should submit application materials online at the University
of Arizona Human Resources website (https://www.uacareertrack.com; look
for job #44102), including C.V., statement of research and teaching
interests and experience, and two letters of reference. Reference
letters should be emailed directly to sand...@email.arizona.edu.
Position is open until filled, but we anticipate reviewing applications
beginning on Jan. 15, 2010.
Contact Dr. Peter Reinthal (p...@email.arizona.edu),
Dr. Renee Duckworth (r...@email.arizona.edu),or
Dr. Michael Sanderson (sand...@email.arizona.edu) for further information.
University of Arizona
The Department of Ecology and Evolutionary Biology announces one
postdoctoral fellowship position for Fall 2010, named in honor of G. G.
Simpson's long tenure at the University of Arizona.
Simpson Fellows are expected to conduct an active research program in evolutionary biology,
especially projects that are facilitated and complemented by the
Department's extensive natural history collections in ichthyology,
herpetology, ornithology, and mammalogy. The positions are part of a
renewed commitment to natural history collections on the University of
Arizona campus and an initiative in biodiversity informatics
(http://loco.biosci.arizona.edu/bdii/). Postdoctoral Fellows are
encouraged to establish research collaborations with faculty in the
Department of Ecology and Evolutionary Biology and are expected to teach
or contribute to one course per year in the Fellow's research specialty.
Salary is $37,500 plus benefits (nine-month appointment). A research
stipend of $5000 will also be included. The positions are renewable for
at least a second year contingent on satisfactory performance.
Applicants should submit application materials online at the University
of Arizona Human Resources website (https://www.uacareertrack.com; look
for job #44102), including C.V., statement of research and teaching
interests and experience, and two letters of reference. Reference
letters should be emailed directly to sand...@email.arizona.edu.
Position is open until filled, but we anticipate reviewing applications
beginning on Jan. 15, 2010.
Contact Dr. Peter Reinthal (p...@email.arizona.edu),
Dr. Renee Duckworth (r...@email.arizona.edu),or
Dr. Michael Sanderson (sand...@email.arizona.edu) for further information.
22 de octubre de 2009
NESCent:: Call for Proposals
NESCent: Science & Synthesis: Call for Proposals
Description:
We are now accepting proposals for Postdoctoral Fellowships at The National Evolutionary Synthesis Center (NESCent). We are looking to fund innovative approaches to outstanding problems in evolutionary biology.
Applications:
Proposals are due December 1.For more information, please see our website at https://www.nescent.org/science/proposals.php.
Proposal Categories
Post-Doctoral Fellowships (December 1st deadline)
Sabbaticals (July 10th and December 1st deadlines)
Short-Term Visitors (Jan. 1st, April 1st, July 1st, Sept. 1st deadlines)
20 de octubre de 2009
Servidor de Filogenetica.org temporalmente fuera de linea
18 de octubre de 2009
Genomic basis of adaptation and speciation in Senecio
Postdoctoral Research Assistant at University of Oxford
Applications are invited for a three-year postdoctoral position on a NERC-funded project, Genomic basis of adaptation and speciation in Senecio, led by Dr Dmitry Filatov, Department of Plant Sciences, University of Oxford. This project is devoted to a genome-wide analysis of molecular bases of speciation and adaptation in plant genus Senecio. In collaboration with Professor Hiscock’s laboratory in Bristol (UK) we will conduct functional and evolutionary genetic analyses of coding and regulatory regions in Senecio genome in order to study their evolution during adaptation to contrasting environments of high and low altitudes. The research will involve high throughput DNA pyrosequencing from three Senecio species and population genetic and evolutionary genomic analyses of these sequences.
Further particulars of the post are available at www.plants.ox.ac.uk/. It is anticipated that the successful candidate will begin on 1 February 2010 or soon thereafter and should hold a PhD or equivalent in a relevant discipline.
For more details of the Filatov laboratory see: dps.plants.ox.ac.uk/plants/staff/DmitryFilatov.aspx.
Applications, including application form, full curriculum vitae, the names and contact details of two referees, and clearly quoting reference AP09014 should be sent to the Departmental Administrator, Department of Plant Sciences, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3RB or by email to recruit [at] plants.ox.ac [.] uk. The closing date for applications is noon on Thursday 19 November 2009.
16 de octubre de 2009
III Congreso Colombiano de Zoología. Medellin
III Congreso Colombiano de Zoología,
Medellín - Antioquia,
21 al 26 de noviembre de 2010.
En nombre de las instituciones organizadoras, me es grato extenderles una invitación especial a participar en el III Congreso Colombiano de Zoología que se llevará a cabo en la ciudad de Medellín - Antioquia, del 21 al 26 de noviembre de 2010.
Motivados por el hecho de pertenecer a un país que ostenta un lugar privilegiado, al ser depositario de gran parte de la riqueza natural de nuestro planeta, este evento estará enfocado en compartir los avances en el conocimiento de los diferentes tópicos de la diversidad animal y en dimensionar la importancia de los servicios ambientales que ésta nos ofrece, especialmente sobre el impacto al que se enfrenta la humanidad con la alteración del equilibrio natural, incluyendo los efectos del cambio climático global. Siendo coherentes con este reto en el congreso hemos decidido minimizar el impacto ambiental de su desarrollo mediante la utilización de medios digitales informáticos a todo nivel y durante las diferentes fases del Evento.
José Vicente Rodríguez Mahecha
Coordinador General
III Congreso Colombiano de Zoología
Presidente Asociación Colombiana de Zoología – ACZ
11 de octubre de 2009
X Congreso Argentino de Paleontología Y Bioestratigrafía - VII Congreso Latinoamericano de Paleontología
X Congreso Argentino de Paleontología Y Bioestratigrafía - VII Congreso Latinoamericano de Paleontología
La Comisión Organizadora del X Congreso Argentino de Paleontología y Bioestratigrafía y VII Congreso Latinoamericano de Paleontología se complace en invitarlos a participar en esta reunión conjunta que se realizará en la ciudad de La Plata, Argentina, del 20 al 24 de Septiembre de 2010.
Toda la información referida a este evento se canalizará a través de nuestra página web, incluyendo la presentación de resúmenes, simposios, inscripción y fechas límite.
La Comisión Organizadora del X Congreso Argentino de Paleontología y Bioestratigrafía y VII Congreso Latinoamericano de Paleontología se complace en invitarlos a participar en esta reunión conjunta que se realizará en la ciudad de La Plata, Argentina, del 20 al 24 de Septiembre de 2010.
Toda la información referida a este evento se canalizará a través de nuestra página web, incluyendo la presentación de resúmenes, simposios, inscripción y fechas límite.
1 de octubre de 2009
EDIT General Meeting (Carvoeiro, Portugal)
European Distributed Institute of Taxonomy
The European Distributed Institute of Taxonomy is a network of excellence gathering 28 major institutions devoted to knowing the living world better with the support of the European Commission.
EDIT General Meeting 2009
15-17 December 2009, Hotel Tivoli Almansor, Carvoeiro
This year’s edition of EDIT’s main events will take place once again in the small town of Carvoeiro (southern Portugal). We hope to meet as many as possible of you there to discuss EDIT’s past, present and future.
EDIT Young Taxonomist Symposium
15 December 2009
Demonstrating the future of taxonomy, EDIT invites earl-career researchers to present their work. The call for applications from EDIT institutions (up to two candidates per institution) is now open.
EDIT General Meeting
15-16 December 2009
As EDIT approaches its final year, we hope to engage in a practical discussion of what taxonomy and taxonomists achieve when working together in EDIT. We will discuss the transformation of taxonomy into a global cyberscience, with speakers inside and outside EDIT defining a picture of a discipline that experiences growing relevance and capability. As in previous editions, all EDIT institutions will be able to send a number of delegates to this event.
Click here to see the event programme and speakers.
Poster and Demonstration Sessions
15-17 December 2009
* Read more
30 de septiembre de 2009
Taxonomy comes of age: Book review in Nature
Taxonomy comes of age : Article : Nature
BOOK REVIEWED-
Naming Nature: The Clash Between Instinct and Science
by Carol Kaesuk Yoon.
W. W. Norton: 2009.
352 pp.
Book review by
Richard Lane. Director of science at the Natural History Museum, London SW7 5BD, UK, and author of the recent report Taxonomy in Europe in the 21st Century.
BOOK REVIEWED-
Naming Nature: The Clash Between Instinct and Science
by Carol Kaesuk Yoon.
W. W. Norton: 2009.
352 pp.
Faced with the bewildering diversity of nature, humans have long attempted to classify it. In her personal and readable perspective on taxonomy, Carol Yoon argues that the basic instinct to recognize natural groups has gradually been replaced by an increased rationality.
Yoon explores the formative environment, motives and personality of the field and scientists within it, from its origins to maturity. She argues that taxonomy generates new views of the world that are counterintuitive, for example that fungi are more like animals than plants; reductionist, depending on molecular data and statistical techniques; and bewildering, such as the prolific yet invisible domains of bacteria and archaea. She is concerned that the professionalization of biology has distanced humanity from nature. But her incursions into anthropology, neuroscience and psychology to explain our empathy with nature are disappointingly superficial.
The first major step in taxonomy was taken by Carl Linneaus some 250 years ago. In a magnificent work, Systema Naturae, he ordered the known natural world. Although the places of some organisms in his scheme have changed, his binomial system for naming organisms has stood the test of time.
A century later, in 1859, came Darwin's theory of evolution, with its seismic impact on science and society. Surprisingly, its effect on taxonomy was minimal. Taxonomists continued for another century to explore the world and discover new species as before, now drawing tree diagrams to represent the relationships between organisms and their evolution. Some of these evolutionary trees were insightful, others fanciful. Unfortunately none was testable, repeatable or objective. So taxonomy got a bad name.
Yoon rightly recognizes the role of the 1960s movement of quantitative experimentalists in being the most significant first step in transforming the field into a full science. These numerical taxonomists started a serious debate on how to articulate earlier opinions and experience, and distil them into testable conclusions. As a result, data and transparent methodology came to challenge 'expert' opinion. However, these researchers treated all data equally, without considering their relative evolutionary or biological significance.
A more rational and evolution-based approach was needed. For some this was found in DNA sequences. But this approach attracted a similar criticism, namely that a complex organism couldn't be reduced to a string of nucleotides.
Over the following period of great change in biology and computational technology, taxonomists struggled to find their way. In the 1970s, the phylogenetics movement arose with a simple message: to seek close relatives with similarities that are shared uniquely by their descendants and no other groups. With this powerful new methodological tool came fervent disciples, called 'cladists', who wanted to purge the field of non-adherents. Taxonomy again turned in on itself, ignoring the huge strides being made in areas such as developmental genetics, population genetics and population biology that could have crucially informed their interpretations of nature. Describing these ideological waves, Yoon's book comes alive with her tales of meeting influential figures, including the God-like Ernst Mayr.
Yoon leaves us with taxonomy having passed though its rebellious adolescence into maturity. But what of its future? Taxonomy has never had so many tools at its disposal and so many connections to the rest of biology. The tragedy is that there are too few taxonomists who can utilize these advances and tackle the challenging questions of our time.
Book review by
Richard Lane. Director of science at the Natural History Museum, London SW7 5BD, UK, and author of the recent report Taxonomy in Europe in the 21st Century.
23 de septiembre de 2009
La dimensión filogenética de la diversidad biológica
Curso de Posgrado en la Universidad Nacional del Sur, Bahía Blanca, Buenos Aires.
"La dimensión filogenética de la diversidad biológica"
a cargo del Dr. Fernando Pérez-Miles (Sección Entomología, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay)
Coordinador responsable: Dra. Adriana Ferrero
Temario Básico
Programa Teórico:
1.- Diversidad biológica y Sistemática. Bases criterios y formas de clasificación. Características de las clasificaciones científicas, jerarquía y claves. Sistemática, Taxonomía, Clasificación y Nomenclatura. El concepto de especie en sistemática.
2.- Referencias históricas de la sistemática, escuelas. Origen de la Sistemática Cladista. Filogenia y Parentesco. Principios Cladistas: parsimonia, máxima verosimilitud y distancia.
3.- Caracteres sistemáticos y variación. Tipos de caracteres. Variables cualitativas y cuantitativas. Variables discretas y contínuas. Transformación y estados de los caracteres. Homología y homoplasia. Codificación de caracteres. Ordenamiento y polarización. Criterios de optimalidad y optimización de caracteres.
4.- Construcción de cladogramas. Búsquedas: métodos exactos, métodos heurísticos. Permutación de ramas: podado y reinserción de sub-árboles (SPR), corte y reconección (TBR). Polaridad y enraizamiento. 9.- Pesado de caracteres y medidas de ajuste. Longitud del cladograma. Indices de consistencia, de retención y ajuste. Pesado a priori y a posteriori. Pesajes sucesivos y pesajes implicados.
5.- Soporte y medidas de confiabilidad de cladogramas y grupos. Decisividad, distribución de longitudes de árboles, “Bremer support”. Métodos probabilísticos: Bootstrap, Jacknife. Consensos: estricto, de mayoría, de Nelson, de Adams. Análisis separados versus evidencia total. Comentarios sobre nuevos métodos de búsqueda para matrices muy grandes o “sucias”.
Programa Práctico:
1.- Polarización y codificación de caracteres, matrices básicas de datos, manejo básico del programa NEXUS
2.- Análisis filogenético, búsquedas de árboles por parsimonia, manejo básico del programa TNT.
3.- Pensando en árboles, ejercicios (domiciliarios) de interpretación de árboles.
Bibliografía:
Libros
Goloboff, P.A. 1998. Principios basicos de cladística. Sociedad Argentina de Botánica, Buenos Aires, 81 pp.
Kitching, I.J., P.L. Forey, C.J. Humphries & D. M. Williams. 1998. Cladistics. The theory and practice of parsimony analysis. 2nd. Ed. Oxford Univ. Press, Oxford, 228 pp.
Lanteri, A.A. & M.M. Cigliano. Sistemática biológica fundamentos teóricos y ejercitaciones. Edlup, La Plata, 241 pp.
Diniz, J.A.F. 2000. Métodos filogenéticos comparativos. Holos, Riberao Preto, 162 pp.
Trabajos científicos
Bremer, K.1994. Branch support and tree stability. Cladistics 10:295-304.
Gobloboff, P.A. 1993. Estimating character weights during search. Cladistics 9:83-91.
Goloboff, P.A., J.Farris & K. Nixon. 2003. Tree Analisis using new technology, ver 1.1. Program and documentation at http:// www.zmuc.dk/public/phylogeny/tnt.
Platnick, N.I. 1979. Phylosophy and the transformation of cladistics. Syst. Zool. 28:537-544.
"La dimensión filogenética de la diversidad biológica"
a cargo del Dr. Fernando Pérez-Miles (Sección Entomología, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay)
Coordinador responsable: Dra. Adriana Ferrero
- Lugar: Sala de Conferencias, Depto. De Biología, Bioquímica y Farmacia
- Fecha de Inicio: lunes 19 de octubre, 17 horas.
- Modalidad: Teórico – Práctico
Temario Básico
Programa Teórico:
1.- Diversidad biológica y Sistemática. Bases criterios y formas de clasificación. Características de las clasificaciones científicas, jerarquía y claves. Sistemática, Taxonomía, Clasificación y Nomenclatura. El concepto de especie en sistemática.
2.- Referencias históricas de la sistemática, escuelas. Origen de la Sistemática Cladista. Filogenia y Parentesco. Principios Cladistas: parsimonia, máxima verosimilitud y distancia.
3.- Caracteres sistemáticos y variación. Tipos de caracteres. Variables cualitativas y cuantitativas. Variables discretas y contínuas. Transformación y estados de los caracteres. Homología y homoplasia. Codificación de caracteres. Ordenamiento y polarización. Criterios de optimalidad y optimización de caracteres.
4.- Construcción de cladogramas. Búsquedas: métodos exactos, métodos heurísticos. Permutación de ramas: podado y reinserción de sub-árboles (SPR), corte y reconección (TBR). Polaridad y enraizamiento. 9.- Pesado de caracteres y medidas de ajuste. Longitud del cladograma. Indices de consistencia, de retención y ajuste. Pesado a priori y a posteriori. Pesajes sucesivos y pesajes implicados.
5.- Soporte y medidas de confiabilidad de cladogramas y grupos. Decisividad, distribución de longitudes de árboles, “Bremer support”. Métodos probabilísticos: Bootstrap, Jacknife. Consensos: estricto, de mayoría, de Nelson, de Adams. Análisis separados versus evidencia total. Comentarios sobre nuevos métodos de búsqueda para matrices muy grandes o “sucias”.
Programa Práctico:
1.- Polarización y codificación de caracteres, matrices básicas de datos, manejo básico del programa NEXUS
2.- Análisis filogenético, búsquedas de árboles por parsimonia, manejo básico del programa TNT.
3.- Pensando en árboles, ejercicios (domiciliarios) de interpretación de árboles.
Bibliografía:
Libros
Goloboff, P.A. 1998. Principios basicos de cladística. Sociedad Argentina de Botánica, Buenos Aires, 81 pp.
Kitching, I.J., P.L. Forey, C.J. Humphries & D. M. Williams. 1998. Cladistics. The theory and practice of parsimony analysis. 2nd. Ed. Oxford Univ. Press, Oxford, 228 pp.
Lanteri, A.A. & M.M. Cigliano. Sistemática biológica fundamentos teóricos y ejercitaciones. Edlup, La Plata, 241 pp.
Diniz, J.A.F. 2000. Métodos filogenéticos comparativos. Holos, Riberao Preto, 162 pp.
Trabajos científicos
Bremer, K.1994. Branch support and tree stability. Cladistics 10:295-304.
Gobloboff, P.A. 1993. Estimating character weights during search. Cladistics 9:83-91.
Goloboff, P.A., J.Farris & K. Nixon. 2003. Tree Analisis using new technology, ver 1.1. Program and documentation at http:// www.zmuc.dk/public/phylogeny/tnt.
Platnick, N.I. 1979. Phylosophy and the transformation of cladistics. Syst. Zool. 28:537-544.
22 de septiembre de 2009
BOTANY 2010, Rhode Island
Call for Symposia, Colloquia, and Workshops
Overview
BOTANY 2010 will be held at Providence, Rhode Island, July 31 – August 4, 2010.
Societies participating in BOTANY 2010 will include:
- the American Bryological and Lichenological Society (ABLS),
- the American Fern Society (AFS),
- the American Society of Plant Taxonomists (ASPT), and
- the Botanical Society of America (BSA).
In preparation for Botany 2010 we are now soliciting proposals for symposia, colloquia, workshops, discussion sessions, and field trips. Symposia are organized around a topic of potential broad interest, are timely because of recent advances or synthesis in the field, or are particularly relevant to the conference venue. Colloquia are organized around more specialized topics with all presentations adhering to the standard 15 minute timeframe. The number of presentations in a colloquium is variable. Discussion sessions (“roundtable discussion”) are organized around a particular topic of interest with the bulk of the time devoted to discussion that engages the audience. Workshops are distinguished from symposia and colloquia by the inclusion of time devoted to hands-on activities (e.g., software demonstrations, data analysis tutorials, etc.).
websites
Call for Symposium - http://www.2010.botanyconference.org/2010Calls/2010ls_Symposia.php
Call for Workshops - http://www.2010.botanyconference.org/2010Calls/2010ls_Workshops.php
Escarabajo nombrado en honor a Darwin
"A dung beetle from Costa Rica has been named after Charles Darwin and the Darwin Initiative (DEFRA) by scientists at the National Biodiversity Institute of Costa Rica (INBio) and the EARTH University, Costa Rica.
The beetle, named Canthidium (Eucanthidium) darwini, was discovered in a remote and unexplored UNESCO World Heritage Site in the Talamanca Mountains as part of a Natural History Museum led project."
Leer más ..... >>>
21 de septiembre de 2009
Sistemática en el X Congreso Nacional de Micologia. México
El Comité Organizador invita a la comunidad académica, científica, estudiantil y público interesado a asistir al:
X Congreso Nacional de Micología
a celebrarse en Guadalajara, Jalisco
del 20 al 25 de septiembre de 2009.
Simposio: Sistemática de hongos
Coordinador: M. en C. Ricardo Valenzuela Garza
1. Systematics of Cordyceps sensu lato
Dr. Bhushan Shrestha
2. El género Phellinus Quél. (Hymenochaetaceae) en la actualidad
Dra. Clarice Loguercio Leite
3. El orden Boletales en México, los criterios tradicionales y actuales de su clasificación
M. en C. Jesús García Jiménez
4. Sistemática de los hongos gasteroides
Dr. Martín Esqueda Valle
sitio web: http://www.cucba.udg.mx/actividadescucba/2009/micologia/sishongos.html
15 de septiembre de 2009
La $eductora pre$ion de una vi$ion molecular reduccioni$ta en la $istematica
Ante la efervescencia dominante de los últimos años por el uso de códigos de DNA para problemas taxonómicos, se han suscitado diversas reacciones criticas para alertar sobre las expectativas ingenuas, límites, errores de apreciación y hasta peligros de tal enfoque reduccionista y hegemónico molecular en la Sistemática [link ; link]. Una reacción reciente es la discusión en "e-Clado" iniciada estos días y motivada al menos en parte por el anuncio de la disponibilidad de financiamiento para el uso de códigos de barras de DNA, allá en Argentina.
Acá en México, también estamos estamos sorprendidos por la benevolencia de CONACYT ofreciendo tanto dinero para que se hagan códigos de barras de DNA [link]. Ante una tendencia continua y cada vez mas preocupante de menor dinero disponible para los taxónomos, este financiamiento viene al investigador ahogado como una bocanada de aire (no importa que sea tan contaminado, como el de la Cd de Mexico!). Obviamente aplican las mismas preguntas planteadas en Argentina.
Transcribo aquí la invitación de Claudia Szumick con el objetivo que los lectores de este blog sigan y participen en la interesante discusión en "e-Clado".
Acá en México, también estamos estamos sorprendidos por la benevolencia de CONACYT ofreciendo tanto dinero para que se hagan códigos de barras de DNA [link]. Ante una tendencia continua y cada vez mas preocupante de menor dinero disponible para los taxónomos, este financiamiento viene al investigador ahogado como una bocanada de aire (no importa que sea tan contaminado, como el de la Cd de Mexico!). Obviamente aplican las mismas preguntas planteadas en Argentina.
Transcribo aquí la invitación de Claudia Szumick con el objetivo que los lectores de este blog sigan y participen en la interesante discusión en "e-Clado".
Recientemente, por varias vías (e-groups, correos personales o de trabajo) y TAMBIEN por el e-group de clado hemos estado recibiendo un montón de propaganda e información (enviados por Martín Ramírez) sobre un nuevo
llamado del IBOL.
Y qué es el IBOL?
"Fondo iBOL Argentina, destinado a la difusión de la tecnología del código de barras de ADN para la identificación de especies"
Este llamado del IBOL financiado por Conicet, Fundación Williams, y otros, es
aparentemente administrado, coordinado y evaluado por el MACN. Financia salidas de campo, para identificación a nivel específico de grupos particulares de eukariotas y la extracción de tejido para el proyecto IBOL.
Este bombardeo propagandístico puede entenderse porque la gente del IBOL debe asegurarse de que todos los potenciales interesados tengan acceso a la información y puedan presentarse.
Sin embargo queda una sensación extraña, se toman muchas cosas como dadas y ya no sujetas a discusión, sin espacio alguno para reflexionar o discutir.
Las dudas que esta situación me genera las resumen perfectamente Jorge Crisci y Liliana Katinas en su nota reciente de Ciencia Hoy (réplica a la nota de Tubaro y Astarloa). Crisci y Katinas hablan sobre los peligros de la "hegemonía"; lo que más me llamó la atención es que ellos marcan que el programa de barcote implica:
1. un programa de investigación reduccionista que ignora muchos aspectos de la biología organísmica;
2. una disminución del trabajo taxonómico, disminución que afecta la conservación de la biodiversidad; y
3. un clima intelectual que margina a aquellos que tienen otros puntos de vista.
Creo no ser la única en preguntarme qué habría pasado si, en lugar de esto, el
CONICET y Williams y otros hubieran financiado a estudiantes avanzados e
investigadores para pequeñas campañas que cubran baches de información en plantas, animales, hongos, etc.? Cuánto habría sido el avance del conocimiento taxonómico en ese caso? Lo que implica: una vez más, nos despeinaron sin aviso a los taxónomos?
Por qué es ahora política institucional del CONICET apoyar y financiar este tipo de actividades?
Por qué los adeptos al barcode lograron que el CONICET apoyara esto como lo apoya, cuando el CONICET jamás consideró en su agenda con tanta generosidad a taxónomos y sistemáticos ...
Quisiera abrir acá el debate, porque me interesa saber qué piensa de este tema la gente que participa de este e-group.
Incluyo la nota de Ciencia Hoy donde están los defensores de esta técnica, así como la nota sobre los peligros de la "hegemonía" de Crisci y Katinas.
http://arbol.uniandes.edu.co/Archivos/Tubaro-Que%20bicho%20es.pdf
obviamente, existe además una larga lista de papers sobre los problemas
metodológicos y teóricos de esta nueva "técnica". Dejo esta parte a otro que quiera incluir esos papers.
Saludos cordiales,
Claudia
--
Claudia Szumik
INSUE-CONICET
Miguel Lillo 205 - CP4000
Tucumán - Argentina
0381-4232965
10 de septiembre de 2009
Recordatorio para la III Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida. Mexico
Fecha limite para registro con descuento en la Tercera Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida
A los posibles interesados,
Del 7 al 13 de noviembre se llevará a cabo la Tercera Conferencia Intenacional del Código de Barras de la Vida en la ciudad de México.
Esta Conferencia va a reunir líderes nacionales e internacionales en diferentes campos de la biología (taxonomía, ecología, conservación, manejo, especies invasoras, plagas, etc) interesados en el desarrollo de esta nueva heramienta molecular para la identificación expedita de especies, y sus aplicaciones.
La parte científica más importante de la Conferencia se llevará a cabo en las instalaciones de la Academia Mexicana de Ciencias del 10 al 12 de noviembre, pero también se tienen preparadas reuniones o talleres previos a la misma en las instalaciones de la UNAM del 7 al 9 de noviembre, y eventos abiertos al público el 13 de noviembre en el Museo Universum.
Esta Conferencia está siendo organizada por el Instituto de Biología de la UNAM y por el Consorcio para el Código de Barras de la Vida, basado en Smithsonian Institution. Toda la información sobre la Conferencia se puede consultar en la pagina web www.dnabarcodes2009.org.
Es importante notar que el día de mañana es el último día para inscribirse al evento con una cuota de descuento. Para los organizadores es de suma importancia conocer el número de personas interesadas en asistir, para todos los arreglos logísticos de la Conferencia, por lo que los invitamos a inscribirse lo antes posible si están interesados en participar, por otro lado, el cupo en la Conferencia conforme se acerque la fecha podría estar limitado.
Por lo tanto, los invito cordialmente a que de estar interesados en el tema y la Conferencia visiten la página y programen su inscripción tomando en cuenta el descuento.
Atentamente,
Patricia Escalante
Presidenta de la Tercera Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida
A los posibles interesados,
Del 7 al 13 de noviembre se llevará a cabo la Tercera Conferencia Intenacional del Código de Barras de la Vida en la ciudad de México.
Esta Conferencia va a reunir líderes nacionales e internacionales en diferentes campos de la biología (taxonomía, ecología, conservación, manejo, especies invasoras, plagas, etc) interesados en el desarrollo de esta nueva heramienta molecular para la identificación expedita de especies, y sus aplicaciones.
La parte científica más importante de la Conferencia se llevará a cabo en las instalaciones de la Academia Mexicana de Ciencias del 10 al 12 de noviembre, pero también se tienen preparadas reuniones o talleres previos a la misma en las instalaciones de la UNAM del 7 al 9 de noviembre, y eventos abiertos al público el 13 de noviembre en el Museo Universum.
Esta Conferencia está siendo organizada por el Instituto de Biología de la UNAM y por el Consorcio para el Código de Barras de la Vida, basado en Smithsonian Institution. Toda la información sobre la Conferencia se puede consultar en la pagina web www.dnabarcodes2009.org.
Es importante notar que el día de mañana es el último día para inscribirse al evento con una cuota de descuento. Para los organizadores es de suma importancia conocer el número de personas interesadas en asistir, para todos los arreglos logísticos de la Conferencia, por lo que los invitamos a inscribirse lo antes posible si están interesados en participar, por otro lado, el cupo en la Conferencia conforme se acerque la fecha podría estar limitado.
Por lo tanto, los invito cordialmente a que de estar interesados en el tema y la Conferencia visiten la página y programen su inscripción tomando en cuenta el descuento.
Atentamente,
Patricia Escalante
Presidenta de la Tercera Conferencia Internacional del Código de Barras de la Vida
3 de septiembre de 2009
56th Annual Systematics Symposium, MOBOT, Saint Louis
9-11 October 2009
With support from the National Science Foundation
"Angiosperm phylogeny: not just trees, but insects, fungi, and much more"
Organizing committee: Peter Stevens
FRIDAY
7:30 – 9:30 p.m. Informal mixer in Ridgway Center
SATURDAY
8:30 a.m. – 8:30 p.m. Talks in Ridgway Center
SUNDAY
Sunday 9:00 a.m. – noon. Talks in Ridgway Center
Website: http://www.mobot.org/mobot/research/symposium/
With support from the National Science Foundation
"Angiosperm phylogeny: not just trees, but insects, fungi, and much more"
Organizing committee: Peter Stevens
FRIDAY
7:30 – 9:30 p.m. Informal mixer in Ridgway Center
SATURDAY
8:30 a.m. – 8:30 p.m. Talks in Ridgway Center
SUNDAY
Sunday 9:00 a.m. – noon. Talks in Ridgway Center
Website: http://www.mobot.org/mobot/research/symposium/
29 de agosto de 2009
Encuesta: Como usa este blog y el sitio Filogenetica.org?
Actualización (Nov 2009): Vea los resultados aqui >>>
Este Septiembre el sitio web Filogenetica.org y este blog de noticias cumple tres años que esta en linea. En este periodo se han acumulado mas de 100, 000 visitantes! Desde este lado del teclado parece ser que el sitio esta funcionando como un espacio para difundir información sobre actividades, cursos, investigación, congresos, etc y promover el contacto entre nuestra comunidad filogenética. Pero realmente es asi?
En vista de los tres años en linea y del ritmo regular de unos 250 visitantes diarios a este sitio, ayudara mucho explorar que es lo que los lectores buscan. Mediante correo electrónico recibo frecuentemente solicitudes de ayuda. Las necesidades mas comunes son de información sobre cursos, eventos, logros, etc y también los lectores de este blog solicitan se publiquen notas que divulguen conocimientos técnicos básicos sobre teoría y métodos filogenéticos.
Una manera mas abierta de examinar las expectativas de quienes visitan el sitio es preguntando directamente "Como usa este blog y el sitio Filogenetica.org? A todos se les invita a participar en esta encuesta.
Al igual que en las anteriores, pueden elegir más de una respuesta. La lista de opciones y los resultados estarán disponibles hasta Noviembre. Si la lista de opciones no incluye su situación, por favor deje su comentario aquí
Gracias por participar y ayudar en el mejoramiento de este servicio de información y divulgación!
E
25 de agosto de 2009
Systematics and taxonomy research scheme launch event
BBSRC - Systematics and taxonomy research scheme launch event
Systematics and taxonomy research scheme launch event
Date: 12 November 2009, 6pm
Venue: Linnean Society, Burlington House, Piccadilly, London W1J 0BF
Systematics and taxonomy research scheme launch event
Date: 12 November 2009, 6pm
Venue: Linnean Society, Burlington House, Piccadilly, London W1J 0BF
The Research Councils are launching a new funding scheme for research in systematics and taxonomy. The Systematics and Taxonomy (SynTax) scheme is designed to provide short-term funding for preliminary research that will form the basis of novel responsive mode proposals with a substantial systematics/taxonomy component.
The scheme aims to stimulate high quality taxonomy and systematics-related research proposals to the UK’s Research Councils.
The scheme follows on from the Collaborative Systematics (CoSyst) scheme, through which a number of projects have gone on to receive responsive mode funding.
Programme
The launch event will provide details of the SynTax scheme and will showcase successful projects funded under its predecessor CoSyst.
Tea will be served in the library from 5.30pm and the lecture will be followed by a wine reception and poster session.
Speakers
- SynTax Scheme
Amanda Read, BBSRC - CoSyst Showcase:
- Genomic tools for studying the Origin of Species
Professor Vincent Savolainen, Imperial College London - Hydatellaceae: a key to reassessing morphological evolution in angiosperms
Dr Paula Rudall, Royal Botanic Gardens Kew - Molecular diversity of microbial eukaryotes using a large-scale parallel tag sequencing strategy
Dr Tom Richards, University of Exeter
- Genomic tools for studying the Origin of Species
Posters are invited from CoSyst grantholders.
How to register
This meeting is free. Registration is not necessary.
21 de agosto de 2009
Convocatoria para hacer Codigos de ADN, Mexico
Se ha dado a conocer en México la convocatoria del CONACYT para la "Integración de las Redes Temáticas CONACYT de Investigación 2009".
La convocatoria esta dirigida a investigadores, tecnólogos, empresarios y demás personas interesadas en participar en alguna de las Redes Temáticas CONACYT de Investigación. Estará vigente hasta el 18 de septiembre de 2009.
El objeto de esta convocatoria es:
Sitio web: http://www.conacyt.gob.mx/Fondos/Institucional/RedesTematicas/Index_RedesTematicas.html
La convocatoria esta dirigida a investigadores, tecnólogos, empresarios y demás personas interesadas en participar en alguna de las Redes Temáticas CONACYT de Investigación. Estará vigente hasta el 18 de septiembre de 2009.
El objeto de esta convocatoria es:
"Promover la incorporación de investigadores y personas interesadas en la conformación de las Redes Temáticas y fortalecer la construcción y desarrollo de las mismas, entre los grupos de investigación científica y tecnológica en las instituciones de educación superior, en los centros de investigación, empresas y/o laboratorios nacionales de todo el país, en áreas estratégicas para alcanzar soluciones articuladas y estructuradas que contribuyan al desarrollo nacional y al bienestar de su población en las áreas temáticas que el Consejo Asesor de Redes Temáticas ha aprobado."Relevante para nuestra comunidad es el párrafo tres de la Convocatoria:
"Código de Barras de la Vida: Biología Molecular y Sistemática; Generación de códigos de barras de ADN para las especies de plantas, animales y hongos; Códigos de barras de las colecciones biológicas y herbarios; Aplicaciones de los códigos de barras para el reconocimiento de especies que sirven como marcadores biológicos, parásiots y plagas; Aplicación de los códigos de barras en especies de interés económico y en conservación de la biodiversidad; Reconocimiento de los ámbitos de distribución de las especies utilizando los códigos de barras; Códigos de barras para reconocer la ontogenia de especies con metamorfosis; Uso de los códigos de barras para la explotación sustentable de especies; etc."El financiamiento ofrecido incluye:
a) Estancias académicas para investigadores y estudiantes incluidas en el Programa General de Trabajo establecido y justificado-----------------------
b) Gastos para el desarrollo de trabajos de campo, para el diagnóstico del tema.
c) Gastos de organización de eventos académicos sobre el tema y que contemplen la formación de Recursos Humanos (Simposio, escuelas, talleres etc.).
d) Gastos de los investigadores (viáticos y pasajes).
e) Becarios.
f) Gastos relacionados con las reuniones de los miembros de la Red Temática.
g) Pago de servicios profesionales externos o de apoyo consultivo.
h) Ediciones e impresiones de libros para divulgación de los resultados, relacionados a la línea temática de la Red Temática.
i) Operación y mantenimiento de un portal y páginas informativas incluyendo las bases de datos.
j) Trámites para el registro de la propiedad intelectual a nivel nacional y/o internacional, derivados del proyecto de la Red Temática. Los costos de las patentes y su mantenimiento deberán ser cubiertos por la institución que tenga la titularidad de esos derechos.
k) En casos excepcionales se dará a poyo para adquisición de infraestructura
Sitio web: http://www.conacyt.gob.mx/Fondos/Institucional/RedesTematicas/Index_RedesTematicas.html
Bioinformatics: Computer Methods in Molecular Biology
Practical Course
21-26 June, 2010.
“Bioinformatics: Computer Methods in Molecular Biology”
Trieste, Italy
Organiser: Sándor Pongor (ICGEB, Trieste, Italy)
Topics
A limited number of grants, covering accommodation (twin share) and local hospitality for the duration of the Course, are available to nationals of ICGEB Member States*.
Travel is NOT funded. Please note that there is no registration fee.
Closing date
for applications 28 January 2010
Contact Submit your participation form, curriculum vitae in English and a short list of publications (if any) to:
ICGEB - Conferences and Meetings, Padriciano 99, I-34149 Trieste, Italy.
Tel: +39-040-3757333; Fax: +39-040-226555; E-mail: courses@icgeb.org
website: http://www.icgeb.org/meetings-2010.html
*
*ICGEB Member States (@ 5th January 2009 – refer to URL http://www.icgeb.org/member-states.html for updates)
Afghanistan, Algeria, Argentina, Bangladesh, Bhutan, Bosnia and Herzegovina, Brazil, Bulgaria, Burundi, Cameroon, Chile, China, Colombia, Costa Rica, Côte d’Ivoire, Croatia, Cuba, Ecuador, Egypt, FYR Macedonia, Hungary, India, Iran, Iraq, Italy, Jordan, Kuwait, Kyrgyzstan, Liberia, Lybian Arab Jamahiriya, Malaysia, Mauritius, Mexico, Morocco, Nigeria, Pakistan, Panama, Peru, Poland, Qatar, Romania, Russia, Saudi Arabia, Senegal, Serbia, Slovakia, Slovenia, South Africa, Sri Lanka, Sudan, Syria, Tanzania, Trinidad and
Tobago, Tunisia, Turkey, United Arab Emirates, Uruguay, Venezuela, Viet Nam
21-26 June, 2010.
“Bioinformatics: Computer Methods in Molecular Biology”
Trieste, Italy
Organiser: Sándor Pongor (ICGEB, Trieste, Italy)
Topics
- Genome and proteome databases
- Analysis of protein and DNA sequences
- Similarity searching, alignments
- Sequence phylogeny
- WWW-based services
- Genome projects, functional genomics
A limited number of grants, covering accommodation (twin share) and local hospitality for the duration of the Course, are available to nationals of ICGEB Member States*.
Travel is NOT funded. Please note that there is no registration fee.
Closing date
for applications 28 January 2010
Contact Submit your participation form, curriculum vitae in English and a short list of publications (if any) to:
ICGEB - Conferences and Meetings, Padriciano 99, I-34149 Trieste, Italy.
Tel: +39-040-3757333; Fax: +39-040-226555; E-mail: courses@icgeb.org
website: http://www.icgeb.org/meetings-2010.html
*
*ICGEB Member States (@ 5th January 2009 – refer to URL http://www.icgeb.org/member-states.html for updates)
Afghanistan, Algeria, Argentina, Bangladesh, Bhutan, Bosnia and Herzegovina, Brazil, Bulgaria, Burundi, Cameroon, Chile, China, Colombia, Costa Rica, Côte d’Ivoire, Croatia, Cuba, Ecuador, Egypt, FYR Macedonia, Hungary, India, Iran, Iraq, Italy, Jordan, Kuwait, Kyrgyzstan, Liberia, Lybian Arab Jamahiriya, Malaysia, Mauritius, Mexico, Morocco, Nigeria, Pakistan, Panama, Peru, Poland, Qatar, Romania, Russia, Saudi Arabia, Senegal, Serbia, Slovakia, Slovenia, South Africa, Sri Lanka, Sudan, Syria, Tanzania, Trinidad and
Tobago, Tunisia, Turkey, United Arab Emirates, Uruguay, Venezuela, Viet Nam
20 de agosto de 2009
Phylogeny and diversity of land plants and fungi
Course objective
The goal is to gain basic knowledge of recently established phylogenetic lineages in the land plants and fungi and based thereon of essential understanding of modern insights in the morphological characterization, the origin and evolutionary development of the main clades and the angiosperm pollen.
The following items will be discussed and demonstrated:
- – Changing views on phylogenetic relations within the land plants and fungi
- – Overview of morphological and taxonomic diversity and morphological characterization of the presently accepted main clades
- – Present insights in and disputes over key innovations, and functional characterizations (adaptations)
- – State of the art overview of the various uses by mankind of the taxa and of the applications of these fields of knowledge
Remarks
Language: Dutch (English in case foreign MSc-students participate).
Coordinator
Dr.M.Roos,
Time table
Sept. 22-26: Mosses and Ferns
Sept. 29 – Oct. 2: Angiosperm pollen
Oct. 6-10: Fungi
19 de agosto de 2009
4th Dresden Meeting on Insect Phylogeny
4th Dresden Meeting on Insect Phylogeny,
September 18 - 20, 2009
The Dresden Meetings on Insect Phylogeny are dedicated to a broad variety of topics concerning phylogeny reconstruction in Insecta; this includes both the interordinal and intraordinal levels, both morphological and molecular work, and both extant and fossil taxa, as well as occasional methodological contributions. The 4th Dresden Meeting on Insect Phylogeny (2009) will have a strong focus on key taxa and key characters insects; this will also include some presentations on fossil key taxa. The about 30 oral contributions, all in English, will be presented by invited high-profile specialists.
September 18 - 20, 2009
The Dresden Meetings on Insect Phylogeny are dedicated to a broad variety of topics concerning phylogeny reconstruction in Insecta; this includes both the interordinal and intraordinal levels, both morphological and molecular work, and both extant and fossil taxa, as well as occasional methodological contributions. The 4th Dresden Meeting on Insect Phylogeny (2009) will have a strong focus on key taxa and key characters insects; this will also include some presentations on fossil key taxa. The about 30 oral contributions, all in English, will be presented by invited high-profile specialists.
Organized by
Klaus-Dieter Klass (Museum für Tierkunde Dresden)
Niels Peder Kristensen (Zoological Museum Copenhagen)Contact: insectphyl2009 (at) snsd.de - Please copy and paste this addess, replace "(at)" by "@"
18 de agosto de 2009
Molecular evolution and phylogenetics
Primer on Molecular Evolution and Phylogenetics
http://www.biomed.cam.ac.uk/gradschool/current/courses/phylogeny.htmlDr Hernan Javier Dopazo and Leonardo Daniel Arbiza Brustin
Pharmacogenomics & Comparative Genomics Unit, Bioinformatics Department, Centro de Investigación Príncipe Felipe, Valencia, Spain
Dates: 5th-7th October 2009
Time: 9.30am-5pm
Venue: Genetics Room G12 (map)
Maximum number: 20
Codes: BM02
Credits: 6
Bookings are made via the online booking form.
6 de agosto de 2009
Chris Humphries – Natural History Museum, London (1947—2009)
It is our sad task to record the death of Professor Chris Humphries,
merit researcher in the Botany Department until his retirement in 2007,
on Friday 31st July. Chris was a leading figure in the cladistic
revolution in systematics and biogeography. Without his tireless
efforts, systematic botany - perhaps systematic biology - would be a
very different beast.
Chris joined the Botany Department in 1972 as an assistant curator, a
nearly-finished PhD student, coming directly from Vernon Heywood's
Botany Department in Reading University. With the exception of three
sabbaticals - two of them at the University of Melbourne (1979-80, 1986)
and a six month stay as a fellow at the Wissenschaftskolleg zu Berlin
(Institute for Advanced Study, Berlin) in 1994 - Chris spent his entire
career in the Museum.
Chris's early botanical research was on Asteraceae (daisies) and
Macaronesia but during the 1970s and 1980s most of his intellectual
effort went into developing, exploring and promoting cladistic
systematics and cladistic biogeography. These efforts yielded two much
acclaimed books: Cladistic Biogeography (1986) (with Lynne Parenti, of
the Smithsonian; a revised 2nd edition appeared in 1999) for
biogeography, and Cladistics: A practical course in systematics (1992)
(with staff of the Natural History Museum; a revised 2nd edition
appeared in 1998 as Cladistics: the theory and practice of parsimony
analysis). Both books became standard works in their field.
Chris's interest in art made him the perfect choice for organising and
annotating the first complete full-colour edition of Banks' Florilegium,
published between 1980 and 1990. The project marked the beginning of
Chris's love affair with Australia and her flora, the enigmatic southern
beeches and the problems of explaining organism distribution in the
Southern Hemisphere. The Florilegium consists of over 700 botanical line
engravings made from Sydney Parkinson's watercolours, recording the
plants collected by Joseph Banks and Daniel Carl Solander on Captain
James Cook's first voyage around the world (1768-1771).
After 1990, Chris (with Dick Vane-Wright and Paul Williams, both of the
Entomology Department) put biogeographical matters to more practical
use, addressing what they called the "Agony of Choice" - the
conservationists' dilemma - with their 'WorldMap' approach to
conservation biology, combining taxonomic, ecological and biogeographic
information into one system. After a decade of collaboration with many
different and diverse groups of researchers working on many different
organisms, Chris returned to more fundamental matters in biogeographical
investigation and to the distribution of plants on Macaronesia, the
islands he began with as a student.
During his career, Chris received many honours; the Linnean Society's
Bicentenary Medal in 1980 and their Gold Medal in 2001; he was also an
Honorary Fellow of the American Association for the Advancement of
Science. He was President of the Systematics Association (2001-2003) as
well as its Treasurer (1996-9), and President of the Willi Hennig
Society (1989-1991), being elected a Fellow honoris causa in 1998. Chris
was also Vice-President and Botanical Secretary of the Linnean Society
(1994-1998).
In 2008, a three-day Meeting was held in his honour at the Linnean
Society; a Festschrift will be published in early 2010.
David M. Williams & Charlie Jarvis
Botany Department
The Natural History Museum
Cromwell Road
London SW7 5BD
UK
_______________________________________________
Taxacom Mailing List
merit researcher in the Botany Department until his retirement in 2007,
on Friday 31st July. Chris was a leading figure in the cladistic
revolution in systematics and biogeography. Without his tireless
efforts, systematic botany - perhaps systematic biology - would be a
very different beast.
Chris joined the Botany Department in 1972 as an assistant curator, a
nearly-finished PhD student, coming directly from Vernon Heywood's
Botany Department in Reading University. With the exception of three
sabbaticals - two of them at the University of Melbourne (1979-80, 1986)
and a six month stay as a fellow at the Wissenschaftskolleg zu Berlin
(Institute for Advanced Study, Berlin) in 1994 - Chris spent his entire
career in the Museum.
Chris's early botanical research was on Asteraceae (daisies) and
Macaronesia but during the 1970s and 1980s most of his intellectual
effort went into developing, exploring and promoting cladistic
systematics and cladistic biogeography. These efforts yielded two much
acclaimed books: Cladistic Biogeography (1986) (with Lynne Parenti, of
the Smithsonian; a revised 2nd edition appeared in 1999) for
biogeography, and Cladistics: A practical course in systematics (1992)
(with staff of the Natural History Museum; a revised 2nd edition
appeared in 1998 as Cladistics: the theory and practice of parsimony
analysis). Both books became standard works in their field.
Chris's interest in art made him the perfect choice for organising and
annotating the first complete full-colour edition of Banks' Florilegium,
published between 1980 and 1990. The project marked the beginning of
Chris's love affair with Australia and her flora, the enigmatic southern
beeches and the problems of explaining organism distribution in the
Southern Hemisphere. The Florilegium consists of over 700 botanical line
engravings made from Sydney Parkinson's watercolours, recording the
plants collected by Joseph Banks and Daniel Carl Solander on Captain
James Cook's first voyage around the world (1768-1771).
After 1990, Chris (with Dick Vane-Wright and Paul Williams, both of the
Entomology Department) put biogeographical matters to more practical
use, addressing what they called the "Agony of Choice" - the
conservationists' dilemma - with their 'WorldMap' approach to
conservation biology, combining taxonomic, ecological and biogeographic
information into one system. After a decade of collaboration with many
different and diverse groups of researchers working on many different
organisms, Chris returned to more fundamental matters in biogeographical
investigation and to the distribution of plants on Macaronesia, the
islands he began with as a student.
During his career, Chris received many honours; the Linnean Society's
Bicentenary Medal in 1980 and their Gold Medal in 2001; he was also an
Honorary Fellow of the American Association for the Advancement of
Science. He was President of the Systematics Association (2001-2003) as
well as its Treasurer (1996-9), and President of the Willi Hennig
Society (1989-1991), being elected a Fellow honoris causa in 1998. Chris
was also Vice-President and Botanical Secretary of the Linnean Society
(1994-1998).
In 2008, a three-day Meeting was held in his honour at the Linnean
Society; a Festschrift will be published in early 2010.
David M. Williams & Charlie Jarvis
Botany Department
The Natural History Museum
Cromwell Road
London SW7 5BD
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4 de agosto de 2009
Enlace a clases del OSU Cladistics Workshop
OSU Cladistics Workshop
Concluyó el taller de métodos filogenéticos de la Willi Hennig Society y en el sitio web del curso se ha publicado en linea la fotografía de los participantes.
De interes para los lectores de este blog son los enlaces a documentos de algunas de las clases. Muy buenas presentaciones en PDF! De la presentación de Giribet sobre "Homology" tome esta figura:
Visiten el sitio!
http://www.biosci.ohio-state.edu/~jfreuden/cladwork/main.htm
Concluyó el taller de métodos filogenéticos de la Willi Hennig Society y en el sitio web del curso se ha publicado en linea la fotografía de los participantes.
De interes para los lectores de este blog son los enlaces a documentos de algunas de las clases. Muy buenas presentaciones en PDF! De la presentación de Giribet sobre "Homology" tome esta figura:
Visiten el sitio!
http://www.biosci.ohio-state.edu/~jfreuden/cladwork/main.htm
Workshop on Molecular Evolution, Europe 2010
Se ha anunciado el próximo "Workshop on Molecular Evolution, Europe 2010"
Lugar: Cesky Krumlov, Czech Republic
Fecha: 10 - 22 January 2010, individual research session 22 - 29 January 2010
Application Deadline: 1 October 2009
Sitio web: http://workshop.molecularevolution.org/
Organizadores: Michael P. Cummings and Scott A. Handley, Co-Directors
Naiara Rodriquez-Ezpeleta, Associate Director.
Lugar: Cesky Krumlov, Czech Republic
Fecha: 10 - 22 January 2010, individual research session 22 - 29 January 2010
Application Deadline: 1 October 2009
Sitio web: http://workshop.molecularevolution.org/
Organizadores: Michael P. Cummings and Scott A. Handley, Co-Directors
Naiara Rodriquez-Ezpeleta, Associate Director.
"Topics to be covered include:
- Databases and sequence matching: database searching: protein sequence versus protein structure; homology; mathematical, statistical, and theoretical aspects of sequence database searches
- Phylogenetic analysis: theoretical, mathematical and statistical bases; sampling properties of sequence data; Bayesian analysis; hypothesis testing
- Maximum likelihood theory and practice in phylogenetics and population genetics: coalescent theory; maximum likelihood estimation of population genetic parameters
- Molecular evolution integrated at organism and higher levels: population biology; biogeography; ecology; systematics and conservation; population genetics
- Molecular evolution and development: gene duplication and divergence; gene family organization; coordinated expression in evolution
- Comparative genomics: genome content; genome structure; genome evolution
- Molecular evolution of recently diverged species
31 de julio de 2009
Curso de Posgrado: Análisis Cladísticos y su Aplicación en Paleontología
ASOCIACIÓN PALEONTOLÓGICA ARGENTINA: Cladística y Paleontología
Curso de Postgrado de la APA
Análisis Cladísticos y su Aplicación en Paleontología
Docente: Dr. Diego Pol (CONICET-Museo Paleontológico Egidio Feruglio, Trelew)
Duración: 5 días (40 horas)
Fecha: del 13/7/09 al 17/7/09
Lugar: Museo Argentino de Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” Av. Angel Gallardo 470, C1405DJR Ciudad Autónoma de Buenos Aires, TE 4982-6670
Mas informacion: Aqui>
Curso de Postgrado de la APA
Análisis Cladísticos y su Aplicación en Paleontología
Docente: Dr. Diego Pol (CONICET-Museo Paleontológico Egidio Feruglio, Trelew)
Duración: 5 días (40 horas)
Fecha: del 13/7/09 al 17/7/09
Lugar: Museo Argentino de Ciencias Naturales “Bernardino Rivadavia” Av. Angel Gallardo 470, C1405DJR Ciudad Autónoma de Buenos Aires, TE 4982-6670
Mas informacion: Aqui>
30 de julio de 2009
Linux para filogenética: PhyLIS
Mac OS le parece caro? Windows .... caro y muy problemático? Bueno pues ahora sera más fácil adoptar Linux como sistema operativo en su investigación filogenética. No solo Linux es gratis sino mucho mas robusto y estable (al menos comparado con Windows), por lo cual en los últimos años este sistema operativo ha estado ganando popularidad, especialmente entre la comunidad científica.
Ahora el nivel de dificultad para instalar Linux y configurar la numerosa colección de programas ya disponibles para análisis filogenéticos ha disminuido significativamente con la disponibilidad de PhyLIS o "Linux Filogenético para Informática y Sistemática" (Phylogenetic Linux for Informatics and Systematics).
PhyLIS incluye dos componentes: el sistema operativo Linux y una colección básica de programas filogenéticos (los que han sido gratis). La configuración tanto del sistema operativo como de los programas incluidos ya esta lista para solo instalar y trabajar.
" ..... [PhyLIS] comes with most commonly used
phylogenetic software pre-compiled, installed,
and configured, which allows this software to
be executed by simply typing the appropriate
command (Table 1). PhyLIS also contains popular
scripting languages (and appropriate phyloinformatic
packages) including Perl (with BioPerl), Python
(with BioPython), and R (with several packages).
It implements parallel versions of several particularly
processor-intensive programs using MPI (including
BEST,4 MrBayes,5 and raxML).6 PhyLIS aims to
present a complete phylogenetic workbench for all
steps of analysis from sequence data manipulation to
alignment and tree search, including visualization (for
alignments and trees), model selection, divergence
time estimation, macroevolutionary analyses and
tools for automation and batch analysis." (Thomson, 2009).
Si aun no ha entrado al mundo Linux, esta es una muy buena oportunidad.
Para bajar el archivo de instalacion ISO ingrese al sitio web de PhyLIS.
Referencia:
Thomson RC. 2009. PhyLIS: a simple Gnu/Linux distribution for phylogenetics and phyloinformatics. Evolutionary Bioinformatics. 5:91-95 (Link)
29 de julio de 2009
Curso de Introducción a la Filogenia Molecular de Microorganismos
Introducción a la Filogenia Molecular de Microorganismos
Curso a realizarse en la Facultad de Ciencias Naturales y Museo
UNLP
Argentina
Mas informacion:
http://postgrado.fcnym.unlp.edu.ar/postgrado/index_pg.html
Curso a realizarse en la Facultad de Ciencias Naturales y Museo
UNLP
Argentina
Fecha: Del 19-10-2009 hasta 24-10-2009. | Horario: L. a V.9:30 a 13-14:30 a 19:30.Sab. 9 a 13 |
| Modalidad: Presencial con evaluación final | |
| Duración: 50 horas. | |
| Cupo de teoría: 25 alumnos. | Cupo de práctica: 25 alumnos. |
| Arancel para alumnos internos: $350 | Arancel para alumnos externos: $450 |
Mas informacion:
http://postgrado.fcnym.unlp.edu.ar/postgrado/index_pg.html
13 de julio de 2009
CONGRESO DE LA SOCIEDAD MESOAMERICANA PARA LA BIOLOGÍA Y LA CONSERVACIÓN (SMBC)
Se ha distribuido la II Circular del XII Congreso Regional de la Sociedad Mesoamericana para la Biología y la Conservación que este año tendrá como sede Belize del 26 al 30 de Octubre, y cuyo lema es '' Conservation Challenges in a Rapidly Shrinking Planet''
Contenido de la Segunda Circular:
¿Qué es la SMBC?
¿Qué es el Congreso de la SMBC?
El XIII Congreso de la SMBC
Sede
Programa Académico
Actividades no-Académicas
Áreas Temáticas
Instrucciones para presentar propuestas para simposios y otros eventos especiales
Guía para presentaciones
Instrucciones para el envío de resúmenes de ponencias orales y carteles
Inscripción al Congreso
Fechas Importantes
Información de contacto del Comité Organizador
Membresía a la SMBC
Inscripción y envío de resúmenes en línea a partir del 22 de mayo.¿Qué es la SMBC?
¿Qué es el Congreso de la SMBC?
El XIII Congreso de la SMBC
Sede
Programa Académico
Actividades no-Académicas
Áreas Temáticas
Instrucciones para presentar propuestas para simposios y otros eventos especiales
Guía para presentaciones
Instrucciones para el envío de resúmenes de ponencias orales y carteles
Inscripción al Congreso
Fechas Importantes
Información de contacto del Comité Organizador
Membresía a la SMBC
www.msbcbelize2009.com
Visiten nuestro portal oficial para conocer algo de nuestra historia.
www.sociedadmesoamericana.org
Lic. Carlos Armando Mondragòn
Presidente del Capìtulo de Honduras
Sociedad Mesoamericana para la Biologìa y la Conservaciòn
(504) 33 65 85 64
6 de julio de 2009
Multiple Means Of Identifying Species Better Than DNA Barcoding Alone
Multiple Means Of Identifying Species Better Than DNA Barcoding Alone
Esta nota es respecto al articulo reciente en AJB sobre los problemas en las papas.
Muy ilustrativo de un punto de vista cada vez mas moderado y cauteloso sobre los peligros de enfatizar los códigos de barras de DNA como "la solución" a la identificación taxonómica.
Esta nota es respecto al articulo reciente en AJB sobre los problemas en las papas.
Muy ilustrativo de un punto de vista cada vez mas moderado y cauteloso sobre los peligros de enfatizar los códigos de barras de DNA como "la solución" a la identificación taxonómica.
3 de julio de 2009
Resucitará la Taxonomia en China?
China Searches for an 11th-Hour Lifesaver for a Dying Discipline -- Jiao 325 (5936): 31 -- Science
Una nota reciente en Science 3 July 2009 describe la urgente necesidad de revitalizar la investigación taxonómica en China. Como lo estan haciendo?
La receta incluye tomar una posición clave en las instituciones para el financiamiento de la ciencia. Resulta que el Presidente de NSFC, la agencia principal de financiamiento de ciencia basica en China, es Chen Yiyu, un taxonomo. La segunda parte es aventar dinero, mucho dinero $500,000 dolares a los taxónomos. Y se anuncia que para 2010 viene mas dinero!
La tercera y cuarta parte son dos argumentos cuestionables: evaluación especial para taxónomos y voltear a la taxonomía molecular. Se propone que los taxónomos deberían ser evaluados con otros estándares, en vez de contar artículos publicados en revistas de impacto y numero de citas. Le han hecho caso a Chen? Parece que si! Algunas instituciones ahora evalúan a los taxonomos por las monografias que producen, no el factor de impacto. Es la solucion?
Chen identifica el cuarto ingrediente: el futuro de la taxonomia mejorará si se incluyen métodos de la biología molecular, por ejemplo el uso de DNA barcodes para identificación de especies. Según Chen es tiempo de que la taxonomía clásica en China avance: "El periodo de los taxónomos simplemente identificando especies ya ha pasado".
Su visión contempla taxónomos trabajando junto a biólogos moleculares rejuveneciendo la taxonomía en China.
Una nota reciente en Science 3 July 2009 describe la urgente necesidad de revitalizar la investigación taxonómica en China. Como lo estan haciendo?
La receta incluye tomar una posición clave en las instituciones para el financiamiento de la ciencia. Resulta que el Presidente de NSFC, la agencia principal de financiamiento de ciencia basica en China, es Chen Yiyu, un taxonomo. La segunda parte es aventar dinero, mucho dinero $500,000 dolares a los taxónomos. Y se anuncia que para 2010 viene mas dinero!
La tercera y cuarta parte son dos argumentos cuestionables: evaluación especial para taxónomos y voltear a la taxonomía molecular. Se propone que los taxónomos deberían ser evaluados con otros estándares, en vez de contar artículos publicados en revistas de impacto y numero de citas. Le han hecho caso a Chen? Parece que si! Algunas instituciones ahora evalúan a los taxonomos por las monografias que producen, no el factor de impacto. Es la solucion?
Chen identifica el cuarto ingrediente: el futuro de la taxonomia mejorará si se incluyen métodos de la biología molecular, por ejemplo el uso de DNA barcodes para identificación de especies. Según Chen es tiempo de que la taxonomía clásica en China avance: "El periodo de los taxónomos simplemente identificando especies ya ha pasado".
Su visión contempla taxónomos trabajando junto a biólogos moleculares rejuveneciendo la taxonomía en China.
2 de julio de 2009
Treevolution: análisis visual de árboles filogenéticos
Treevolution es una herramienta para visualizar árboles filogenéticos dotada de una gran interacción. Los árboles son representados mediante dendrogramas circulares, pudiendo modificar el tamaño de los sectores o anillos.Además, podemos seleccionar familias y representarlas mediante dendrogramas lineales o generar estadísticas del árbol.
La idea subyacente es facilitar la navegación e inspección del árbol, incluso aunque este sea bastante grande.
Treevolution puede descargarse de manera gratuita aquí
Puedes citar Treevolution referenciando su artículo en Bioinformatics
Treevolution es una creación del grupo VisUsal en la Universidad de Salamanca (España)
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Treevolution is a highly interactive tool to visualize philogenetic trees. The trees are represented by means of radial dendrograms, allowing to modify the size of sectors and rings.
In addition, you can select clades and represent them as linear dendrograms, or generate tree statistics.
The main goal of this tool is to facilitate the navigation and inspection of phylogenetic trees, even if they are large.
Treevolution is available to download here
You can cite Treevolution with this paper on Bioinformatics
Treevolution is credited by the VisUsal group from the University of Salamanca (Spain)
1 de julio de 2009
Curso de Dibujo Científico Botánico. Chiapas
Curso
Dibujo Científico Botánico
Impartido por:
Elvia Esparza
21 al 26 de septiembre de 2009
CUPO LIMITADO
Costo de recuperación $ 2, 500.00
Incluye material
El lenguaje de las imágenes
Las imágenes tienen un papel muy importante para una completa comunicación. En el trabajo taxonómico y biológico en donde se estudian los caracteres de un organismo, en un contexto evolutivo; este texto descriptivo tiene un lenguaje llano con un vocabulario especializado, es donde, las imágenes complementan y dan soporte para una mejor comprensión.
Una buena ilustración puede derribar las barreras lingüísticas.
Programa del curso:
Este curso se desarrollará de manera presencial, con exposiciones y una activa participación de los estudiantes elaborando ejercicios.
La temática consiste desde el conocimiento de materiales, trazos básicos, griseados y degradados, la comprensión y manejo de la perspectiva, así como de las escalas, para abordar la técnica de entintado y la realización de ilustraciones.
Instructores:
- Elvia Esparza Alvarado, Dibujo Científico, Instituto de Biología, UNAM
- M.C. Silvia Erika Pérez Parra, Asistente
- Dr. Mario Ishiki Ishihara, Coordinador
Isabel R. Vázquez Lara
Herbario
Tel. 9676749000 Ext. 1307
Dr. Mario Ishiki Ishihara
Herbario
Tel. 9676749000 Ext. 1319
M. C. Gerardo González Figueroa
Coordinación de Educación Continua
Tel. 9676749000 Ext. 1741, 42 y 43
26 de junio de 2009
SIMPOSIO: BIODIVERSIDAD-ENFOQUES EN BIOLOGÍA MOLECULAR. Yucatan
SIMPOSIO: BIODIVERSIDAD-ENFOQUES EN BIOLOGÍA MOLECULAR19-23 de Octubre del 2009
Centro de Investigación Científica de Yucatán (CICY),
Calle 43 No 130 Col. Chuburná de Hidalgo, CP. 97200,
Mérida, Yucatán, México.
El Simposio que se propone a continuación se ofrece por primera vez para el sureste del país e incluye una diversidad de enfoques novedosos. Este Simposio permitirá difundir algunos de los conocimientos que se tienen del manejo y uso de datos moleculares en el conocimiento de la biodiversidad con énfasis en plantas vasculares, hongos y virus. Se pretende dar a conocer las áreas de investigación de los ponentes y establecer posibles proyectos de colaboración con la institución receptora ya sea tanto de estudiantes como de la comunidad científica en general.
Objetivos
- -Dar a conocer la importancia de los análisis moleculares en el estudio de la biodiversidad con énfasis en plantas vasculares, hongos y virus.
- -Presentar avances sobresalientes relacionados al manejo de secuencias de ADN que son el fundamento de los proyectos de Código de barras.
- -Establecer el interés en estudiantes e investigadores sobre el impacto del uso y manejo de los datos moleculares.
- -Establecer colaboraciones científicas con proyectos relacionados al tema del simposio con investigadores o estudiantes.
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25 de junio de 2009
Tercera Conferencia del Código de Barras de la Vida, México,
Tercera Conferencia del Código de Barras de la Vida, Ciudad de México,
7-13 noviembre 2009
Estimados miembros de la comunidad biológica:
El Consorcio para el Código de Barras de la Vida y el Instituto de Biología de la UNAM están organizando la Tercera Conferencia Internacional para el Código de Barras de la Vida, la cual se llevará a cabo en la Ciudad de México entre el 7 y el 13 de noviembre próximos.
Los invitamos a conocer la información del evento en el siguiente enlace:
www.dnabarcodes2009.org
Atentamente
Patricia Escalante
Coordinadora del Comité Local de la Conferencia
Dra. Patricia Escalante
Instituto de Biología UNAM
Ap. Post. 70-153, 04510 México DF MEXICO
Tel. (01 5255) 5622 9161 / 9171, 9150
Fax (01 5255) 5550 0164
http://mexbolibunam.wordpress.com
--------
Dear Colleagues,
The Consortium for the Barcode of Life (CBOL; www.barcoding.si.edu) and the Instituto de Biologia of the Universidad Nacional Autonoma de Mexico (UNAM) invite you to the Third International Barcode of Life Conference in Mexico City during the week of 7-12 November 2009. The main conference will be Tuesday-Thursday, 10-12 November at the Mexican Academy of Sciences, and there will be three days of pre-conference workshops and a post-conference public event at UNAM's Science Museum.
The conference website is now open at www.dnabarcodes2009.org and the online registration system will be opening next week. Calls for abstracts and applications for travel bursaries (only for participants from developing countries) will also be available through the website in the coming week.
If you would like to be placed on the distribution list to receive future notices about the conference, please send an email to message to inquiries.dnabarcodes2009@si.edu with "MAILING LIST" on the subject line. Please include your name and institutional affiliation in the body of your message.
We look forward to seeing you in Mexico City in November!
Best regards,
David
David E. Schindel, Executive Secretary
Consortium for the Barcode of Life
202/633-0812; fax 202/633-2938; portable 202/557-1149
CBOL WEBSITE: http://www.barcoding.si.edu
--
Mariana de Jesús
Instituto de Biología, UNAM
Barcode of Life/Código de Barras de la Vida
Tel. 56229150
http://mexbolibunam.wordpress.com
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